Удобно использовать 3 буквы, пока не привыкнешь к 1 буквенному коду
from http://ru.wikipedia.org/wiki/Аминокислоты
Часто для запоминания однобуквенного обозначения используется мнемоническое правило (последний столбец)
Помимо этих аминокислот, называемых стандартными, в некоторых белках присутствуют специфическиенестандартные аминокислоты, являющиеся производными стандартных. В последнее время к стандартным аминокислотам иногда причисляют селеноцистеин (Sec, U) и пирролизин (Pyl, O).