Управління Новотроянівським закладом освіти здійснює Городненська сільська рада.
Відділ освіти, молоді, спорту, культури і туризму Городненської сільської ради встановлює та затверджує штатний розклад відповідно до вимог чинного законодавства.
Безпосереднє керівництво закладом здійснює керівник закладу, директор.
Вищим органом громадського самоврядування закладу освіти є конференція, загальні збори делегатів від працівників, батьків, учнів. Конференція скликається не менше 1 разу на рік.
У період між конференціями вищим органом громадського самоврядування є Рада закладу.
Створений постійно діючий колегіальний орган - педагогічна Рада.
Колективний орган учнівського самоврядування - учнівський комітет.
Батьківський комітет - колективний орган батьківського самоврядування.