Unit Penjaminan Mutu Fakultas Teknik Universitas Cenderawasih (Jamintu FT Uncen) dibentuk pada tanggal 15 Januari 2014 melalui SK Rektor Uncen No. 212/UN20.1.6/PJ/2014. Pada waktu itu Ketua dan Sekretarisnya adalah Tobok Aritonang dan Wika Matana Nion.
Saat ini, berdasarkan SK Rektor Uncen No. 673a/UN20.1.6/PJ/2021 tanggal 8 Juni 2021 yang menjadi Ketua Jamintu FT Uncen adalah Bernathius Julison, dengan Pither Palamba sebagai Sekretarisnya.