第6回進化学セミナー　プログラム

全体プログラム

プログラムは適宜更新しますので、随時確認をお願いいたします。

本セミナーでは、すべての参加者が安心して参加・発表・交流できる環境を実現するために、以下のようなあらゆる形態のハラスメント行為を一切禁止しています。

    •    性的ハラスメント、差別的発言や行動

    •    威圧的、攻撃的、または排除的な言動

    •    年齢・性別・性的指向・障害・人種・出身・信条などに関する差別的表現

    •    セミナー中の無断撮影・録音・不適切なSNS投稿　など

また、セミナー全体において、他者への敬意と多様性への理解をもって行動することを求めます。

9/27（土）

10:00-16:00　集団遺伝学基礎講義・「ゲノム多様性解析」ハンズオンセミナー

講師：長田直樹 先生（北海道大）、木村亮介 先生（琉球大）、河合洋介 先生（国立国際医療センター）

補助：遺伝学若手の会

10:00～11:10　集団構造の可視化（木村先生）

11:10～11:20　休憩

11:20～12:00　集団サイズの推定1（河合先生）

12:00～13:00　昼休み

13:00～13:30　集団サイズの推定2（河合先生）

13:30～13:40　休憩

13:40～15:10　集団の分岐・混合，自然選択（長田先生）

15:10～15:20　休憩

15:20～16:00　分岐年代の推定（長田先生）

16:00-16:30　Opening remarks：斎藤成也 先生（遺伝研・名誉教授）

16:30-17:20　講演1-1：髙橋文 先生（東京都立大）

17:20-17:30　フラッシュトーク

17:30-18:30　ポスター発表

18:30-20:00　懇親会

9/28（日）

  9:30-10:20　講演2-1：寺井洋平 先生（総研大）

10:20-10:30　10分休憩

10:30-11:20　講演2-2：蔦谷匠 先生（総研大）

11:20-11:30　10分休憩

11:30-12:20　講演2-3：松前ひろみ 先生（東海大）

12:20-13:30　昼食休憩

13:30-14:20　講演2-4：内藤健 先生（農研機構）

14:20-14:30　10分休憩

14:30-15:20　講演2-5：奥山雄大 先生（科博植物園）

15:20-15:40　20分コーヒーブレイク

15:40-16:30　講演2-6：横林洋平 先生（OIST）

16:30-16:40　10分休憩

16:40-17:10　Closing remarks：高畑尚之 先生（総研大・名誉教授）

17:10-17:30　ポスター発表表彰、写真撮影

ハンズオンセミナー

講師：
長田直樹 先生（北海道大学）
木村亮介 先生（琉球大学）
河合洋介 先生（国立国際医療センター）

「ゲノム多様性解析（森北出版株式会社）」を執筆された先生方をお招きし、集団遺伝学の基礎講義・ハンズオンセミナー行います。
学部4年生〜修士程度、ならびに集団遺伝学を専門としない博士課程以上の若手研究者を主な対象とした入門レベルの内容を考えています。

解析環境
ハンズオンセミナーを講師・参加者共通の環境で行うにあたり、Dockerを利用して解析環境を導入します。
導入手順は以下を参照してください。
https://drive.google.com/drive/folders/1_tY66y42Yq_08uvQGAB9bnT4_0pf0VvE?usp=sharing
*導入手順はwindows10・11およびAppleシリコンMac  OSで検証しています。
*作業には通信状況の良い場所で１時間程度かかる見込みです。

ハンズオンセミナーに使用するデータ
ハンズオンセミナーで使用するデータセットは以下よりダウンロードできます。
https://zenodo.org/records/14776093
ページの下の方にある、yaponesiae.tar.gzというファイルをダウンロードしてください。
*データが大きいのでダウンロードには時間がかかります。
*解析環境の導入手順の3に同じ内容が記載してあります。

講義資料

以下の共有ドライブのフォルダから取得してください。
　 講義スライドはzip圧縮されており、解凍する際にパスワードが必要です。パスワードは参加者の皆様にメールにてお送りします。

河合先生の講義での追加課題に必要な"yaponesiae.map"もフォルダ内にございます。

講義資料の共有ドライブ

ご講演

進化学に関わる多様な分野・解析技術で研究を展開されている先生方をお招きし、ご講演をいただきます。現時点で講師をお引き受けいただいている先生方の一覧です。

髙橋文 先生（東京都立大学）
演題「種分化の背景にある共進化と不適合性」
ショウジョウバエを用いた種分化や適応進化の遺伝的基盤の研究についてご講演を依頼しております。

内藤健 先生（農研機構）
演題「集団ゲノム解析で明かされたアズキの栽培化起源と栽培化過程」
Chien et al., A single domestication origin of adzuki bean in Japan and the evolution of domestication genes. Science. 2025. https://doi.org/10.1126/science.ads2871 に関するご講演を依頼しております。

