講演・発表・講義

【講演】

荒木通啓「AI技術が切り拓くデジタルヘルス・ニュートリション」医療・健康おおさか産学官連携フォーラム2024（2024.1.24 千里ライフサイエンス）
Michihiro Araki「The Outlook of AI/ML Technology in Biocatalytic Research」3rd Applied Biocatalysis Summit（2023.12.6 Philadelphia）
荒木通啓「健康・栄養分野におけるAI・情報解析技術の展開」第24回イノベーションカフェ（2023.4.20 健都）
Michihiro Araki「AI nutrition: Application of AI technology in nutrition field」ICN TOKYO 2022 （2022.12.7 東京国際フォーラム、東京）
荒木通啓「健康・栄養分野におけるAI・情報解析技術の展開」LINC 兵庫県・神戸市セミナー（2022.11.14 神戸）
荒木通啓「代謝知識のデジタル化技術の進展」第74回日本生物工学会大会（2022.10.20 オンライン）
Michihiro Araki「Machine learning techniques for functional annotation of enzyme sequences」ACB-ISBE 2022 （2022.10.4 オンライン）
荒木通啓「人工知能による酵素の発見」バイオインダストリー協会・新資源生物変換研究会・2022年度オンライン勉強会（2022.9.20 オンライン）
荒木通啓「代謝設計技術の展開」一般社団法人先端バイオ工学推進機構「化学・素材・燃料分科会」第15回会合講演会（2022.7.25 オンライン）
荒木通啓「代謝パスウェイの知識拡張」理研インフォマティクス・データ科学推進プログラム成果報告会（2021.3.8 オンライン）
荒木通啓「物質生産における代謝経路デザイン」東レ講演会（2021.3.1 オンライン）
荒木通啓「健康長寿に資する健康・栄養関連データとAI技術の展開」関西大リビングラボ共創カフェ（2021.2.25 オンライン）
荒木通啓「AI栄養機能プロジェクト」ILSI Japan 特別シンポジウム（2021.2.24 オンライン）
荒木通啓「代謝関連情報解析とその展開」IIBMP2020（2020.9.2 オンライン）
荒木通啓「AI技術の健康・栄養分野への展開」ILSI Japan 先端技術シンポジウム（2020.2.21 日本橋公会堂、東京）
荒木通啓「健康・栄養分野におけるAI活用に向けて」医薬基盤研 AI健康・医薬研究センターキックオフシンポジウム（2020.2.3 千里ライフサイエンスセンター、大阪）
荒木通啓「拡大するバイオエコノミー」上海復旦大学セミナー（2019.10.15 上海）
荒木通啓「代謝パスウェイのエンコーディング・デコーディング」第66回日本生化学会近畿支部例会（2019.5.25 京都大学宇治キャンパス、京都）
荒木通啓「代謝デザインのデジタル化」第6回SBJシンポジウム（2019.5.24 千里ライフサイエンスセンター、大阪）
荒木通啓「データサイエンスの応用と展開」国立健康栄養研究所セミナー（2019.4.16 国立健康栄養研究所、東京）
荒木通啓「ゲノムのプロット」ゲノム未来会議4.0 （2019.2.8 慶応大学、鶴岡）
荒木通啓「ゲノム合成・合成生物学の現状と展望」日本生命倫理学会第30回年次大会（2018.12.8 京都府立大学、京都）
荒木通啓「情報視点の代謝経路デザイン」JACI 社団法人新化学技術推進協会ライフサイエンス技術部会反応分科会講演会（2018.11.22 新化学技術推進協会、東京）
荒木通啓「合成生物学・創薬におけるインフォマティクスの必然性」九州工業大学セミナー（2018.11.15 九州工業大学、飯塚）
荒木通啓「バイオロジクスの生産プロセスにおけるIT/AI技術の活用」BioJapan 2018 / 再生医療JAPAN 2018 主催者セミナー（2018.10.11 パシフィコ横浜、横浜）
武田志津、伊藤潔人、荒木通啓「スマートセル開発を加速するAIの開発に向けた取組み」第70回日本生物工学会大会（2018.9.7 関西大学千里山キャンパス、吹田）
荒木通啓「スマートセル開発に向けた情報解析技術」第36回日本植物細胞分子生物学会（2018.8.26 金沢商工会議所、金沢）
油谷幸代、荒木通啓「スマートセル実現のための情報解析システムの構築」バイオで切り拓くモノづくりの新潮流～スマートセル創出プラットフォームの構築と実証～（第20回新産業技術促進検討会）（2018.7.19 TKPガーデンシティPREMIUM神保町、東京）
Michihiro Araki「Genome Design」Mini-Symposium "Toward the Future of Genome Architecture"（2017.12.11 Tokyo Tech、Tokyo）
