臺大昆蟲館創立於1936年,是目前國內昆蟲標本蒐藏中最具歷史意義的典藏資產之一,其中不乏百年以上之老標本與無數珍貴標本。本館標本蒐藏源自19世紀初期,除了典藏日治時代以及戰後的標本外,1980年開始,在國家科學委員會的支持下,昆蟲學系師生積極展開臺灣昆蟲相調查,使得昆蟲標本數量激增。本館蒐藏之標本超過33萬個體,依性質可概分為模式標本、研究標本、教學標本、展示標本四類。臺大昆蟲標本館豐富又珍貴的昆蟲標本蒐藏,是臺灣昆蟲學發展重要的科學與文化資產。
本館蒐藏內容主要包括蜉蝣目 (Ephemeroptera)、蜻蛉目 (Odonata)、蜚蠊目 (Blattodea)、直翅目 (Orthoptera)、革翅目 (Dermaptera)、襀翅目 (Plecoptera)、半翅目 (Hemiptera)、脈翅目 (Neuroptera)、鞘翅目 (Coleoptera)、雙翅目 (Diptera)、長翅目 (Mecoptera)、毛翅目 (Trichoptera)、鱗翅目 (Lepidoptera) 及膜翅目 (Hymenoptera) 等為主。(典藏室僅供昆蟲研究人員申請)
為推廣昆蟲學知識,讓民眾對昆蟲學之應用及學術研究有進一步認識,本館於2008年加入博物館群,設置特展區。展示主題包括昆蟲館紀事、世界昆蟲區、寬尾鳳蝶的發現、保育類昆蟲區、民俗昆蟲及文化區、標本教育區、採集教育區、昆蟲生態區、教師主題區及多媒體互動區等。