Avogadro adalah aplikasi perangkat lunak open-source yang dirancang untuk mendukung pembuatan, pengeditan, dan visualisasi molekul dalam tiga dimensi. Aplikasi ini terutama digunakan oleh ilmuwan, mahasiswa, dan pengajar kimia untuk memodelkan struktur kimia, melakukan perhitungan kimia kuantum, serta memvisualisasikan dinamika molekul dan ikatan kimia secara grafis. 

ChemDraw adalah aplikasi perangkat lunak yang digunakan untuk menggambar struktur kimia dan merancang diagram reaksi dengan presisi tinggi. Dikembangkan oleh PerkinElmer, ChemDraw banyak digunakan di bidang kimia, biokimia, farmasi, dan ilmu material untuk membuat representasi visual dari molekul, reaksi kimia, dan mekanisme reaksi. Aplikasi ini memudahkan ilmuwan, mahasiswa, dan profesional dalam membuat diagram kimia yang akurat untuk publikasi, presentasi, dan laporan penelitian. 

PhET Colorado adalah simulasi online gratis yang dibuat oleh Universitas Colorado Boulder untuk membantu pembelajaran fisika, kimia, biologi, kebumian, dan matematika.