Michihiro Araki「Bioinformatics analyses for designing synthetic metabolic pathways」The 8th Kobe University Brussels European Centre Symposium（2017.11.21 Vrije Universiteit Brussel、Brussels）
荒木通啓「代謝パスウェイ設計・解析におけるAI活用」発酵と代謝研究会平成29年度第１回勉強会（2017.10.2 バイオインダストリー協会、東京）
荒木通啓「代謝経路デザインの限界」第11回日本ゲノム微生物学会年会（2017.3.3 慶応義塾大学、藤沢）
荒木通啓「スマートセル開発に向けたIT/AI技術の展望」産業構造審議会商務流通情報分科会バイオ小委員会（第4回）（2016.4.18 経済産業省、東京）
荒木通啓「In Silico代謝設計ツールの開発とその展開」農芸化学会2016年度大会（2016.3.30 札幌コンベンションセンター、札幌）
荒木通啓「代謝デザインの展開」第1回デザイン生命工学研究会（2016.3.8 東京工業大学）
Michihiro Araki「Expanding the Scope of Metabolic Pathway In Silico」The 7th International Symposium of Innovative BioProduction Kobe (iBioK)（2016.1.27 神戸大学、神戸）
荒木通啓「バイオ生産プロセスの効率化に向けた情報解析アプローチの紹介」長瀬産業セミナー（2015.3.16 神戸）
荒木通啓「代謝設計基盤（M-path）によるバイオ合成スコープの拡張」合成生物工学シンポジウム（2014.11.25 神戸大学・統合拠点、神戸）
Michihiro Araki「Computational platform for designing synthetic metabolic pathways」7th International Congress on Biocatalysis（2014.9.3 Hamburg University of Technology, Hamburg）
Michihiro Araki「Expanding the Scope of Metabolic Pathway In Silico」セミナー（2014.3.11 東京工業大学・地球生命研究所、東京）
荒木通啓「知識拡張による代謝デザインとその展開」生物工学技術セミナー（2014.1.15 神戸大学、神戸）
荒木通啓「代謝パスウェイ情報の抽象化と具体化」酵素工学研究会第70回講演会（2013.10.25 東京大学・山上会館、東京）
Michihiro Araki「A Knowledge-Based Approach for Metabolic Pathway Design」Enzyme Engineering XXII Session (Co-Chair) : Bioinformatics and Systems Biology（2013.9.23 Toyama International Conference Center, Toyama）
荒木通啓「代謝パスウェイデータベースからの知識抽出」第65回生物工学会大会シンポジウム（2013.9.18 広島国際会議場、広島）
荒木通啓「インフォマティクスを糸口とした合成生物工学の展開」生物工学会東日本支部生物工学フォーラム（2013.7.19 東京農工大学、東京）
荒木通啓「細胞工場の設計」第2回iBioK部門会（2013.3.13 神戸大学、神戸）
荒木通啓「代謝パスウェイ知識の拡張に向けた情報解析技術の開発」第14回生物工学研究センターセミナー（2013.2.14 富山県立大学、富山）
荒木通啓「多様な代謝パスウェイの In silico デザイン」第2回代謝工学研究部会（2012.11.29 大阪大学、大阪）
荒木通啓「代謝設計基盤のポテンシャル」「細胞を創る」研究会5.0（2012.11.22 東京工業大学、横浜）
荒木通啓「化学品のバイオ生産に向けた設計プラットフォームの構築」セミナー（2012.10.10 三菱化学科学技術センター、横浜）
荒木通啓「人工代謝経路の設計基盤の構築」セミナー（2012.6.15 九州大学、福岡）
荒木通啓「化学品のバイオ生産に向けた設計プラットフォームの構築」セミナー（2012.1.25 三菱化学科学技術センター、横浜）
荒木通啓「医薬資源の生産に向けたバイオプロセスの設計」セミナー (2011.11.15 熊本大学、熊本)
荒木通啓「合成生物事始め」セミナー（2011.3.5 三菱化学科学技術センター、横浜）
荒木通啓「Retrobiosynthesisに向けた天然化合物のアーキテクチャ解析」第3回医薬品研究会 (2010.8.2 東京大学医科学研究所、東京)
荒木通啓「生体ネットワーク解析（KEGG）」バイオインフォマティクス速習コースII (2009.11.27 生命情報工学研究センター、東京)
荒木通啓「From Building Blocks to Architecture」セミナー (2009.1.29 京都大学、京都)