松前ひろみ 先生（東海大学）
演題「ヒト研究から菌類への発展─進化生物学の未解決問題に挑む─」
真菌（菌類）の進化ゲノミクスについてご講演を依頼しております。

寺井洋平 先生（総合研究大学院大学）
演題「古代DNAを使ってイヌの進化を観察する」
ニホンオオカミのゲノム解析やイヌの適応進化に関してご講演を依頼しております。

奥山雄大 先生（国立科学博物館筑波実験植物園）　
演題「生態学と遺伝学をつなぐ香りの分子：腐肉擬態花はいかにして進化し得たのか？」
Okuyama et al., Convergent acquisition of disulfide-forming enzymes in malodorous flowers. Science. 2025. https://doi.org/10.1126/science.adu8988 に関するご講演を依頼しております。

蔦谷　匠　先生（総合研究大学院大学）
演題「更新世の台湾におけるデニソワ人男性の下顎骨の発見」
Tsutaya et al., A male Denisovan mandible from Pleistocene Taiwan. Science (2025)  https://www.science.org/doi/10.1126/science.ads3888 に関するご講演を依頼しております。

横林洋平 先生（沖縄科学技術大学院大学）
演題「RNA配列ー機能相関の大規模実験解析と合成生物学的応用」
Rotrattanadumrong and Yokobayashi, Experimental exploration of a ribozyme neutral network using evolutionary algorithm and deep learning. Nature Communications. 2022. https://doi.org/10.1038/s41467-022-32538-z に関するご講演を依頼しております。

斎藤成也 先生（国立遺伝学研究所・名誉教授）
Opening remarksとして、斎藤先生のこれまでのご研究および木村資生博士および夏の学校・進化学セミナーに関するお話を依頼しております。

高畑尚之 先生（総合研究大学院大学・名誉教授）
Closing remarksとして、高畑先生のこれまでのご研究および木村資生博士および夏の学校・進化学セミナーに関するお話を依頼しております。

ポスター発表

発表を希望される方は参加登録フォームの該当欄にご回答ください。また、後日公開またはメールにて送付するポスター発表の登録フォームにもご回答ください。

• ポスターのサイズはA0を前提として会場準備をしています。

• ポスターの印刷は東大生協で行うことも（運営で印刷を代行することが）可能な見通しです。その場合は9/24水23:59までにメール（kimuramotoo.seminar[at]gmail.com) にて提出していただくことになります。提出はpdfまたはパワーポイント形式で、印刷サイズはA0でお願いします。

• 他の学会等で用意されたポスターをお持ちいただいても構いません。活発に議論していただけますと幸いです。

• また、1,2分程度のフラッシュトークの時間を設けます。自己紹介スライド1枚準備をお願いいたします。

• ポスター賞を設けています。また、副賞もあります。

演題一覧

P-1

千葉元太：遺伝子間の発現量比保存構造を通した遺伝的摂動効果のグローバルな波及

P-2

三井英也：分子系統解析からデータサイエンスを学ぶ​ アクティブ・ラーニング教材の開発と検証

P-3

壹岐友里恵：Vigna luteolaのNa分配機構解明に向けて

P-4

林泰瑶：構造制約と祖先配列復元の融合による古代ヒストン配列の推定

P-5

Anna Valchanova：カンアオイ属の花の香りは送粉者の活動に応じて日周変化するか？

P-6

藤原一道：A Genomic Framework for Japanese Cherry Diversity: Progress and Outlook of the Sakura 100 Genomes Project

P-7

奥井七央子：キノコバエを送粉者とするチャルメルソウ属の花から検出された、長鎖炭化水素類について

P-8

佐藤柊介：中国から日本にかけて生息するタロイモショウジョウバエ属2種の遺伝的多様性と地理分化

P-9

石川峻遥：フジコナカイガラムシ (Planococcus kraunhiae) におけるオス特異的父方由来染色体不活性化現象に関連する遺伝子の探索

P-10

山口万里花：イワボタン列ークチナガハバチ属共生系が駆動する両者の形態の多様化

P-11

須田崚：日本産ハクサンハタザオにみられる自殖性の進化: 自家不和合性対立遺伝子と自殖シンドロームの解析

P-12

小林一三：種内多数ゲノム比較による 適応分化変異の大量検出

P-13

古林真樹：ヒトリボソームRNA反復遺伝子の安定性維持機構の解析

P-14

奥大河：ネアンデルタール人の運動能力におけるPower/Endurance特性：現生人類との比較

P-15

Maria Lopopolo：Pre-European contact leprosy in the Americas and its current persistence

P-16

待井長敏：（演題非公開）