丘愛鈴（2022）。「綜合活動領域教學研究中心(中學組)」二年期計畫成果報告。計畫期程：2022年1月1日至2023年12月31日。(計畫主持人)
丘愛鈴（2021）。「綜合活動領域教學研究中心(中學組)」計畫成果報告(計畫期程：2021年1月1日至2021年12月31日。計畫主持人）。
丘愛鈴（2020）。「綜合活動領域教學研究中心(中學組)」計畫成果報告(計畫期程：2020年1月1日至2020年12月31日。計畫主持人）。
丘愛鈴（2019）。教育部補助「綜合活動與生活領域教學研究中心(中學組)」成果報告(計畫期程：2019年1月1日至2019年12月31日。計畫主持人）
丘愛鈴、范師齊（2019）。驊騮騏驥、一日千里--國立高雄師範大學辦理師資生馬來西亞吉隆坡臺灣學校史懷哲計畫報告。高雄市：國立高雄師範大學師資培育與就業輔導處。
鄭淵全、張民杰、陳育霖、丘愛鈴、許育萍（2018）。107年度瑞典師資培育制度出國考察報告。國家發展委員會：公務出國報告資訊網。
丘愛鈴（2017）。日本中小學教育文化脈絡中的課程改革與教學實務啟示。科技部補助第55屆科學與技術人員國外短期研究報告書（計畫補助編號：106-2918-I-017-001）。（計畫主持人）
方德隆、丘愛鈴、朱心怡（2016）。104年永齡希望小學高師大分校「扶助國民小學弱勢家庭學生學習(補救教學)計畫」成果報告書。國立高雄師範大學教育學院。（協同主持人）
丘愛鈴、陳良傑（2015）。中小學教師專業發展評鑑教師專業習社群甄選暨講師培訓課程計畫成果報告。教育部師資培育及藝術教育司計畫編號：1030008328。（計畫主持人）
林素貞、丘愛鈴（2014）。我國特殊教育學校(班)教師授課時數標準之研究成果報告。教育部國民及學前教育署計畫編號：1030044564。（協同主持人）
丘愛鈴（2013）。十二年國民基本教育領域/學科學習內容研究（整合型計畫）子計畫八：十二年國民基本教育綜合活動領域綱要內容之前導研究成果報告。國家教育研究院計畫編號：NAER-102-06-A-1-02-08-1-17。（子計畫共同主持人）
丘愛鈴（2012）。中小學課程發展之相關基礎性研究之後期中等教育—高中課程發展基礎研究（整合型計畫）子計畫四：探討高中課程與大學入學考試之關係成果報告。國家教育研究院計畫編號：NAER-100-20-A-1-01-00-3-01。（子計畫主持人）
丘愛鈴（2009）。中小學綜合活動、健體領域課程綱要實施相關研究之後設分析成果報告。國家教育研究院籌備處委託專案計畫成果報告。（計畫主持人）
林素貞、丘愛鈴、莊勝義（2008）。身心障礙學生升學大專校院加分優待可行性分析。教育部計畫編號：970104123。（共同主持人）
丘愛鈴（2007）。綜合活動學習領域的課程理解與教學實踐—批判教育學觀點成果報告。國科會計畫編號：NSC 95-2413-H-017-005。（計畫主持人）
何青蓉、丘愛鈴（2007）。我國人口結構變遷與教育政策之研究（整合型計畫）子計畫七：新移民教育發展之研究成果報告。教育部計畫編號：PG9506-0649。（協同主持人）
張新仁、方德隆、丘愛鈴（2007）。研訂大學校院師資培育中心自我評鑑指引成果報告。教育部中教司委託專案計畫成果報告。（共同主持人）
張新仁、丘愛鈴、張淑美、魏慧美（2006）。大專校院推動生命教育成效與特色之調查研究成果報告。教育部教研會委託專案計畫成果報告。（協同主持人）
丘愛鈴（2006）。大學與國民中小學攜手合作九年一貫課程與教學深耕攜手計畫：學校本位課程發展、實施與評鑑之行動研究—以高雄市左營區福山國小國民小學綜合活動學習領域第三階段為例成果報告。教育部專案計畫成果報告。（協同主持人）
方德隆、丘愛鈴（2005）。九年一貫課程教科書評鑑專案計畫：綜合活動學習領域教科書評鑑。國家教育研究院籌備處委託專案計畫成果報告。（共同主持人）
丘愛鈴（2005）。我國大學多元入學方案改革政策之社會學評析。國科會計畫編號：NSC 93-2413-H-017-017。（計畫主持人）
丘愛鈴（2003）。我國中小學教師師資職前教育課程教育專業科目及學分審核原則成果報告。教育部中教司委託專案計畫。（協同主持人）