Las colecciones biológicas representan el patrimonio natural de un país o región, constituyen un archivo histórico natural de utilidad múltiple donde la preservación de especimenes y su información asociada son la base para estudios taxonómicos, sistemáticos, ecológicos, biogeográficos, de genética de poblaciones y conservación formando parte fundamental en el conocimiento de la diversidad biológica. 

El objetivo principal de la Colección Biológica del IIBP es desarrollar y fomentar la investigación científica en el Paraguay, proveer de todas las herramientas necesarias para su realización, siendo de uso público y disponible para cualquier investigador que acepte los términos del Plan de Manejo y cuyo fin sea la investigación científica.

La colección actualmente cuenta con:

• más de 6.000 ejemplares de anfibios y reptiles

• muestras puntuales de peces y mamíferos

Además, anexo a la colección, el IIBP cuenta con un laboratorio con equipamiento básico e imprescindible para la curación y revisión de los ejemplares. Equipos de disección, lupas y libros básicos sobre los distintos grupos taxonómicos son algunos de los elementos con los que cuenta el Instituto.

Financiamiento: autogerenciado

Estado actual: activo