ตามโครงสร้างการบริหารงาน วิทยาเขตสุพรรณบุรี นั้น กองกลาง สำนักงานวิทยาเขตสุพรรณบุรี มีหน้าที่ความรับผิดชอบ สนับสนุนหน่วยงานภายใต้การกำกับของสำนักงานวิทยาเขตสุพรรณบุรี มีหน้าที่ความรับผิดชอบจำนวน 9 ส่วนงานตามโครงสร้างการบริหารงานของวิทยาเขตสุพรรณบุรี และงานที่ได้รับมอบหมายเพิ่มเติมจำนวน 2 ส่วนงาน รวมทั้งสิ้น 11 ส่วนงาน ดังต่อนี้