PF29-利用葉綠體插入與缺失序列鑑定台灣肖楠與中國翠柏之研究

卿巧菱 1、吳家禎 1 *、許俊凱 2

¹ 農委會林業試驗所育林組。100051 台北市中正區南海路53號。

² 農委會林業試驗所蓮華池研究中心。555002 南投縣魚池鄉五城村華龍巷 43 號。

^* 通訊作者：chiachen@tfri.gov.tw

台灣肖楠（Calocedrus formosana）是柏科（Cupressaceae）肖楠屬的常綠喬木，為台灣特有種，樹型優美，因此常用於景觀或造林，且其木材質地優良、氣味芬芳，具有高經濟價值。中國翠柏（Calocedrus macrolepis）同為柏科的常綠喬木，外觀上與台灣肖楠非常相似，通常以葉背呈現明顯白色的特徵與肖楠區別，但在幼苗時期兩者難以完全以外觀辨別。


過去台灣肖楠造林苗木需求量大，苗商供應不及，中國翠柏被從中國、越南等地區進口冒充台灣肖楠，導致造林時台灣肖楠人工林內混入翠柏，恐造成本地生態衝擊或台灣肖楠混摻問題。本研究希望找出可用於快速區分台灣肖楠和中國翠柏葉綠體基因序列的插入/缺失片段（insertion/deletion, InDel），以利苗木鑑別工作。


本實驗材料取自台灣南投縣魚池鄉金龍山地區之翠柏以及各地台灣肖楠作為樣本萃取 DNA。再參考NCBI（National Center for Biotechnology Information）資料，取得台灣肖楠（KX832620.1）及中國翠柏（KX832621.1）的全葉綠體基因組，透過生物資訊軟體比對後，預測InDel序列位置，並以Primer 3設計出適合的引子對，最終再以聚合酶連鎖反應（Polymerase chain reaction, PCR）測試並透過瓊脂凝膠電泳紀錄基因型結果，驗證出10 bp以上InDel共10組，且在所有樣本中皆具有多型性及再現性。未來在苗木鑑別實務中，這10組InDel可做為輔助鑑定之用，長遠更可以做為台灣肖楠遺傳研究、演化與選拔培育的分子工具。