O Programa de Pós-Graduação em Engenharia Agrícola da FEAGRI/UNICAMP realiza processos seletivos duas vezes por ano: no meio do ano, exclusivamente para o Doutorado, e no final do ano, para Mestrado e Doutorado.

As vagas são distribuídas entre as sete Áreas de Concentração do Programa: Agricultura Digital, Água e Solo, Construções Rurais e Ambiência, Gestão de Sistemas na Agricultura e Desenvolvimento Rural, Máquinas Agrícolas, Métodos Não Destrutivos, e Tecnologia Pós-Colheita. A oferta em cada processo seletivo depende da disponibilidade dos orientadores, conforme o quadro de vagas do edital. Ao se inscrever, o candidato deve indicar o orientador pretendido, considerando a afinidade de sua proposta com as respectivas linhas de pesquisa.

A seleção é composta por três fases eliminatórias: Fase 1. avaliação do perfil do candidato e do plano de pesquisa, Fase 2. análise do currículo e do histórico escolar, e Fase 3. entrevista. Recomenda-se o contato prévio com o orientador de interesse. As vagas, os prazos, a documentação e os critérios de avaliação são divulgados nos editais de cada processo seletivo. As inscrições são realizadas on-line, com envio da documentação exigida.