分子集団遺伝学

日本産淡水魚類の系統地理学

外来カワリヌマエビ属まわりの研究史

• DNA抽出

• PCR

• サンガーシーケンス

• 全ゲノムリシーケンス（ライブラリprep.）

• 集団構造解析いろいろ

  • PCA

  • ADMIXTURE

  • fastSTRUCTURE

  • PopCluster

  • f-statistics（admixtools2）

• 系統解析いろいろ

  • ML（IQ-TREE2，RAxML）

  • ベイズ（BEAST2）

• 歴史集団動態解析いろいろ

  • Bayesian skyline plot （BSP）

  • pairwise sequentially Markovian coalescent methods（PSMC）

  • multiple sequentially Markovian coalescent methods（MSMC）

  • sequential Markov coalescent + plenty of unlabeled samples（SMC++）

  • PopSizeABC

  • GONE

  • fastsimcoal2による集団動態モデリング

• ベイズ統計モデリング

• species distribution modeling