Universitas Papua (UNIPA) memiliki akreditasi institusi dengan peringkat Baik Sekali berdasarkan SK No. 296/SK/BAN-PT/Akred/PT/VI/2022 dari BAN-PT, yang berlaku dari tahun 2022 hingga 2027. Pencapaian ini menunjukkan pengakuan resmi atas kualitas pendidikan, manajemen, dan reputasi UNIPA sebagai salah satu perguruan tinggi terkemuka di Indonesia, khususnya di wilayah Papua 

Program Studi Teknik Sipil Universitas Papua (UNIPA) memiliki akreditasi dengan peringkat Baik berdasarkan SK No. 560/SK/BAN-PT/Ak/S/II/2023 dari BAN-PT, yang berlaku dari tahun 2023 sampai tahun 2028. Status akreditasi ini menunjukkan bahwa program studi telah memenuhi standar kualitas pendidikan tinggi yang ditetapkan oleh BAN-PT (Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi) dalam aspek akademik, manajemen, dan penyelenggaraan pembelajaran.