Também o mármore é um elemento de destaque e de grande recurso, que reflecte a preocupação pela modernização dos espaços, superando o gosto pela talha. É neste sentido, que se pode encontrar exemplares de diversas tonalidades na capela-mor, que data de 1690, e que se estendem até à abóboda de caixotões. No retábulo, encontram-se, igualmente, marmóreos finos, atribuídos a João Antunes, por terem grandes semelhanças com outros traçados pelo arquitecto de D. Pedro II.