研究室の沿革 [Laboratory History]
研究室の沿革 [Laboratory History]
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岡山大学薬学部は1969 年に医学部薬学科として発足し、1976 年に薬学部として独立しました。当研究室は、1977年に薬品物理化学研究室として発足し、藤田勇三郎 教授（～1991 年度）、玉懸敬悦 教授（～2005年度）、勝孝 教授（～2013年度）がご担当されてきました。2014年度からは私（須藤雄気）が担当しております。一貫して薬学における物理化学の視点からの教育・研究を行っています。
Faculty of Pharmaceutical Sciences was established in 1969 as the Department of Pharmaceutical Sciences, Faculty of Medicine. Subsequently, in 1976, it was established as an independent department. A laboratory regarding physical chemistry was established in 1977 and has been led by Prof. Fujita (~1991), Prof. Tamakake (~2005), and Prof. Katsu (~2013). Since 2014, Sudo has been in charge. We consistently conduct education and research from the perspective of physical chemistry in pharmaceutical sciences.
研究室側から見た薬学部の中庭
教授 [Professor]
須藤 雄気 [Yuki Sudo] 博士（薬学）（2005年 北海道大学）
【E-mail】sudo[a]okayama-u.ac.jp
【Tel & Fax】086-251-7945
【Office】1号館316室
【所属学会】
生物物理学会（2000-現在）[2011-2014, 2017-2020, 2023-2024：運営委員／理事, 2019-2020：中国四国支部長，2019-2020：副会長, 2022-現在：BPPB Vice Editors-In-Chief]
薬学会（2014-現在）[物理系薬学部会] [2018年度：中国四国支部役員]
蛋白質科学会（2012-現在）
細胞を創る研究会 （2012-現在）
分子科学会（2013-現在）
The American Society for Biochemistry and Molecular Biology (2023-現在） [Editorial Board Member, The Journal of Biological Chemistry ]
経歴・受賞等
経歴・受賞等
1996年：札幌市立旭丘高等学校 卒業
2000年：北海道大学薬学部 卒業（第43期）（薬剤師免許取得）
2005年：北海道大学大学院薬学研究科 修了（博士（薬学）)（指導教員：加茂直樹 教授）
[*2002-2003年：奈良先端科学技術大学院大学 特別研究学生（児嶋長次郎 助教授）]
2005年：名古屋工業大学 [博士研究員]（神取秀樹 教授）
2005-2007年：テキサス大学ヒューストン校 [ポスドク]（Prof. John Spudich）
2007-2009年：名古屋大学大学院理学研究科 [助教]
2009-2014年：名古屋大学大学院理学研究科 [准教授]（*2012-2014年：分子科学研究所 客員准教授）
2014-2014年：岡山大学学術研究院医歯薬学域（旧医歯薬学総合研究科） [教授]
（*非常勤講師）2009年, 2015年：東京工業大学、2019年：香川大学、2021年：福岡大学、2023年：青山学院大学、2025年：県立広島大学
（*兼）2008-2012年：JSTさきがけ研究員（増原宏 総括)
（*兼）2015-2020年：公益財団法人 新世代研究所 バイオ単分子研究会委員
（*兼）2019-現在：文部科学省 科学技術・学術政策研究所（NISTEP）専門調査員
（*兼）2021-2022年：(一社) 男女共同参画学協会連絡会 [副委員長（第20期）・理事]
（*兼）2022-現在：日本学術会議 生命科学ジェンダー・ダイバーシティ分科会 学協会における男女共同参画のあり方に関する検討小委員会 [幹事]
（*兼）2022-現在：Biophysics and Physicobiology [Vice Editors-In-Chief]
（*兼）2022-現在：分子科学研究所 [共同研究専門委員会委員]
（*兼）2023-現在：The Journal of Biological Chemistry [Editorial Board Member]
【受賞】
2010年 光科学技術研究振興財団 研究者表彰
2016年 & 2024年 Award for outstanding BPPB paper
2016年 文部科学大臣表彰 若手科学者賞
2022年 リバネス研究アワード [先端研究推進部門]
2023年 岡山大学SDGs推進表彰「President Award」
2023年 内山勇三科学技術賞
講師 [Lecturer (Full time)] *JST・さきがけ研究員（兼任）
小島 慧一 [Keiichi Kojima] 博士（理学）（2016年 京都大学）
【E-mail】keiichikojima[a]okayama-u.ac.jp
【Tel & Fax】086-251-7980
【Office】1号館315室
【所属学会】生物物理学会, 薬学会, 動物学会
技術補佐員 [Technical Assistant]
佐々木 さおり [Saori Sasaki] 【Tel】086-251-7945【Office】1号館316室
垣内 聡子 [Satoko Kakiuchi]【Tel】086-251-7980【Office】1号館315室
<大学院生 (Graduate Student)>
<大学院生 (Graduate Student)>
Nakao S, *Kojima K, & *Sudo Y. “Phototriggered apoptotic cell death (PTA) using the light-driven outward proton pump rhodopsin archaerhodopsin‐3“ (2022) J. Am. Chem. Soc. 144, 3771-3775.【link】【プレスリリース：岡山大学, JST】【山陽新聞】【日経新聞】【Chem-Station】【サイエンスポータル】
Nakao S, Kojima K, *Sudo Y. “Microbial rhodopsins as multi-functional photoreactivemembrane proteins for optogenetics” (2021) Biol. Pharm. Bull. 44, 1357-1363. 【link】＊Featured Article
*#Kojima K, #Kawanishi S, Nishimura Y, Hasegawa M, Nakao S, Nagata Y, YoshizawaS & *Sudo Y. “A blue-shifted anion channelrhodopsin from the Colpodellida alga Vitrella brassicaformis“ (2023) Sci. Rep. 13, 6974.【link】
#Kikuchi M, #Kojima K, Nakao S, Yoshizawa S, Kawanishi S, ShibukawaA, Kikukawa T, & *Sudo Y. “Functional expression of the eukaryotic proton pump rhodopsin OmR2 in Escherichia coli and its photochemical characterization” (2021) Sci. Rep. 20, 14765. 【link】
須藤 雄気, 小島 慧一 & 中尾新 “光により細胞死を制御する方法” (2020) 特願2020-196718【令和2年11月27日】, PCT/JP2021/043071.
