古代「莊子」和「山海經」中都有記載，柚樹全株包括皮、肉、葉、籽和花都可以入藥。根據衛福部食品營養成分表，文旦有豐富的維生素C，每100克含有54.5毫克，是檸檬的1.5倍、蘋果的3倍，維生素C可以抗氧化、防止色素沉澱，也能修補身體組織。果肉並含有豐富的蛋白質、維生素B1、B2、C、P、胡蘿蔔素、鈣、磷、鐵及醣類、酒石酸、檸檬酸等成份。

從中醫的角度來看，文旦果肉有理氣化痰、潤肺清腸、補血健脾開胃等功效，咳嗽帶黏稠痰、食慾不佳的人都適合吃文旦，但若胃酸過多、患有胃食道逆流的人則要少吃。此外，因爲文旦性寒，體質本來就容易腹瀉的人也不能吃太多。

文旦和葡萄柚等同性質的水果，因為大多含有「呋喃香豆素（furanocoumarin）」，會抑制人體代謝特定藥物(降血壓、降血脂、抗心律不整、免疫抑制、部分安眠鎮靜劑與抗憂鬱藥)，使吃下去的藥在體內停留時間延長、濃度過高，有相關用藥需求者一定要特別留意，並諮詢專業醫生。

關於文旦的熱量，1顆文旦約500克，而每100克的文旦熱量約33大卡，吃一整顆文旦的熱量約150大卡，正好約等同一整日的水果需要量，所以建議食用文旦時一天大約一顆，不宜過量。

文旦皮含有漆酚類等植物性化合物，會讓皮膚表面皮脂膜代謝掉，經陽光或燈管的紫外光線照射後，皮膚會產生色素斑，通常需要好幾個月才會淡化，所以建議剝完文旦後一定要確實洗手。