荒木通啓「生体ネットワーク解析（KEGG）」バイオインフォマティクス速習コースII (2008.11.28 生命情報工学研究センター、東京)
荒木通啓、渡邊真理、岡部悦子、金久實「KEGG/JAPIC 医薬品データベース」Symposium on Bioinformatics and Chemical Genomics (2007.9.20 メルパルク京都、京都)
荒木通啓「Synthetic Biology の展開：遺伝子ネットワークの構築からケモゲノミクス研究へ」第1回ケモゲノミクス研究会 (2004.9.3 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「Synthetic Biologyの展開」第37回若手ペプチド夏の勉強会 (2004.8.9 京都府立ゼミナールハウス、京都)
荒木通啓「遺伝子制御ネットワークの構築」創薬科学セミナー (2004.1.23 熊本大学、熊本)

【発表】

Higuchi, C., Martin-Morales, A., Oya, A., Ikkai, M., Inoue, M., Mizuguchi, K. and Araki, M. "Toward the Construction of a Knowledge Graph from Japanese Food Ontology for the Prevention of Frailty" IJCKG 2023 (2023.12.8-9 Tokyo)
Dawadi, R., Inoue, M., Ting tay, J., Martin-Morales, A., Vu, T. and Araki, M. "Combination of Smartphone Features and Machine Learning Methods for Healthcare Purposes: A Literature Review" GIW ISCB ASIA 2023 (2023.11.18-20 Singapore)
Martin-Morales, A., Yamamoto, M., Inoue, M., Dawadi, R., Vu, T. and Araki, M. "Machine Learning Models for Prediction of Cardiovascular Disease Mortality using Demographics, Dietary Features and Blood Biomaekers" GIW ISCB ASIA 2023 (2023.11.18-20 Singapore)
Higuchi, C., Martin-Morales, A., Inoue, M., Yamamoto, M., Mizuguchi, K. and Araki, M. "Japanese food ontology and knowledge graph as its application" CBI学会2023 (2023.10.23-26 Tokyo)
Watanabe, N., Kuriya, Y., Murata, M., Yamamoto, M. Shimizu, M and Araki, M. "Extraction of Different Protein Features Among Multiple Deep Learning Models for Protein Annotations" The 16th Asian Congress on Biotechnology (2023.10.17 Vietnam)
Kuriya, Y., Murata, M., Yamamoto, M., Watanabe, N. and Araki, M. "Identigying Important Fluxes by Flux Variation Generation" The 16th Asian Congress on Biotechnology (2023.10.17 Vietnam)
山本昌輝、渡邉直暉、厨祐喜、荒木通啓「代謝モデルバリエーション生成技術～酵素のStyle情報と代謝バリエーションの利活用～」 NEDO バイオものづくり分野マッチング会 (2023.10.10 Tokyo)
荒木通啓「LINC・WG01紹介」LINC ショーケース（2023.7.3 大阪）
Wong, JE., Yamaguchi, M., Nishi, N., Araki, M., Wee, LH.「Predicting Overweight and Obesity Status among Malaysian Adults using Supervised Machine Learning」 ICN TOKYO 2022 （2022.12.7 東京国際フォーラム、東京）
樋口千洋、櫛田達矢、畠中秀樹、長尾知生子、古崎晃司、荒木通啓、水口賢司「食品オントロジーの構築」第58回SWO研究会（2022.11.22　東京）
荒木通啓「LINC・WG01紹介」LINC ショーケース（2022.11.21 オンライン）