M2（創） 橋本 茉波 (2022/12~) ・9期
M2（創） 橋本 茉波 (2022/12~) ・9期
Nakamura T, Shinozaki Y, Otomo A, Urui T, Mizuno M, Abe-Yoshizumi R, Hashimoto M, Kojima K, Sudo Y, Kandori H, & *Mizutani Y. “Unusual vibrational coupling of the schiff base in the retinal chromophore of sodium ion-pumping rhodopsins“ (2024) J. Phys. Chem. B 128, 7813-7821.【link】
M1（創） 井口 未唯 (2023/12~) ・10期
M1（創） 井口 未唯 (2023/12~) ・10期
M1（創） 高橋 空翔 (2023/12~) ・10期
M1（創） 高橋 空翔 (2023/12~) ・10期
Nagata Y, *Miyamoto N, Sato K, Nishimura Y, Tanioka Y, Yamanaka Y, Yoshizawa S, Takahashi K, Obayashi K, Tsukamoto H, Takai K, Ohuchi H, Yamashita T, Sudo Y. & *Kojima K. "A repertoire of visible light-sensitive opsins in the deep-sea hydrothermal vent shrimp Rimicaris hybisae" (2025) J. Biol. Chem., 301, 110291.
M1（創） 吉田 尚生 (2023/12~) ・10期
M1（創） 吉田 尚生 (2023/12~) ・10期
<学部生 (Undergraduate Student)>
<学部生 (Undergraduate Student)>
B4（薬） 原田 亮子 (2023/12~) ・10期
B4（薬） 原田 亮子 (2023/12~) ・10期
B4（薬） 岡 ひなた (2024/11~) ・11期
B4（薬） 岡 ひなた (2024/11~) ・11期
B4（創） 藤岡 賢悟 (2024/11~) ・11期
B4（創） 藤岡 賢悟 (2024/11~) ・11期
B4（創） 小川 さくら (2024/11~) ・11期
B4（創） 小川 さくら (2024/11~) ・11期
B4（創）貞保 大輝 (2024/11~) ・11期
B4（創）貞保 大輝 (2024/11~) ・11期
B4（創） 山田 華香 (2024/11~) ・11期
B4（創） 山田 華香 (2024/11~) ・11期
B4（創） 橋弥 奈那 (2024/11~) ・11期
B4（創） 橋弥 奈那 (2024/11~) ・11期
Alumni
～2024年度（R6）～
～2024年度（R6）～
学士（薬）：谷岡 勇輝 (2021/12~) ・8期 卒業研究発表会優秀賞
学士（薬）：谷岡 勇輝 (2021/12~) ・8期 卒業研究発表会優秀賞
Nagata Y, *Miyamoto N, Sato K, Nishimura Y, Tanioka Y, Yamanaka Y, Yoshizawa S, Takahashi K, Obayashi K, Tsukamoto H, Takai K, Ohuchi H, Yamashita T, Sudo Y. & *Kojima K. "A repertoire of visible light-sensitive opsins in the deep-sea hydrothermal vent shrimp Rimicaris hybisae" (2025) J. Biol. Chem., 301, 110291.
～2023年度（R5）～
～2023年度（R5）～
博士（創）：栗原 眞理恵 (2014/10~2023/9)・1期, WTT Jr. 研究員（2021, 2023年度）, 薬学系学術奨励賞
博士（創）：栗原 眞理恵 (2014/10~2023/9)・1期, WTT Jr. 研究員（2021, 2023年度）, 薬学系学術奨励賞
Kurihara M, Thiel V, Takahashi H, Kojima K, Ward DM, Bryant DA, Sakai M, Yoshizawa S, & *Sudo Y. “Identification of a functionally efficient and thermally stable outward sodium-pumping rhodopsin (BeNaR) from a thermophilic bacterium“ (2023) Chem. Pharm Bull. 71, 154-164【link】
Kurihara M, & *Sudo Y. "Microbial rhodopsins: Wide distribution, rich diversity and great potential" (2015) Biophys. Physicobiol. 12, 121-129.【link】
*Reissig L, Buchanan K, Lindner T, Kurihara M, Chan P, Kibowski F, Kojima K, Dalgleish S, Awaga K, & Sudo Y. "The use of microbial rhodopsin proteins in differential photodetection" (2024) Front. Phys. 12, 1481341.
Kojima K, Yoshizawa S, Hasegawa M, Nakama M, Kurihara M, Kikukawa T, & *Sudo Y.
“Lokiarchaeota archaeon Schizorhodopsin-2 (LaSzR2) is an inward proton pump displaying a characteristic feature of acid-induced spectral blue-shift” (2020) Sci. Rep. 10, 20857.【link】Niho A, Yoshizawa S, Tsukamoto T, Kurihara M, Tahara S, Nakajima Y, Mizuno M, Kuramochi H, Tahara T, Mizutani Y, & *Sudo Y. "Demonstration of a light-driven SO42- transporter and its spectroscopic characteristics" (2017) J. Am. Chem. Soc. 139, 4376-4389.【link】
修士（創）：中西 浩太郎 (2020/12~2024/3) ・7期, JASSO奨学金半額免除
修士（創）：中西 浩太郎 (2020/12~2024/3) ・7期, JASSO奨学金半額免除
Nakanishi K, Kojima K, Sowa Y, & *Sudo Y. “Bidirectional optical control of proton motive force in Escherichia coli using microbial rhodopsins“ (2024) J. Phys. Chem. B, 128, 6509–6517.
