シカはなぜ増えた？

引用元：

Iijima, H., Nagata, J., Izuno, A., Uchiyama, K., Akashi, N., Fujiki, D., & Kuriyama, T. (2023). Current sika deer effective population size is near to reaching its historically highest level in the Japanese archipelago by release from hunting rather than climate change and top predator extinction. The Holocene, 33(6), 718-727. https://doi.org/10.1177/09596836231157063 (Original work published 2023) 

タイトル和訳：

現在の日本列島におけるニホンジカの有効集団サイズは、気候変動や頂点捕食者の絶滅ではなく、狩猟からの解放によって、歴史的な最高水準に近づきつつある。

論旨：

この論文は、北海道および兵庫県で実施されたニホンジカ（以下、シカ）のゲノム解析に基づき、過去10万年間にわたる個体数変動の主要因が、気候変動や頂点捕食者（ニホンオオカミ）の絶滅ではなく、人間の狩猟活動の強弱であることを主張しています。シカの歴史的な有効集団サイズ（Ne）を推定した結果、両地域の個体群は明治時代にあたる約100～250年前に深刻なボトルネック（個体数の急減）を経験し、Neは北海道で10分の1、兵庫県で100分の1にまで減少したことが示されました。この減少は、当時の銃規制緩和や戦争に伴う毛皮需要の増大による乱獲と強く関連していると考察されています。 その後、厳格な狩猟規制により個体数は急速に回復し、現在のNeは過去10万年間で最高水準に迫るレベルに達していることが分かりました。この歴史的な高水準が、現代における農林業被害や生態系への影響といった問題の背景にあると推測されています。

シカの個体数は通常、一定区間・面積にいるシカのカウント（例：ライトセンサス）や糞の密度などで推定されます。しかし、過去に遡ってこれらのデータを得ることはできません。 そこで本論文では、シカのゲノム情報から過去の個体数変動を推定しています。ゲノムから個体数を推定する原理の詳細な解説は省略しますが、ゲノムの特定領域を解析することで、有効集団サイズ（Ne）という個体数の指標を得ることができます。 こうして推定されたNeの変動と、古気候データ（年平均気温、年降水量）や考古学的・歴史的記録（人間の狩猟活動）とを比較し、個体数変動の要因を考察しています。

この論文では「北海道」と「兵庫県」のシカについて、歴史的なNeの動態を明らかにしています。

図2　北海道のシカ有効集団サイズの変遷（論文Figure 3から引用改変）。グラフは現在（0年）から400年前までの有効集団サイズ（Ne）の動態を示したもの（左図）と、10万年前までの動態を示したもの（右図）。各グラフとも、上辺の横軸に書いてあるのは推定されるシカの世代数。0が現在の世代、100は現在より100世代前の祖先集団を意味する。GLは世代長（シカの推定寿命のようなもの）で、このグラフは1世代4年を仮定している。世代長の仮定によって、ボトルネックが生じた年代はズレる。ボトルネックの時期はGL = 4年では100年前頃だが、GL = 14年を仮定すると250年前頃となる（詳細は論文参照）。

図3　兵庫県のシカ有効集団サイズの変遷（論文Figure 4から引用改変）。グラフの見方は図2と同じ。