AU検定を応用して系統樹の二分岐を評価するソフトウェアです。
論文：Bamba K, Harada R, Inagaki Y. 2024 AUTOEB: A software for systematically evaluating bipartitions in a phylogenetic tree employing an approximately unbiased test. IPSJ Transactions on Bioinformatics 17:72-82. (doi: 10.2197/ipsjtio.17.72)
機械学習によってsplice-sitesを学習・推測するソフトウェアです。
論文：Harada R, Kume K, Horie K, Nakayama T, Inagaki Y, Amagasa T. 2023 AtLASS: A scheme for end-to-end prediction of splice sites using attention-based bi-LSTM. IPSJ Transactions on Bioinformatics 16:20-27. (doi: 10.2197/ipsjtbio.16.20)