修士（創）：長田 祐也 (2020/12~2024/3) ・7期, JASSO奨学金全額免除
修士（創）：長田 祐也 (2020/12~2024/3) ・7期, JASSO奨学金全額免除
Nagata Y, *Miyamoto N, Sato K, Nishimura Y, Tanioka Y, Yamanaka Y, Yoshizawa S, Takahashi K, Obayashi K, Tsukamoto H, Takai K, Ohuchi H, Yamashita T, Sudo Y. & *Kojima K. "A repertoire of visible light-sensitive opsins in the deep-sea hydrothermal vent shrimp Rimicaris hybisae" (2025) J. Biol. Chem., 301, 110291.
*#Kojima K, #Kawanishi S, Nishimura Y, Hasegawa M, Nakao S, Nagata Y, Yoshizawa S, & *Sudo Y. (#Equal contribution) “A blue-shifted anion channelrhodopsin from the Colpodellida alga Vitrella brassicaformis“ (2023) Sci. Rep. 13, 6974.【link】
学士（創）：木村 貴彦 (2022/12~2024/3) ・9期
学士（創）：木村 貴彦 (2022/12~2024/3) ・9期
～2022年度（R4）～
～2022年度（R4）～
修士（創）：川西 志歩 (2019/12~2023/3) ・6期, JASSO奨学金全額免除
修士（創）：川西 志歩 (2019/12~2023/3) ・6期, JASSO奨学金全額免除
Kawanishi S, *Kojima K, Shibukawa A, Sakamoto M, & *Sudo Y. “Detection of membrane potential-dependent rhodopsin fluorescence using low-intensity light emitting diode for long-term imaging“ (2023) ACS Omega 8, 4826-4834.【link】
*#Kojima K, #Kawanishi S, Nishimura Y, Hasegawa M, Nakao S, Nagata Y, YoshizawaS & *Sudo Y. (#Equal contribution) “A blue-shifted anion channelrhodopsin from the Colpodellida alga Vitrella brassicaformis“ (2023) Sci. Rep. 13, 6974.【link】
#Tsujimura M, #Kojima K, Kawanishi S, *Sudo Y. & *Ishikita H. (#Equal contribution) “Proton transfer pathway in anion channelrhodopsin-1” (2021) eLife 10, e72264.【link】
#Kikuchi M, #Kojima K, Nakao S, Yoshizawa S, Kawanishi S, ShibukawaA, Kikukawa T, & *Sudo Y. (#Equal contribution) “Functional expression of the eukaryotic proton pump rhodopsin OmR2 in Escherichia coli and its photochemical characterization” (2021) Sci. Rep. 20, 14765.【link】
*Sudo Y, Kojima K, & Kawanishi S. "Light + Rhodopsin = Medicinal products!?" (2024) Photonics Review 240206.【link】
須藤雄気, 小島慧一 & 川西志歩 “光＋ロドプシン＝くすり” (2022) フォトニクスニュース（応用物理学会誌） 7, 153-158.【link】
修士（創）：恒石 泰地 (2019/12~2023/3) ・6期, 薬学系学術奨励賞, JASSO奨学金半額免除
修士（創）：恒石 泰地 (2019/12~2023/3) ・6期, 薬学系学術奨励賞, JASSO奨学金半額免除
Tsuneishi T, Kojima K, Kubota F, Harashima H, Yamada Y, & *Sudo Y. “Development of light-induced disruptive liposomes (LiDL) as a photoswitchable carrier for intracellular substance delivery“ (2023) Chem. Commun. 59, 7591-7594.【link】【プレスリリース】【日刊工業新聞】【科学新聞】
#Tsuneishi T, #Takahashi M, #Tsujimura M, Kojima K, Ishikita H, Takauchi Y, & *Sudo Y. (#Equally contribution) “Exploring the retinal binding cavity of archaerhodopsin-3 by replacing the retinal chromophore with a dimethyl phenylated derivative” (2021) Front. Mol. Biosci. 8, 794948.【link】
学士（創）：岩田 竜馬 (2021/12~2023/3) ・8期
学士（創）：岩田 竜馬 (2021/12~2023/3) ・8期
～2021年度（R3）～
～2021年度（R3）～
学士（創）：工藤 万結 (2020/12~2022/3) ・7期
学士（創）：工藤 万結 (2020/12~2022/3) ・7期
学士（創）：田村 丞 (2020/12~2022/3) ・7期
学士（創）：田村 丞 (2020/12~2022/3) ・7期
小島慧一, 長瀬友里恵, 田村丞, & *須藤雄気 “バイオマスを2倍にする新技術：ロドプシンを用いた緑藻クラミドモナスの生育制御“ (2022) クリーンエネルギー 31, 49-57. 【link】
～2020年度（R2）～
～2020年度（R2）～
助教（特任）：渋川 敦史 (2018/1~2021/3) → 北海道大学・電子科学研究所・准教授
助教（特任）：渋川 敦史 (2018/1~2021/3) → 北海道大学・電子科学研究所・准教授
Shibukawa A, Higuchi R, Song G, *Mikami H, *Sudo Y, & *Jang M. "Large-volume focus control at 10 MHz refresh rate via fast line-scanning amplitude-encoded scattering-assisted holography" (2024) Nat. Commun. 15, 2926.【link】【日刊工業新聞2024/4/26】【プレスリリース】
Shibukawa A, Kojima K, Nakajima Y, Nishimura Y, Yoshizawa S, & *Sudo Y. "Photochemical characterization of a new heliorhodopsin from the gram-negativeeubacterium Bellilinea caldifistulae (BcHeR) and comparison with heliorhodopsin-48C12" (2019) Biochemistry 58, 2934.2943.【link】
