Webb estudió en la Universidad de Carolina del Norte en EE.UU., donde obtuvo una licenciatura en Educación en 1928. Posteriormente, se convirtió en subteniente del Cuerpo de Marines y fue piloto de servicio activo desde 1930 hasta 1932. Así mismo, estudió Derecho en la Universidad George Washington en EE.UU. entre 1934 y 1936; y fue admitido en el Colegio de Abogados del Distrito de Columbia en 1936.

Fue el segundo administrador de la Administración Nacional de la Aeronáutica y del Espacio, NASA quién dirigió a la NASA entre 1961 y 1968; y en donde gracias a sus habilidades en política burocrática pudo obtener apoyo ininterrumpido y los recursos necesarios para lograr el alunizaje del Apolo dentro del cronograma del presidente Kennedy.

El 27 de enero de 1967; Webb estuvo al mando cuando un incendio repentino mató a 3 astronautas de la misión Apolo-Saturno (AS) 204 durante las pruebas de simulación. Aunque el accidente manchó su reputación; la imagen de NASA y el apoyo popular no sufrieron daños significativos. Finalmente, Webb deja la NASA cuando la misión Apolo se acercaba a su finalización exitosa en 1968.