樋口千洋、櫛田達矢、畠中秀樹、長尾知生子、古崎晃司、荒木通啓、水口賢司　「食品オントロジーの展開」第48回BMSコンファレンス（2022.10.24　奈良）
渡邉直暉, 山本昌輝, 村田昌浩, Vavricka Christopher, 荻野千秋, 近藤昭彦, 荒木通啓「広範な酵素反応予測のための機械学習モデルの開発」第74回日本生物工学会大会（2022.10.20 オンライン）
厨祐喜、荒木通啓「代謝バリエーション生成技術」BioJapan 2022（2022.10.13 パシフィコ横浜、横浜）
樋口千洋、櫛田達矢、畠中秀樹、長尾知生子、古崎晃司、荒木通啓、水口賢司「食品オントロジーの構築」トーゴーの日シンポジウム2022 （2022.10.5 オンライン）
樋口千洋、櫛田達矢、畠中秀樹、長尾知生子、古崎晃司、荒木通啓、水口賢司「国民健康栄養調査食品群の食品オントロジーの構築」トーゴーの日シンポジウム2022 （2022.10.5 オンライン）
荒木通啓「健康・栄養分野におけるAI・情報解析のポテンシャル」令和４年度研究交流会セミナー（2022.9.5 健康栄養研）
Higuchi, C., Kushida, T., Yatsuzuka, S., Hatanaka, H., Nagao, C., Araki, M., and Mizuguchi, K.「Japanese food ontology」The Integrated Food Ontology Workshop 2022（2022.8.15-19 オンライン）
竹村美保、久保亜希子、渡邉あすか、作野華誉、美濃部侑香、佐原健彦、村田昌浩、荒木通啓、原田尚志、寺田喜信、矢追克郎、大段光司、三沢典彦「大腸菌によるルテイン高生産システムの開発」日本農芸化学会2022年度大会（2022.3.16 オンライン）
中澤志織、今一修、小暮高久、久保田健、須田雅子、豊田晃一、乾将行、伊藤潔人、白井智量、荒木通啓　「DBTLサイクル加速に向けた、設計履歴・文献情報による「次の一手」の遺伝子改変提案技術」第44回日本分子生物学会年会（2021.12.2 横浜）
樋口千洋、櫛田達矢、八塚茂、畠中秀樹、長尾知生子、荒木通啓、水口賢司　「国民健康・栄養調査食品群のオントロジー構築」　トーゴーの日シンポジウム2021（2021.10.5 オンライン）
山口美輪、荒木通啓、西信雄、野尻哲也、花井章剛、成澤翔大、内山美弥、各務恵理菜「料理レシピデータにおける人工知能（AI）・機械学習技術を用いた和食、中華、洋食の特徴解析」第68回日本栄養改善学会（2021.10.4 オンライン）
樋口千洋、櫛田達矢、畠中秀樹、長尾知生子、古崎晃司、荒木通啓、水口賢司「食品オントロジーの製作」第58回SWO-054 （2021.8.4）
伊藤潔人、荒木通啓「文献・公開データからの知識抽出によるスマートセル設計提案技術」日本化学会第101春季年会（2021.3.22 オンライン）
荒木通啓「研究紹介」NITE 第２回生物資源情報充実化戦略検討委員会（2021.3.2 オンライン）
荒木通啓「AI栄養プロジェクト」研究発表会（2020.12.11 医薬基盤・健康・栄養研究所、東京）
荒木通啓「AI栄養事始め」健康栄養研究所セミナー（2020.8.27 健康栄養研究所、東京）
高久洋暁，山崎晴丈，小笠原渉，矢追克郎，荒木秀雄，荒木通啓，油谷幸代「機能性油脂生産へ向けた情報科学を利用した油脂酵母の改良」日本農芸化学会2020年度大会（2020.3）
Kuriya, Y., Ohyama, A., Shirai, T. and Araki, M.「 Investigation of pathway characterization with kinetic model for pathway optimization and selection in bio-production」The 5th Annual Meeting of Living Systems Design Research（2020.3）
厨祐喜，白井智量，荒木通啓「微生物ゲノムスケール代謝モデルの構築における酵素タンパク質の細胞内局在予測手法の影響」第14回日本ゲノム微生物学会年会（2020.3）
厨祐喜，白井智量，荒木通啓「キネティックモデルを用いた有用物質生合成経路の最適化のための経路特性の調査」第42回日本分子生物学会年会（2019.12 マリンメッセ福岡, 福岡）
伊藤潔人, 中澤志織, 今一修, 厨祐喜, 村田昌浩, 荒木通啓「文献等からの知識抽出・学習技術」BioJapan 2019（2019.10.9-11 パシフィコ横浜、横浜）
荒木通啓「文献等からの知識抽出・学習技術」BioJapan 2019（2019.10.9-11 パシフィコ横浜、横浜）
荒木通啓「プロトタイプ酵素探索」SIP「スマートバイオ産業・農業基盤技術」WG3（2019.10.8 理研日本橋、東京）
厨祐喜，大山彰，白井智量，荒木通啓「Streptomyces 属放線菌における有用物質生産に資する代謝モデルの構築」第34回日本放線菌学会大会（2019.9.24 北海道大学, 北海道）
渡邉直暉、村田昌浩、荻野千秋、近藤昭彦、荒木通啓「基質酵素反応予測のための機械学習に基づく予測モデルの構築方法の探索と評価」第71回日本生物工学会大会（2019.9.18 岡山大学、岡山）