渋川敦史、須藤雄気、ムサクジャング “光変調装置及び集光装置” (2021) 特願2021-153788 【令和3年9月22日】
Kawanishi S, *Kojima K, Shibukawa A, Sakamoto M, &*Sudo Y. “Detection of membrane potential-dependent rhodopsin fluorescence using low-intensity light emitting diode for long-term imaging“ (2023) ACS Omega 8, 4826-4834.【link】
#Kojima K, #Miyoshi N, Shibukawa A, Chowdhury S, Tsujimura M, Noji T, Ishikita H, Yamanaka A, & *Sudo Y. (#Equal contribution) “Green-sensitive, long-Lived, step-Functional anion channelrhodopsin-2 variant as a high-potential neural silencing tool” (2020) J. Phys. Chem. Lett. 11, 6214-6218. <2020/07/13>【link】＊プレスリリース＊ ＊日経新聞（電子版）の記事＊ ＊日刊工業新聞＊
Kojima K, Shibukawa A, & *SudoY. “The unlimited potential of microbial rhodopsins as optical tools” (2020) Biochemistry 59, 218-229.【link】
Yamanashi T, Maki M, Kojima K, Shibukawa A, Tsukamoto T, Chowdhury S, Yamanaka A, Takagi S, & *Sudo Y. "Quantitation of the neural silencing activity of anion channelrhodopsins in Caenorhabditis elegans and their applicability for long-term illumination" (2019) Sci. Rep. 9, 7863.【link】
修士（創）：上田 哲也 (2017/12~2021/3)・4期, JASSO奨学金全額免除, 薬学系学術奨励賞
修士（創）：上田 哲也 (2017/12~2021/3)・4期, JASSO奨学金全額免除, 薬学系学術奨励賞
Ueta T, Kojima K, Hino T, Shibata M, Nagano S, & *SudoY. “Applicability of styrene-maleic acid (SMA) copolymer for two microbial rhodopsins, RxR and HsSRI” (2020) Biophys. J. 119, 1760-1770, 【link】
#Kojima K, #Ueta T, Noji T, Saito K, Kanehara K, Yoshizawa S, Ishikita H, & *Sudo Y. (#Equal contribution) “Vectorial proton transport mechanism of RxR, a phylogenetically distinct and thermally stable microbial rhodopsin” (2020) Sci. Rep. 10, 282. 【link】
Suzuki R, Nagashima T, Kojima K, Hironishi R, Hirohata M, Ueta T, Murata T, Yamazaki T, Sudo Y, & Takahashi H. “NMR detection of hydrogen bond network in a proton pump rhodopsin RxR and its alteration during the cyclic photoreaction“ (2023) J. Am. Chem. Soc. 145, 15295.【link】
Yasida S, Akiyama T, Kojima K, Ueta T, Hayashi T, Ogasawara S, Nagatoishi S, TsumotoT, Kunishima N, Sudo Y, Kinoshita M, & Murata T. “Development of an outward proton pumping rhodopsin with a new record in thermostability by means of amino-acid mutations“ (2022) J. Phys. Chem. B. 126, 1004-1015【link】
Yasuda S, Akiyama T, Nemoto S, Hayashi T, Ueta T, Kojima K, Tsukamoto T, Nagatoishi S, Tsumoto K, Sudo Y, Kinoshita M, & *Murata T. “Methodology for further thermostabilization of an intrinsically thermostable membrane protein using amino acid mutations with its original function being retained” (2020) J. Chem. Inf. Model. 60, 1709-1716. 【link】
修士（創）：小野 良太 (2017/12~2021/3)・4期
修士（創）：小野 良太 (2017/12~2021/3)・4期
Ono R, Saeki N, Kojima K, Moriya H, & *Sudo Y. “Demonstration of iodide-dependent UVA-triggered growth inhibition in Saccharomyces cerevisiae cells and identification of its suppressive molecules “ (2023) Biochem. Biophys. Res. Commun. 677, 1.【link】
修士（創）：仲間 政樹 (2017/12~2021/3)・4期, JASSO奨学金半額免除
修士（創）：仲間 政樹 (2017/12~2021/3)・4期, JASSO奨学金半額免除
Nakama M, Noji T, Kojima K, Yoshizawa S, Ishikita H, & *Sudo Y. “Roles of basic amino acid residues in substrate binding and transport of the light-driven anion pump Synechocystis halorhodopsin (SyHR) “ (2025) J. Biol. Chem., 30, 108334. (仲間くん（M卒）の成果, 石北博士・野地博士（東大工）、吉澤博士（東大大海研）との共同研究）
Kojima K, Yoshizawa S, Hasegawa M, Nakama M, Kurihara M, Kikukawa T, & *Sudo Y.
“Lokiarchaeota archaeon Schizorhodopsin-2 (LaSzR2) is an inward proton pump displaying a characteristic feature of acid-induced spectral blue-shift” (2020) Sci. Rep. 10, 20857.
