Por meio de uma parceria pioneira entre o Corpo de Bombeiros Militar de Santa Catarina (CBMSC) e o Serviço de Atendimento Móvel de Urgências (SAMU) da Secretaria de Estado da Saúde (SES), o Batalhão de Operações Aéreas (BOA) foi ativado no dia 20 de janeiro de 2010, data em que atendeu a primeira ocorrência às 17h20 com o helicóptero "Arcanjo-01", um helicóptero locado, com disponibilidade contratual de 120 horas de voo, suficientes apenas para a operação veraneio daquele ano.
A ocorrência em questão tratava-se de um acidente de trânsito entre um carro e um caminhão na BR-282, com uma pessoa presa em ferragens. Somente alguns dias depois, em 2 de fevereiro daquele ano, por meio do Decreto Estadual nº 2.966, é que foi oficialmente criado e ativado o Batalhão de Operações Aéreas (BOA), com sede em Florianópolis. À bordo da aeronave estavam oficiais pilotos e praças tripulantes do CBMSC, bem como médicos e enfermeiros de voo do SAMU.
Após uma campanha junto a comunidade e autoridades, o "Arcanjo-01" permaneceu em operação com a aeronave locada. Contudo, somente em março de 2012, o helicóptero locado foi substituído por uma aeronave adquirida com recursos do estado, sendo então incorporado ao seu patrimônio e de todos os catarinenses.
Em janeiro de 2014, a primeira aeronave de asa fixa foi recebida no BOA. O avião, modelo Cessna 210 N Centurion, foi apreendido em Rondonópolis, no Mato Grosso, e cedido ao CBMSC pelo Conselho Nacional de Justiça. Denominado "Arcanjo-02", a aeronave melhorou o atendimento em casos onde a rapidez fazia toda a diferença, visto que a velocidade dos deslocamentos podia chegar agora a 300 km/h.
A logística do transporte aeromédico com o uso das aeronaves de asa fixa foi uma das formas de otimizar os recursos públicos, aumentando a sobrevida humana e favorecendo, inclusive, a disponibilidade de utilização dos leitos de UTIs disponíveis nos hospitais do estado. Ao longo dos anos, os aviões vem sendo utilizados em missões de transporte aeromédico, transporte de equipes médicas para captação e transporte de órgãos, monitoramento ambiental, transporte de tropa e de equipamentos da Força-Tarefa do CBMSC, e apoio aos diversos órgãos públicos.
Inicialmente locado para atender um período de baixa do "Arcanjo-01", um segundo helicóptero, denominado "Arcanjo-03" foi disponibilizado para atendimentos na cidade de Blumenau e região em outubro de 2015, período após o qual deixaria a população do vale desamparada.
Contudo, com a sensibilização da população, de empresários e de autoridades da região, a campanha #ficaarcanjo mobilizou as redes sociais, na tentativa de conseguir a permanência definitiva do helicóptero de resgate na cidade. Felizmente, o governador do estado à época, Raimundo Colombo, anunciou que a aeronave ficaria definitivamente em Blumenau para realizar atendimentos em todo o Vale do Itajaí, a partir de quando a base de Blumenau passou a atender as regiões do Vale do Itajaí, Litoral Norte e Planalto Norte Catarinense, com o helicóptero "Arcanjo-03", agora um aeronave adquirida pelo governo do estado e também integrada ao patrimônio da instituição.
Em 2016, ao completar seis anos de atividades, o BOA recebeu a sua quarta aeronave, um avião modelo Cessna 206, agora denominado "Arcanjo-04", também apreendido pela Justiça por tráfico de drogas, e repassado ao CBMSC para salvar vidas, atuando em paralelo ao já consolidado "Arcanjo-02".
Em julho de 2020, a Secretaria de Estado da Casa Civil disponibilizou ao CBMSC uma aeronave de asa fixa turboélice bimotora, modelo Embraer 820C "Carajá", um avião mais veloz e com maior espaço interno para o cumprimento das mais diversas missões institucionais do BOA. Chegando a atingir velocidades acima de 400 km/h, o tempo-resposta foi consideravelmente reduzido, permitindo atravessar o estado em cerca de 1h30min a partir de Florianópolis. Este avião substituiu o Cessna 210 na frota, passando a assumir a denominação "Arcanjo-02".
O incremento da família "Arcanjo" com esta aeronave trouxe novos ares principalmente ao transporte aeromédico, visto que permitia transportar um acompanhante do paciente, garantindo um atendimento mais humanizado. Além disso, o transporte passou a ser mais rápido e seguro, dispondo esta aeronave de espaço suficiente para o adequado trabalho da equipe médica, garantindo mais conforto e agilidade para as operações aeromédicas.
Em agosto de 2021, o BOA começou a operar a primeira aeronave de asa fixa pressurizada em suas missões, um Beechcraft KingAir, modelo C90Gti, denominado "Arcanjo-06". Locada pela Secretaria de Estado da Saúde (SES), a aeronave é tripulada pelos pilotos do CBMSC e médicos e enfermeiros do SAMU, garantindo o atendimento dos mais diversos pedidos de transporte aeromédico com segurança e com o melhor ambiente possível para os pacientes aerotransportados.
A partir de abril de 2024, o BOA passou a contar com duas aeronaves de asa fixa modelo Cessna Grand Caravan C208B, sendo que uma destas permaneceu lotada em Florianópolis, substituindo o seu antecessor "Arcanjo-06", e outra foi deslocada para permanecer na recém-inaugurada Companhia de Joaçaba, no meio-oeste do estado, retomando o nome "Arcanjo-04".
A parceria que existe com a Secretaria de Estado da Saúde (SES) há mais de 14 anos para a realização do Suporte Avançado da Vida com o uso das aeronaves para atender a população atendida pelo Sistema Único de Saúde (SUS) vem produzindo bons resultados. Até meados de outubro de 2023, cerca de 15.000 missões já foram executadas desde a fundação do BOA, uma marca expressiva para o CBMSC, para a saúde e para a aviação de resgate do estado.
O nome "Arcanjo" é uma homenagem ao nome do helicóptero do Corpo de Bombeiros de Minas Gerais, que teve papel fundamental no resgate de vítimas da grande enchente de 2008, que assolou o Vale do Itajaí. Em resposta ao evento crítico, foi realizada a Operação Arca de Noé, uma das maiores de socorro aéreo já montadas no país. Cerca de 30 aeronaves dos mais diversos órgãos foram empregadas na operação, sendo que o apoio do "Arcanjo" mineiro foi essencial na operação.
Por padronização, os "Arcanjos" ímpares são os helicópteros e os pares, os aviões.