โรงเรียนกู่ทองพิทยาคม  เป็นโรงเรียนมัธยมศึกษาแห่งที่สองของอำเภอเชียงยืน  เดิมเป็นโรงเรียนสาขาของโรงเรียนเชียงยืนพิทยาคม  รูปแบบสหศึกษา  สังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษา  เขต  26  กระทรวงศึกษาธิการ  ตั้งอยู่ที่ตำบลกู่ทอง  อำเภอเชียงยืน  จังหวัดมหาสารคาม  ปัจจุบันเปิดสอนในช่วงชั้นมัธยมศึกษาตอนต้นและตอนปลาย

               ตามที่กระทรวงศึกษาธิการ  โดยกรมสามัญศึกษาและโรงเรียนเชียงยืนพิทยาคมไ ด้จัดทำโครงการจัดตั้งโรงเรียนสาขามัธยมศึกษาตามแผนพัฒนาการศึกษาแห่งชาติฉบับที่  7  (พ.ศ. 2535 - 2539)  ขึ้นที่ตำบลกู่ทอง  โดยขอจัดสาขามัธยมศึกษาในปีการศึกษา  2537  และทางโรงเรียนเชียงยืนพิทยาคม  โดยนายธรรมรัตน์  ประเสริฐ  ผู้อำนวยการโรงเรียนเชียงยืนพิทยาคม  ได้มอบหมายให้  นายเรืองยศ  ไชยศึก  เป็นผู้ดำเนินการและประสานงานในการจัดทำโครงการ  ตลอดจนจัดเตรียมเอกสารข้อมูลการขอจัดสาขาโรงเรียนมัธยมศึกษาที่ทางโรงเรียนมอบหมาย  เพื่อเสนออนุมัติการเปิดสาขาโรงเรียนมัธยมศึกษาตามขั้นตอนร่วมกับคณะกรรมการที่ทางโรงเรียนมอบหมาย  เมื่อวันที่  3  พฤศจิกายน  2536  คณะกรรมการประสานงานโดยการนำของนายเรืองยศ  ไชยศึก  ได้เข้าร่วมกับสภาตำบลกู่ทอง  ได้นำเรื่องการจัดตั้งสาขาโรงเรียนมัธยมศึกษาขึ้นในเขตพื้นที่ปกครองของตำบลกู่ทอง  เสนอต่อที่ประชุมเพื่อขอความเห็นชอบ  และทางสภาตำบลกู่ทองได้มีมติเป็นเอกฉันท์ในการประชุม เมื่อ  วันที่  3  พฤศจิกายน  2536  ให้จัดตั้งโรงเรียนสาขาโรงเรียนมัธยมศึกษา  คือ  สาขาโรงเรียนเชียงยืนพิทยาคม (ตำบลกู่ทอง)  ที่บ้านใหม่บัวบาน  หมู่ที่  14  โดยอนุมัติให้ใช้ที่ดินเนื้อที่  36  ไร่  ณ โคกสาธารณะหนองคลอง

               วันที่  20  ธันวาคม  2536  โรงเรียนเชียงยืนพิทยาคมได้รับความเห็นชอบจากคณะกรรมการการศึกษา  การศาสนาและศิลปวัฒนธรรม  จังหวัดมหาสารคาม  ประกาศให้จัดตั้งสาขาโรงเรียนมัธยมศึกษา  ในปีการศึกษา  2537  ขึ้นที่สาขาโรงเรียนเชียงยืนพิทยาคม (ตำบลกู่ทอง)  ผู้อำนวยการโรงเรียนเชียงยืนพิทยาคม (นายธรรมรัตน์  ประเสริฐ)  จึงได้แต่งตั้งให้ นายเรืองยศ  ไชยศึก  โรงเรียนเชียงยืนพิทยาคม  ไปทำหน้าที่ผู้ประสานงานสาขาโรงเรียนเชียงยืนพิทยาคม (ตำบลกู่ทอง)  ตามคำสั่งโรงเรียนเชียงยืนพิทยาคม  ณ วันที่  23  ธันวาคม  2536  และผู้ประสานงานได้ดำเนินการประสานงานกับสภาตำบลกู่ทอง  และตำบลใกล้เคียง  วันที่  8  พฤษภาคม  2540  ฯพณฯ สุขวิช รังสิตพล  รัฐมนตรีว่าการกระทรวงศึกษาธิการ  ในขณะนั้น  ได้ประกาศจัดตั้งเป็นโรงเรียนมัธยมศึกษาเอกเทศชื่อ  โรงเรียนกู่ทองพิทยาคม  มีเนื้อที่  91.43  ไร่  พื้นที่บริการประกอบด้วยพื้นที่ปกครอง  2  ตำบล  มีโรงเรียนประถมศึกษาในเขตพื้นที่บริการจำนวน  13  โรงเรียน

โรงเรียนได้ดำเนินการจัดการศึกษาให้กับนักเรียนในท้องถิ่นและชุมชนใกล้เคียงจนผ่านการประเมินจาก  สมศ. รอบสาม  ในระดับดี