ห้องปฏิบัติการวิจัยกลาง คณะวิทยาศาสตร์การแพทย์  มหาวิทยาลัยพะเยา  ก่อตั้งขึ้นอย่างเป็นทางการ  เมื่อปี 2562  มุ่งเน้นการให้บริการเครื่องมือวิทยาศาสตร์เพื่อการวิจัย ที่บูรณาการศาสตร์ทางด้านกายวิภาคศาสตร์ สรีรวิทยา จุลชีววิทยาและปรสิตวิทยา ชีวเคมี โภชนาการ ให้แก่นิสิตและนักวิจัยภายในองค์กร ภายใต้การกำกับดูแลโดย รองคณบดีฝ่ายวิจัยและนวัตกรรม ต่อมาในปี 2566 ได้มีการแบ่งโครงสร้างการบริหารงานในส่วนวิจัยและนวัตกรรมเป็น 4 งาน ได้แก่ 

1. งานบริหารงานวิจัย นวัตกรรมและทรัพสินทางปัญญา

2.งานบริหารจัดการห้องปฏิบัติการวิจัยกลาง

3.งานส่งเสริมและสนับสนุนการบริการวิชาการ นวัตกรรมชุมชน การถ่ายทอดเทคโนโลยีและการพัฒนางานประจำสู่งานวิจัย

4.งานเผยแพร่ผลงานวิจัยและนวัตกรรมของนักวิจัยและนิสิต