Les enjeux sont nombreux, et largement couverts par le cadre règlementaire et éthique :
obtenir des résultats de qualité, qui contribuent au progrès scientifique et médical et qui améliorent le quotidien des hommes et animaux = Avantages (au sens de l'évaluation éthique des projets)
respecter la sensibilité animale, c'est à dire :
éviter tout impact négatif : douleur, souffrance, angoisse et dommages durables (= Dommages, au sens de l'évaluation éthique)
contribuer au bien-être des animaux et respecter leur droit à la vie.