代謝體分析常見問題
Q1 : 是否有提供樣品前處理的服務?
A:
有的，我們有為送測客戶提供樣品前處理服務(按件收費)。樣本類型包括血清、血漿、細胞、組織和體液等。
Q2 : 是否有提供數據分析的服務?
A:
有的，我們的送測費用包含基本數據分析服務，結果報告會包含原始積分面積值、PCA、heatmaps、volcano plots及pathway mapping等等。
Q3 : 請問可以同時看代謝體與脂質體嗎?
A:
如果檢體量足夠多的話，建議準備兩份樣品，一份進行極性代謝物萃取，另一份則進行非極性代謝物萃取，採取單相各別萃取方式。但若是檢體較為珍貴或是量不夠分成兩份來進行，則建議以雙相(bi-phase)萃取方式進行。
Q4 : 請問標靶與非標靶分析要如何選擇?
A:
非標靶分析涵蓋較多數量的小分子清單，適合用於未知代謝物探索、差異分子篩選與 biomarker discovery；而標靶分析的優點則是靈敏度與準確度較高，適合已有明確研究標的、代謝路徑或候選分子之實驗設計，可協助評估不同處理條件、疾病模式或生理狀態下的代謝變化。
Q5 : 請問GRC有提供定量分析服務嗎?
A:
有的，但是送測者須自行提供標準品，我們會協助建立分析條件及檢量線。
Q6 : 請問若是待測的分子不在標靶清單內，GRC可以協助建立清單嗎?
A:
可以，但是送測者須自行提供標準品，我們會協助建立分析條件。
Q7 : 請問除了血清、血漿、細胞、組織和體液等樣本之外,是否有提供其他生物樣本的代謝體分析?
A:
有的，請與我們聯繫討論合適的樣品前處理方式及上機條件等等。
Q8 : 請問樣本量最少要提供多少量才夠?
A:
若是待測物在生物體中的表現量是可以預期的，便可協助估算檢體量；反之若是未知表現量如何，GRC可協助盡量以最少的萃取體積進行前處理或是濃縮等方式來提高訊號強度。
質譜影像分析常見問題
Q1：切片運送有哪些注意事項？
A：
請將組織切片玻片妥善放置於玻片盒中，避免玻片碰撞、刮傷或受潮。樣品需全程維持低溫，建議以 −80 °C 或乾冰條件運送至 GRC Mass Spectrometry Core Facility。運送過程中請避免反覆凍融，以降低組織形態改變與代謝物／脂質訊號流失的風險。
Q2：組織冷凍切片可以使用 OCT 包埋嗎？
A：
不建議，也不可使用 OCT 包埋。
OCT 會在質譜分析中產生大量背景訊號，可能干擾目標分子的偵測，尤其會影響代謝物、脂質及小分子的質譜影像分析結果。
若樣品需要支撐或包埋，請於切片前先與核心設施討論合適的替代方式。
Q4：可以在同一片組織切片上進行正、負離子模式測試嗎？
A：
可以，但需注意：同一片組織若連續進行正、負離子模式分析，第一次分析後可能造成表面分子消耗、溶劑作用或基質改變，進而影響第二次分析的訊號品質。
因此，若樣品數量允許，建議使用相鄰連續切片分別進行正離子與負離子模式分析，以獲得較佳且較可比較的質譜訊號。
Q5：空間解析度(Pixel size) 可以自行設定嗎？
A：
可以討論，但不一定所有 pixel size 都適合每一種樣品。Pixel size 可依據研究需求、組織大小、目標分子分布特性及文獻建議進行設定。
一般而言，pixel size 越小，空間解析度越高，但分析時間也會明顯增加，且單一 pixel 可取得的訊號量可能下降。因此，過小的 pixel size 不一定能得到更好的質譜影像結果。本核心會依據樣品狀況與分析目的提供建議，但若使用非建議條件，無法保證訊號品質與影像結果皆能達到最佳狀態。