修士（創）：長瀬 友里恵 (2017/12~2021/3)・4期
修士（創）：長瀬 友里恵 (2017/12~2021/3)・4期
小島慧一, 長瀬友里恵, 田村丞, & *須藤雄気 “バイオマスを2倍にする新技術：ロドプシンを用いた緑藻クラミドモナスの生育制御“ (2022) クリーンエネルギー 31, 49-57. 【link】
学士（薬）：菊池 真鈴 (2017/12~2020/11)・４期, 卒業論文優秀賞
学士（薬）：菊池 真鈴 (2017/12~2020/11)・４期, 卒業論文優秀賞
#Kikuchi M, #Kojima K, Nakao S, Yoshizawa S, Kawanishi S, ShibukawaA, Kikukawa T, & *Sudo Y. (#Equal contribution) “Functional expression of the eukaryotic proton pump rhodopsin OmR2 in Escherichia coli and its photochemical characterization” (2021) Sci. Rep. 20, 14765. 【link】
*Yoshizawa S, Azuma T, Kojima K, Inomura K, Hasegawa M, Nishimura Y, Kikuchi M, Armin G, Tsukamoto Y, Miyashita H, Ifuku K, Yamano T, Marchetti A, Fukuzawa H, Sudo Y, & Kamikawa R. “Light-driven proton pumps as a potential regulator for carbon fixation in marine diatoms“ (2023) Microbes Environ. 38, ME23015.【link】
学士（創）：山中 悠嗣 (2019/12~2021/3) ・6期
学士（創）：山中 悠嗣 (2019/12~2021/3) ・6期
Nagata Y, *Miyamoto N, Sato K, Nishimura Y, Tanioka Y, Yamanaka Y, Yoshizawa S, Takahashi K, Obayashi K, Tsukamoto H, Takai K, Ohuchi H, Yamashita T, Sudo Y. & *Kojima K. "A repertoire of visible light-sensitive opsins in the deep-sea hydrothermal vent shrimp Rimicaris hybisae" (2025) J. Biol. Chem., 301, 110291.
～2019年度（H31/R1）～
～2019年度（H31/R1）～
修士（創）：栗原 里佳 (2016/12~2020/3)・3期
修士（創）：栗原 里佳 (2016/12~2020/3)・3期
#Kojima K, #Kurihara R, Sakamoto M,# Takanashi T, Kuramochi H, Zhang X.M, Bito H, Tahara T, & *Sudo Y. (#Equal contribution) “Comparative studies of the fluorescence properties of microbial rhodopsins: Spontaneous emission versus photo-intermediate fluorescence” (2020) J. Phys. Chem. B. 124, 7361-7367. 【link】
Tahara S, Kurihara R, Kojima K, Kuramochi H, Takeuchi S, Sudo Y, & *Tahara T. “Ultrafast protein dynamics prior to retinal photoisomerization in microbial rhodopsins“ (2025) J. Phys. Chem. Lett, 16, 5732-5738.
Needham DM, Yoshizawa S, Hosaka T, Poirier C, Choi CJ, Hehenberger E, Irwin NAT, Wilken S, Yung CM, Bachy C, Kurihara R, Nakajima Y, Kojima K, Kimura-Someya T, Leonard G, Malmstrom RR, Mende DR, Olson DK, Sudo Y, Sudek S, Richards TA, DeLong EF, Keeling PJ, Santoro AE, Shirouzu M, Iwasaki W, Worden AZ. "“A distinct lineage of giant viruses brings a rhodopsin photosystem to unicellular marine predators" (2019) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 116, 20574-20583.【link】
修士（創）：三好 菜月 (2016/12~2020/3)・3期, JASSO奨学金半額免除
修士（創）：三好 菜月 (2016/12~2020/3)・3期, JASSO奨学金半額免除
#Kojima K, #Miyoshi N, Shibukawa A, Chowdhury S, Tsujimura M, Noji T, Ishikita H,Yamanaka A, & *SudoY. (#Equal contribution) “Green-sensitive, long-Lived, step-Functional anion channelrhodopsin-2 variant as a high-potential neural silencing tool” (2020) J. Phys. Chem. Lett. 11, 6214-6218. 【link】
#Kojima K, #Watanabe HC, Doi S, Miyoshi N, Kato M, *Ishikita H, & *Sudo Y. "Miutational analysis of the conserved carboxylates of anion channelrhodopsin-2 (ACR2) expressed in Escherichia coli and their roles in anion transport" (2018) Biophys. Physicobiol. 15, 179-188【link】【第13回Biophysics and Physicobiology論文賞】
修士（創）：山梨 太郎 (2016/12~2020/3)・3期, 薬学系学術奨励賞
修士（創）：山梨 太郎 (2016/12~2020/3)・3期, 薬学系学術奨励賞
Yamanashi T, Maki M, Kojima K, Shibukawa A, Tsukamoto T, Chowdhury S, Yamanaka A, Takagi S, & *Sudo Y. "Quantitation of the neural silencing activity of anion channelrhodopsins in Caenorhabditis elegans and their applicability for long-term illumination" (2019) Sci. Rep. 9, 7863. 【link】
学士（創）：堀江 敬太 (2018/12~2020/3) ・5期
学士（創）：横田 隼志 (2018/12~2020/3) ・5期
学士（創）：横田 隼志 (2018/12~2020/3) ・5期
～2018年度（H30）～
～2018年度（H30）～
修士（創）：井上 紗希 (2015/11~2019/3)・2期, 薬学系学術奨励賞
修士（創）：井上 紗希 (2015/11~2019/3)・2期, 薬学系学術奨励賞
Inoue S, Yoshizawa S, Nakajima Y, Kojima K, Tsukamoto T, Kikukawa T, & *Sudo Y. "Spectroscopic characteristics of Rubricoccus marinus xenorhodopsin (RmXeR) and a putative model for its inward H+ transport mechanism" (2018) Phys. Chem. Chem. Phys. 20, 3172-3183. 【link】
修士（創）：西川 佳吾 (2015/11~2019/3) ・2期
修士（創）：西川 佳吾 (2015/11~2019/3) ・2期
修士（創）：真木 美紗代 (2015/11~2019/3)・2期
修士（創）：真木 美紗代 (2015/11~2019/3)・2期
