1.Dinas Pendidikan dan Kebudayaan

2. Dinas Kesehatan

3. Dinas Pekerjaan Umum dan Penataan Ruang

4. Dinas Perkimtan

5. Badan Penanggulangan Bencana Daerah

6. Satpol PP

7. Dinas Sosial Daerah

8. Dinas Tenaga Kerja Daerah

9. Dinas Pemberdayaan Perempuan dan Perlindungan Anak

10. Dinas Ketahanan Pangan Daerah

11. Dinas Linkungan Hidup Daerah

12.Dinas Kependudukan dan Pencatatan Sipil Daerah

13. Dinas Pemberdayaan Masyarakat dan Desa Daerah 

14. Dinas Pengendalian Penduduk dan Keluarga Berencana Daerah 

15. Dinas Perhubungan Daerah 

16. Dinas Komunikasi dan Informatika Daerah 

17. Dinas Koperasi, Usaha Kecil dan Menengah Daerah 

18. Dinas Penanaman Modal dan Pelayanan Terpadu Satu Pintu Daerah 

19. Dinas Pemuda dan Olahraga Daerah 

20. Dinas Perpustakaan dan Kearsipan Daerah 

21. Dinas Perikanan Daerah 

22. Dinas Pariwisata Daerah 

23. Dinas Pertanian Daerah 

24. Dinas Perindustrian dan Perdagangan Daerah 

25. Sekretariat Daerah 

26. Sekretariat DPRD 

27. Badan Perencanaan serta Penelitian dan Pengembangan Daerah 

28. Badan Pengelolaan Keuangan dan Pendapatan Daerah 

29. Badan Kepegawaian dan Pengembangan Sumber Daya Manusia Daerah 

30. Badan Pengelola Perbatasan Daerah 

31. Inspektorat Daerah 

32. Kecamatan Tabukan Utara 

33. Kecamatan Tabukan Tengah 

34. Kecamatan Tamako 

35. Kecamatan Manganitu 

36. Kecamatan Tahuna 

37. Kecamatan Manganitu Selatan 

38. Kecamatan Tabukan Selatan 

39. Kecamatan Kendahe 

40. Kecamatan Tatoareng 

41. Kecamatan Tabukan Selatan Tengah 

42. Kecamatan Nusa Tabukan 

43. Kecamatan Tahuna Timur 

44. Kecamatan Tahuna Barat 

45. Kecamatan Tabukan Selatan Tenggara 

46. Kecamatan Marore 

Badan Kesatuan Bangsa dan Politik Daerah