Software

  • Rパッケージ（Bioconductor）
    • scTGIF : 結合非負値行列分解による1細胞オミックスの機能アノテーション
    • scTensor : 非負値テンソル分解による細胞間相互作用検出、HTMLレポート生成
    • LRBase.XXX.eg.db : 12生物種における、リガンド-受容体データベース
    • LRBaseDbi : CSVからLRBase.XXX.eg.dbを生成する、メタパッケージ
    • metaSeq : 複数のRNA-Seqでのメタ解析
    • meshr : MeSHエンリッチメント解析
    • MeSH.XXX.eg.db : 120生物種における、NCBI Gene ID - MeSH IDデータベース
    • MeSHDbi : CSVからMeSH.XXX.eg.dbを生成する、メタパッケージ
    • MeSH.db : MeSHアノテーションパッケージ
    • MeSH.AOR.db : MeSH IDの親子関係情報
    • MeSH.PCR.db : MeSH IDの祖先子孫関係情報
  • Rパッケージ（CRAN）
  • Juliaパッケージ