Yamanashi T, Maki M, Kojima K, Shibukawa A, Tsukamoto T, Chowdhury S, Yamanaka A, Takagi S, & *Sudo Y. "Quantitation of the neural silencing activity of anion channelrhodopsins in Caenorhabditis elegans and their applicability for long-term illumination" (2019) Sci. Rep. 9, 7863. 【link】
学士（薬）：金子 明正 (2015/11~2018/11)・2期
学士（薬）：金子 明正 (2015/11~2018/11)・2期
Kaneko A, Inoue K, Kojima K, Kandori H, & *Sudo Y. "Conversion of microbial rhodopsins: Insights into functionally essential elements and rational protein engineering" (2017) Biophys. Rev. 9, 861-876.【link】
#Takayama R, #Kaneko A, Okitsu T＃, Tsunoda SP, Shimono K, Mizuno M, Kojima K, Tsukamoto T, Kandori H, Mizutani Y, Wada A, & *SudoY. (#Equal contribution) "Production of a light-gated proton channel by replacing the retinal chromophore with its synthetic vinylene derivative" (2018) J. Phys. Chem. Lett. 9, 2857-2862.【link】
Kanehara K, Yoshizawa S, Tsukamoto T, & *Sudo Y. "A phylogenetically distinctive and extremely heat stable light-driven proton pump from the eubacterium Rubrobacter xylanophilus DSM 9941T" (2017) Sci. Rep. 7, 44427. 【朝日、産経、山陽新聞】, *第九回（2017）日本生物物理学会中四国支部例会・若手発表優秀賞.
Kojima K, Ueta T, Noji T, Saito K, Kanehara K, Yoshizawa S, Ishikita H, & *Sudo Y. “Vectorial proton transport mechanism of RxR, a phylogenetically distinct and thermally stable microbial rhodopsin” (2020) Sci. Rep. 10, 282. 【link】
Hayashi T, Yasuda S, Suzuki K, Akiyama T, Kanehara K, Kojima K, Tanabe M, Kato R, Senda T, Sudo Y, *Murata T, & *Kinoshita M. “How does a microbial rhodopsin RxR Realize Its Exceptionally High Thermostability with the Proton-Pumping Function Being Retained?” (2020) J. Phys. Chem. B 124, 990-1000. 【link】
～2017年度（H29）～
～2017年度（H29）～
修士（創）：土井 聡子 (2014/10~2018/3) ・1期, 薬学系学術奨励賞
修士（創）：土井 聡子 (2014/10~2018/3) ・1期, 薬学系学術奨励賞
Doi S, Tsukamoto T, Yoshizawa S, & *Sudo Y. "An inhibitory role of Arg-84 in anion channelrhodopsin-2 expressed in Escherichia coli" (2017) Sci. Rep. 7, 41879. 【link】第八回（2016）日本生物物理学会中四国支部例会・若手発表優秀賞
Doi S, Mori A, Tsukamoto T, Reissig L, Ihara K, & *Sudo Y. "Structural and functional roles of the N- and C-terminal extended modules in Channelrhodopsin-1" (2015) Photochem. Photobiol. Sci. 14, 1628-1636.【link】
#Kojima K, #Watanabe HC, Doi S, Miyoshi N, Kato M, *Ishikita H, & *Sudo Y. "Miutational analysis of the conserved carboxylates of anion channelrhodopsin-2 (ACR2) expressed in Escherichia coli and their roles in anion transport" (2018) Biophys. Physicobiol. 15, 179-188.【link】【第13回Biophysics and Physicobiology論文賞】
*Nakajima Y, Kojima K, Kashiyama Y, Doi S, Nakai R, Sudo Y, Kogure K, & *Yoshizawa S. “Bacterium lacking a known gene for retinal biosynthesis possesses functional rhodopsins” (2020) Microbes Environ. 35, ME20085. 【link】
土井聡子 & 須藤雄気 (2015) "ビタミンAアルデヒドを発色団とするレチナールタンパク質の多様性と可能性" ビタミン 89, 83-86.【link】
学士（薬）：高山 理穂 (2014/10~2017/11) ・1期
学士（薬）：高山 理穂 (2014/10~2017/11) ・1期
#Takayama R, #Kaneko A, #Okitsu T, Tsunoda SP, Shimono K, Mizuno M, Kojima K, Tsukamoto T, Kandori H, Mizutani Y, Wada A, & *SudoY. (#Equal contribution) "Production of a light-gated proton channel by replacing the retinal chromophore with its synthetic vinylene derivative" (2018) J. Phys. Chem. Lett. 9, 2857-2862.【link】
学士（薬）：仁保 亜紀子 (2014/10~2017/11) ・1期, 卒業論文優秀賞
学士（薬）：仁保 亜紀子 (2014/10~2017/11) ・1期, 卒業論文優秀賞
Niho A, Yoshizawa S, Tsukamoto T, Kurihara M, Tahara S, Nakajima Y, Mizuno M, Kuramochi H, Tahara T, Mizutani Y, & *Sudo Y. "Demonstration of a light-driven SO42- transporter and its spectroscopic characteristics" (2017) J. Am. Chem. Soc. 139, 4376-4389. 【link】
学士（薬）：橋本 美沙 (2014/10~2017/11) ・1期
学士（薬）：橋本 美沙 (2014/10~2017/11) ・1期
学士（薬）：本田 尚也 (2014/10~2017/11) ・1期
学士（薬）：本田 尚也 (2014/10~2017/11) ・1期
Honda N, Tsukamoto T, & *Sudo Y. "Comparative evaluation of the stability of seven-transmembrane microbial rhodopsins to various physicochemical stimuli" (2017) Chem. Phys. Lett. 682, 6-14.【link】
#Kuroi K, #Tsukamoto T, Honda N, *Sudo Y, & *Furutani Y. “Concerted primary protontransfer reactions in a thermophilic rhodopsin studied by time-resolved Infrared spectroscopy at high temperature“ (2023) Biochim. Biophys. Acta (Bioeng.), 1864, 148980.【link】