荒木通啓「プロトタイプ酵素探索」SIP「スマートバイオ産業・農業基盤技術」WG3（2019.7.31 理研日本橋、東京）
荒木通啓「FBA解析」NEDO検討会（2019.8.16 福岡県醤油醸造組合、福岡）
荒木通啓「文献・公開・測定データを利用した知識ベースの開発」NEDOスマートセルプロジェクト全体会議（2019.5.21 神戸大学、神戸）
田邉麻衣子、伊藤潔人、今一修、武田志津、柘植謙爾、荒木通啓「人工代謝経路を実現するDNA配列提案技術の開発」日本農芸化学会2019年度大会（2019.3 東京）
仲谷豪、嘉悦佳子、仲島菜々実、野口祐司、石井伸佳、厨祐喜、白井智量、荒木通啓、曽田匡洋「エルゴチオネイン発酵法開発におけるヒスチジン合成制御系の解除と代謝モデルの活用」日本農芸化学会2019年度大会（2019.3 東京）
厨祐喜、大山彰、白井智量、荒木通啓「疑似的なdFBAを用いた微生物による有用物質生産の改善方策とその有効性の検証」日本農芸化学会2019年度大会（2019.3 東京）
厨祐喜、大山彰、白井智量、荒木通啓「代謝モデルの構築における補酵素および反応熱力学に関する修正・制約の妥当性および汎用性」第41回日本分子生物学会年会（2018.11 横浜）
伊藤潔人、荒木通啓「文献情報等の公開データからの知識整理を補完するデータ処理・AI基盤技術の研究開発」BioJapan 2018（2018.10.10-12 パシフィコ横浜、横浜）
村田昌浩、藤花佐依子、荒木通啓「新規代謝経路の設計・最適化手法の開発 / 反応機構推定に基づく酵素選択」BioJapan 2018（2018.10.10-12 パシフィコ横浜、横浜）
厨祐喜、荒木通啓「代謝モデル構築・解析技術の開発と実用微生物への技術展開」BioJapan 2018（2018.10.10-12 パシフィコ横浜、横浜）
厨祐喜、大山彰、荒木通啓「配列データおよび反応データベースを用いた微生物代謝モデルの自動構築・ツールについて」トーゴ―の日シンポジウム2018（2018.10.5 東京）
Kuriya, Y., Ohyama, A., Shirai, T. and Araki, M.「Improvement of prediction accuracy by metabolic model using experimental data to improve microbial production of valuable chemicals.」IIBMP2018（2018.9.19-21 鶴岡）
Ito, K., Araki, M., Hanai, T., Shirai, T., Tsuge K. and Takeda, S.「Artificial Intelligence Technologies Extracting Design Knowledge for Creation of Highly Productive Microorganisms.」ECCB2018（2018.9.8-12 Athens, Greece）
Kuriya, Y., Ohyama, A., Shirai, T. and Araki, M.「Validation and prediction accuracy improvement with experimental data on reconstructed metabolic model for bioproductions.」ECCB2018（2018.9.8-12 Athens, Greece）
厨祐喜、大山彰、荒木通啓「微生物による有用物質生産に資する代謝モデルの実験データを用いた妥当性検証と予測精度の改善」第70回日本生物工学会大会（2018.9.6 関西大学千里山キャンパス、吹田）
渡邉直暉、村田昌浩、荻野千秋、近藤昭彦、荒木通啓「機械学習を用いた酵素のEC number 予測」第70回日本生物工学会大会（2018.9.6 関西大学千里山キャンパス、吹田）
伊藤潔人、荒木通啓「文献データ等からのデータ処理技術と知識ベースならびに人工知能（AI）基盤技術の開発」バイオで切り拓くモノづくりの新潮流～スマートセル創出プラットフォームの構築と実証～（第20回新産業技術促進検討会）（2018.7.19 TKPガーデンシティPREMIUM神保町、東京）
Shirai, T., Noda, S. and Araki, M.「Optimization of isobutanol production in Escherichia coli based on genome engineering 」Genome Engineering: Cutting-Edge Research and Applications（2018.6.24-28 Hilton Metropole Florence、Florence）
荒木通啓、伊藤潔人、白井智量、花井泰三、柘植謙爾「全体説明」NEDO「文献情報等の公開データからの知識整理を補完するためのデータ処理・AI基盤技術の研究開発」全体会議（2018.6.12 神戸大学、神戸）
