Le fonctionnement du syndicat CFDT INTERCO de Loir et Cher est assuré par un Conseil Syndical et une commission exécutive dont les rôles respectifs sont bien définis :
La commission exécutive
désignée par le Conseil Syndical, comprend 1 Secrétaire, 1 Secrétaire Adjoint, 1 Trésorier, 1 Responsable syndicalisation). Il assure la gestion permanente et prend des orientations.
Le Conseil Syndical
composé de 16 membres élus en Congrès. Il valide ou pas les orientations prises en commission exécutive. Il approuve ou pas les propositions issues des différentes commissions.