Tsukamoto T, Mizutani K, Hasegawa T, Takahashi M, Honda N, Hashimoto N, Shimono K, Yamashita Y, Yamamoto M, Miyauchi S, Takagi S, Hayashi S, *Murata T, & *Sudo Y. "X-ray crystallographic structure of thermophilic rhodopsin: implications for high thermal stability and optogenetic function" (2016) J. Biol. Chem. 291, 12223-12232. 【link】【科学新聞】
～2016年度（H28）～
～2016年度（H28）～
博士研究員・助教（特任）・助教：塚本 卓 (2013/04-2017/03) → 北海道大学・大学院理学研究科・助教
博士研究員・助教（特任）・助教：塚本 卓 (2013/04-2017/03) → 北海道大学・大学院理学研究科・助教
#Kuroi K, #Tsukamoto T, Honda N, *Sudo Y, & *Furutani Y. (#Equal contribution) “Concerted primary protontransfer reactions in a thermophilic rhodopsin studied by time-resolved Infrared spectroscopy at high temperature“ (2023) Biochim. Biophys. Acta (Bioeng.) 1864, 148980.【link】
*Tsukamoto T, Yoshizawa S, Kikukawa T, Demura M, & *Sudo Y. "Implications for the light-driven chloride ion transport mechanism of Nonlabens marinus rhodopsin 3 by its photochemical characteristics" (2017) J. Phys. Chem. B 121, 2027-2038.
#Niho A, #Yoshizawa S, #Tsukamoto T, Kurihara M, Tahara S, Nakajima Y, Mizuno M, Kuramochi H, Tahara T, Mizutani Y, & *Sudo Y. (#Equal contribution) "Demonstration of a light-driven SO42- transporter and its spectroscopic characteristics" (2017) J. Am. Chem. Soc. 139, 4376-4389.
Tsukamoto T, Mizutani K, Hasegawa T, Takahashi M, Honda N, Hashimoto N, Shimono K, Yamashita Y, Yamamoto M, Miyauchi S, Takagi S, Hayashi S, *Murata T, *Sudo Y. "X-ray crystallographic structure of thermophilic rhodopsin: implications for high thermal stability and optogenetic function" (2016) J. Biol. Chem. 291, 12223-12232.【link】 【科学新聞】
#Inoue K, #Tsukamoto T, Shimono K, Suzuki Y, Miyauchi S, Hayashi S, Kandori H, & *Sudo Y. (#Equal contribution) "Converting a light-driven proton pump into a light-gated proton channel" (2015) J. Am. Chem. Soc. 137, 3291-3299. 【読売, 山陽新聞, 化学工業日報, マイナビニュース, 日刊工業新聞】
Tsukamoto T, Demura M, *Sudo Y. “Irreversible trimer to monomer transition of thermophilic rhodopsin upon thermal stimulation” (2014) J. Phys. Chem. B 118, 12383-12394.
Tsukamoto T, Inoue K, Kandori H, *Sudo Y. “Thermal and spectroscopic characterization of a proton pumping rhodopsin from an extreme thermophile” (2013) J. Biol. Chem. 288, 21581-21592.
Doi Y, Watanabe J, Nii R, Tsukamoto T, Demura M, Sudo Y, & *Kikukawa T. “Mutations conferring SO42- pumping ability on the cyanobacterial anion pump rhodopsin and the resultant unique features of the mutant“ (2022) Sci. Rep. 12, 16422.【link】
Yasuda S, Akiyama T, Nemoto S, Hayashi T, Ueta T, Kojima K, Tsukamoto T, Nagatoishi S, Tsumoto K, Sudo Y, Kinoshita M, & *Murata T. “Methodology for further thermostabilization of an intrinsically thermostable membrane protein using amino acid mutations with its original function being retained” (2020) J. Chem. Inf. Model. 60, 1709-1716. 【link】
Yamanashi T, Maki M, Kojima K, Shibukawa A, Tsukamoto T, Chowdhury S, Yamanaka A, Takagi S, & *Sudo Y. "Quantitation of the neural silencing activity of anion channelrhodopsins in Caenorhabditis elegans and their applicability for long-term illumination" (2019) Sci. Rep. 9, 7863.【link】
Shionoya T, Mizuno M, Tsukamoto T, Ikeda K, Seki H, Kojima K, Shibata M, Kawamura I, Sudo Y,& *Mizutani Y. "High thermal stability of oligomeric assemblies of thermophilic rhodopsin in a lipid environment" (2018) J. Phys. Chem. B 122, 6945-6953.
#Takayama R, #Kaneko A, #Okitsu T, Tsunoda SP, Shimono K, Mizuno M, Kojima K, Tsukamoto T, Kandori H, Mizutani Y, Wada A, & *SudoY. (#Equal contribution) "Production of a light-gated proton channel by replacing the retinal chromophore with its synthetic vinylene derivative" (2018) J. Phys. Chem. Lett. 9, 2857-2862.【link】
Nakajima Y, Tsukamoto T, Kumagai Y, Ogura Y, Hayashi T, Song J, Kikukawa T, Demura M, Kogure K, Sudo Y, & *Yoshizawa S. "Presence of a haloarchaeal halorhodopsin-like Cl- pump in marine bacteria" (2018) Microbes Environ. 33, 89-97.
