Sejak di pindahkan kampung Pebooa tahun 1927 di ikutisertakan pembangunan gedung Gereja sebagai tempat Ibadah. Pada tahun 1927 bulan Maret Gereja Pebooa sudah di dirikan bersama-sama dengan perumahan masyarakat. Terpuji nama Tuhan pada tahun 1927 di bulan Desember dilaksanakanlah Baptisan Kudus atas nama Bapak U. Marisa dan Ibu R. Mberato oleh hamba Tuhan Bapak Pdt. Ridel dari Korowalelo. Berikut ini lokasi-lokasi berdirinya gedung Gereja, yaitu :

1. Gereja pertama bertempat di pinggir sungai Tambalako, dengan seorang pelayan Tuhan bernama Bapak W. Wowiling dan dibantu oleh Bapak S. Wowiling, dari tahun 1927-1941.

2.  Gereja ke dua bertempat di lokasi kintal Bapak U. Marisa dengan seorang pelayan Tuhan bernama Bapak B. Tamanampo dan dibantu oleh Bapak T. Lawenu, dari tahun 1942-1945.

3.  Pada tahun 1946-1962, gereja yang ke dua di pindahkan lagi ke lokasi Bapak T. Mberato, di bawah pelayanan Bapak M. Lobo, Bapak K. Laimpu, Bapak L. Rundulemo, Bapak L. Dewanto dan Bapak S. Rundulemo.

Pada tahun 1963 Gereja yang lama dibangun kembali dan dibawah kepemimpinan pelayanan Bapak GM. Hano, disusul lagi oleh Bapak G. Mberato dan Bapak R. Ngalu dengan pergantian kepemimpinan pelayanan, maka dihadirkan lagi seorang pelayan dari desa Tingkea'o atas nama Bapak A. Larongge kemudian pergantian kepemimpinan dihadirkan lagi seorang pelayan dari desa Uluanso yang bernama Bapak Gatros Lingkua. Pergantian kepemimpinan secara berturut-turut yakni Bapak A. Bansoe disusul lagi oleh Bapak S. Marunduh, disusul lagi oleh Bapak A. Bansoe. Pergantian kepemimpinan oleh Bapak M. Timpo sebagai gembala angkat. Dengan kepentingan pelayanan, maka dihadirkan seorang pelayan yang berstatus secara berturut-turut sesuai dengan aturan Tata Gereja. Berdasarkan data-data yang terhimpun dan beberapa pentunjuk dari orang- orang tua sebagai tokoh dalam jemaat, maka pada tanggal, 20 Februari 2022 melalui Rapat Tahunan Jemaat Rehobot Pebooa, di putuskan bahwa tanggal, 29 Desember 1927 sebagai hari berdirinya Jemaat Rehobot Pebooа.

Nama-nama Pelayan Tuhan Berdasarkan SK Majelis Sinode GKST Yang Berstatus Pendeta. Berikut ini daftar nama-nama pelayan Tuhan yang melayani di Jemaat Rehobot Pebooa yang bertatus Pendeta berdasarkan SK Majelis Sinode GKST sebagai berikut:

1.   Pdt. D. A. Sumito, S. Th

2.   Pdt. Al. Bone, S. Th (Almahum)

3.   Pdt. D. T. Dangari, S. Th

4.   Pdt. W. Pombaela, S. Th

5.   Pdt. Nz. Lamusa, S. Th

6.   Pdt. A. Palunsu, S. Th

7.   Pdt. Y. K. Uka, S. Th