As agências de fomento CAPES, CNPq e FAPESP concedem bolsas de mestrado e doutorado para incentivar a formação de recursos humanos de alto nível e o desenvolvimento da pesquisa científica e tecnológica. A concessão das bolsas está sujeita à disponibilidade de recursos e à regulamentação de cada agência. O PPG-FEAGRI possui uma Norma Interna (NI) para Atribuição de Bolsas, que estabelece os critérios e procedimentos para a distribuição das bolsas sob responsabilidade do Programa.

A UNICAMP conta também com a Diretoria Executiva de Apoio e Permanência Estudantil (DEAPE), principal órgão de apoio à permanência estudantil na Universidade, que desenvolve ações voltadas a favorecer as condições de permanência dos estudantes e a conclusão de sua formação acadêmica.