村田昌浩、Christopher Vavricka、荒木通啓「酵素選定技術方法の開発」NEDO「植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発／高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発」全体会議（2018.6.12 神戸大学、神戸）
荒木通啓「全体説明」NEDO「文献情報等の公開データからの知識整理を補完するためのデータ処理・AI基盤技術の研究開発」C02ミーティング（2018.4.5 神戸大学、神戸）
厨祐喜,、大山彰、荒木通啓「微生物による有用物質生産の改善に資する代謝モデルの反応データベースおよび配列データからの自動構築」日本農芸化学会2018年度大会（2018.3.18 名城大学、名古屋）
厨祐喜,、大山彰、荒木通啓「ゲノム配列および反応データベースを用いた有用物質生産の主要バクテリア宿主の代謝モデル構築」第12回日本ゲノム微生物学会年会（2018.3.7 京都大学、京都）
Watanabe, N., Murata, M., Ogino, C., Kondo, A. and Araki, M.「Machine Learning prediction of EC number of enzymes」The 9th International Symposium of Innovative BioProduction Kobe (iBioK)（2018.2.1 神戸大学、神戸）
荒木通啓「文献データ等からのデータ処理技術と知識ベースならびに人工知能（AI）基盤技術の開発」スマートセルプロジェクト技術推進委員会（2018.1.31 NEDO、川崎）
荒木通啓「代謝系を設計する情報解析技術の開発」スマートセルプロジェクト技術推進委員会（2018.1.30 NEDO、川崎）
荒木通啓 NEDO「文献情報等の公開データからの知識整理を補完するためのデータ処理・AI基盤技術の研究開発」チーム会合（2017.12.21 九州大学、福岡）
荒木通啓、亀田倫史「酵素反応・代謝経路推定プラットフォームの紹介」NEDO「植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発／高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発」全体会議（2017.11.30 産総研つくばセンター、つくば）
荒木通啓、白井智量、柘植謙爾「代謝モデルの構築・解析技術の開発」NEDO「植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発／高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発」全体会議（2017.11.30 産総研つくばセンター、つくば）
荒木通啓、白井智量「新規代謝経路の設計・最適化手法の開発」NEDO「植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発／高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発」全体会議（2017.11.30 産総研つくばセンター、つくば）
荒木通啓、伊藤潔人、白井智量、花井泰三、柘植謙爾「全体説明」NEDO「文献情報等の公開データからの知識整理を補完するためのデータ処理・AI基盤技術の研究開発」全体会議（2017.11.29 産総研つくばセンター、つくば）
村田昌浩、藤花佐依子、荒木通啓「新規代謝経路の設計・最適化手法の開発 / 反応機構推定に基づく酵素選択」BioJapan 2017（2017.10.11-13 パシフィコ横浜、横浜）
厨祐喜、荒木通啓「代謝モデル構築・解析技術の開発と実用微生物への技術展開」BioJapan 2017（2017.10.11-13 パシフィコ横浜、横浜）
小川哲平、牧口大旭、荒木通啓「拡張代謝パスウェイデータベース「M-path」の構築」トーゴーの日シンポジウム2017（2017.10.5 東京大、東京）
荒木通啓「全体説明」NEDO「文献情報等の公開データからの知識整理を補完するためのデータ処理・AI基盤技術の研究開発」キックオフミーティング（2017.10.3 京都大学日本橋サテライトオフィス、東京）
Ogawa, T., Makiguchi, H. and Araki, M.「Development of Extension Pathway for Human-Specific Metabolic Reactions」第6回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2017)（2017.9.28 北海道大、札幌）
厨祐喜、荒木通啓「Construction of metabolic model using genomic sequence and reaction database for improving valuable chemical productions by microorganisms」第 6回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2017)（2017.9.28 北海道大、札幌）