Inoue S, Yoshizawa S, Nakajima Y, Kojima K, Tsukamoto T, Kikukawa T, & *Sudo Y. "Spectroscopic characteristics of Rubricoccus marinus xenorhodopsin (RmXeR) and a putative model for its inward H+ transport mechanism" (2018) Phys. Chem. Chem. Phys. 20, 3172-3183. 【link】
Kanehara K, Yoshizawa S, Tsukamoto T, *Sudo Y. "A phylogenetically distinctive and extremely heat stable light-driven proton pump from the eubacterium Rubrobacter xylanophilus DSM 9941T" (2017) Sci. Rep. 7, 44427. 【朝日、産経、山陽新聞】
Doi S, Tsukamoto T, Yoshizawa S, *Sudo Y. "An inhibitory role of Arg-84 in anion channelrhodopsin-2 expressed in Escherichia coli" (2017) Sci. Rep. 7, 41879.
*Sakamoto A, Tsukamoto T, Furutani Y, Sudo Y, Shimada K, Tomita A, Kiyoi H, Kato T, Funatsu T. "Live-cell single-molecule imaging of the cytokine receptor MPL for analysis of dynamic dimerization" (2016) J. Mol. Cell Biol. 8, 553-555. 【link】
Doi S, Mori A, Tsukamoto T, Reissig L, Ihara K, *Sudo Y. "Structural and functional roles of the N- and C-terminal extended modules in channelrhodopsin-1" (2015) Photochem. Photobiol. Sci. 14, 1628-1636.
塚本卓、須藤雄気 "好熱性細菌のレチナールタンパク質" (2015）生物物理 55, 92-94.
Tsukamoto T, *Sudo Y. “Sensory rhodopsins” (2014) In: eLS. John Wiley & Sons, Ltd: Chichester. DOI: 10.1002/9780470015902.a0022838
須藤雄気、塚本卓 ”膜タンパク質の可溶化（抽出）(2)” (2014) 蛋白質科学会・アーカイブ 7, e079.
Inoue K, Tsukamoto T, *Sudo Y. “Molecular and evolutionary aspects of microbial sensory rhodopsins” (2014) Biochim. Biophys. Acta 1837, 562-577.
出身者の進路：順不同（Career path）
<アカデミア（Academia）>
准教授（北海道大学電子科学研究所：Associate Prof., Hokkaido Univ.）, 助教（北海道大学大学院理学研究科：Assistant Prof, Hokkaido Univ.）, Assistant Professor (Freie Universität Berlin)
<企業（Company）>
住友化学（研究：Sumitomo Chemical）, 参天製薬（研究：Santen Pharmaceutical）, 阪大微生物学研究会（The Research Foundation for Microbial Diseases of Osaka Univ.）, 塩野義製薬（研究：Shionogi）, 佐藤製薬（研究：Sato Pharmaceutical）, 協和発酵キリン（研究：KYOWA HAKKO KIRIN）, アステラス製薬（開発：Astellas Pharma）, 日本血液製剤機構（Japan Blood Products Organization）, JCRファーマ（JCR Pharmaceuticals）
<病院・薬局（Hospital/Pharmacy）>
倉敷平成病院（薬剤師：Kurashiki Heisei Hospital）, ププレひまわり（薬剤師：Pupule Himawari）, 神戸市立医療センター中央市民病院（薬剤師：Kobe City Medical Center General Hospital）, アイビー薬局（薬剤師：Ivy pharmacy）, 倉敷成人病センター（薬剤師：Kurashiki Medical Center）, 豊岡病院（薬剤師：Toyooka Hospital）
Album
Album
[2025年5月2日：薬学部正面玄関前]
[2024年4月4日：薬学部正面玄関前]
[2023年4月7日：ラボ内]
[2022年4月7日：薬学部正面玄関前]
[2021年3月3日：薬学部正面玄関前]
[2019年8月22日：ビアガーデン＠高島屋]
[2017年3月24日：卒業式]
[2016年4月6日：お花見ー半田山植物園]
[2015年9月4日：ゼミ旅行ー広島県世羅町]
[2014年10月13日：台風迫る岡山]
卒業生・修了生の声（原文ママ）
研究室での3年間は自分にとって非常に貴重で大きな経験になりました。研究や実験を行う上での思考力を養うことに加え、研究室という一つの組織に身を置くことで様々なことを学ばせていただきました。途中で研究テーマが変わることもありましたが、結果的に様々な知識や技術に触れる良い機会になりました。楽しいことばかりではなく、厳しいこともありましたが、それを含めてもこの研究室に入ってよかったと思っています。卒業後は薬剤師として働くことになりますが、ここで培った経験を活かして立派な薬剤師になれるよう日々励んで行きたいと思っています。
須藤先生と小島先生の丁寧なご指導のもと、電気生理学実験などの新しい実験、他大学の先生との共同研究や多数の学会参加など貴重な経験をたくさんさせていただいた3年間でした。研究室で過ごす中で身に着けた、質問する力・研究を簡潔にまとめる力・計画的に取り組む大切さ・丁寧なコミュニケーショなどは社会人になってからとても役立っていると感じています。また、研究に励むだけではなく、研究室メンバーと楽しく過ごしたこともいい思い出です。研究室で得た経験を活かして、研究職としてこれからも業務に励みます。
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