PF10-網絡分析參與臺灣杉ferruginol生合成的候選細胞色素P450

洪崇耀¹、馬莉婷¹、曲芳華^{1, *}

¹ 國立臺灣大學森林環境暨資源學系。106216 臺北市羅斯福路四段1號。

^* 通訊作者：fhchu@ntu.edu.tw

臺灣杉 (Taiwania cryptomeroides) 為一冰河時期的孑遺物種，分布於臺灣中海拔地區。此樹種為臺灣貴重針葉五木之一，其中ferruginol為一重要的雙萜化合物，其已被證實具有多種生物活性，此類化合物推測其生合成途徑經由兩個萜類合成酶，TcCPS4及TcKSL3生合成levopimaradiene，再經由自發性氧化和細胞色素P450反應生成ferruginol。已知ferruginol的含量及TcCPS4的表現量會受甲基茉莉酸 (MeJA) 誘導，推測TcCPS4與ferruginol生合成的P450表現量會有正相關，並有共通的轉錄因子 (Transcription factor, TF) 調控，因此我們希望能初步篩選與TcCPS4表現量正相關P450，再透過TFs進一步篩選生合成ferruginol的P450。實驗方法則是以臺灣杉葉部轉錄體資料庫設計微陣列探針，並將三年生的臺灣杉苗經MeJA處理後，在不同時段取樣進行RNA萃取，並將探針與RNA進行雜合，得到的資料依照中位數標準化，並將其數值透過Contig view計算，再由Cytoscape軟體繪製出網絡分析 (Network)。在網絡分析中，我們可以找到數個與TcCPS4表現量正相關的P450，其中有八個P450與TcCPS4相關的TFs有關，且其中四個屬於已知參與萜類氧化反應的家族，為潛在的ferruginol生合成基因。於此實驗中，我們透過微陣列分析及網絡分析得到潛在ferruginol生合成P450，未來期望透過基因選殖及異源表現這些候選P450以鑑定功能。