厨祐喜、荒木通啓「大腸菌による有用物質生産の改善のためのコアモデルの構築」第69回日本生物工学会大会（2017.9.13 早稲田大、東京）
荒木通啓「酵素反応・代謝経路推定プラットフォームの紹介」NEDO「植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発／高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発」神戸ワークショップ（2017.8.28 神戸大、神戸）
厨祐喜、荒木通啓「代謝モデルの構築・解析技術の開発」NEDO「植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発／高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発」神戸拠点会議（2017.7.19 神戸大、神戸）
村田昌浩、荒木通啓「新規代謝経路の設計・最適化手法の開発」NEDO「植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発／高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発」神戸拠点会議（2017.7.19 神戸大、神戸）
荒木通啓「C01テーマにおける情報解析技術」NEDO 第２回植物テーマ連携推進会議（2017.7.12 NEDO、川崎）
荒木通啓「代謝系を設計する情報解析技術の開発」NEDO「植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発／高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発」全体会議（2017.3.30-31 神戸大、神戸）
荒木通啓「代謝経路設計・オミクス解析の近況紹介」iBioK・平成28年度第2回部門会（2017.3.9 神戸大学、神戸）
荒木通啓「代謝系を設計する情報解析技術の開発」スマートセルプロジェクト技術推進委員会（2017.1.31 NEDO、川崎）
荒木通啓「代謝系を設計する情報解析技術の開発」NEDO「植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発／高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発」神戸拠点会議（2016.12.13-14 神戸大、神戸）
牧口大旭、小川哲平、荒木通啓「バイオプロセスデザインプラットフォームの構築」第39回日本分子生物学会（2016.12.1 パシフィコ横浜、横浜）
荒木通啓「情報系セミナー：代謝系を設計する情報解析技術の開発」NEDO「植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発／高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発」産総研拠点会議（2016.11.21 産総研、東京）
足立亨介、杉岡茉美、Prasert Tongnunui、荒木通啓、森岡克司、池島耕「マングローブクラブ腸内細菌とその生息土壌の持つセルロース分解活性」第22回日本マングローブ学会大会（2016.11.16 東京農業大、東京）
荒木通啓「代謝デザインとその展開」人工細胞に関する合同セミナー（2016.11.16 神戸大、神戸）
Adachi, K., Kawai, K., Araki, M., Tongnunui, P., Morioka, K., Ikejima, K. "RNA seq analysis of hepatopancreas of mangrove crab Episesarma versicolor" CESE-2016 Biotechnology (2016.11.6-10 Kaohsiung, Taiwan).
荒木通啓「GDCワーキンググループ進捗状況」TRAHED・第1回研究開発推進委員会（2016.10.11 経済産業省、東京）
Ogawa, T., Makiguchi, H. and Araki, M. "Development of Design Platform for Metabolic Pathways" 生命医薬情報学連合大会2016年大会（2016.9.29-30 東京国際交流館プラザ平成、東京）
許漢修、荒木通啓、蓮沼誠久、河野愛子、近藤昭彦「バイオ医薬生産に向けたCHO細胞培養情報データ解析システムの構築」第68回日本生物工学会（2016.9.30 富山国際会議場、富山）
荒木通啓「代謝系を設計する情報技術の開発」NEDO PJ・キックオフ会議（2016.9.9 神戸大学、神戸）
許漢修、荒木通啓、蓮沼誠久、河野愛子、近藤昭彦「モデル化による生産性強化技術の開発ー CHO細胞培養情報データ解析システムの構築」MAB・第3回進捗状況報告会（2016.9.2-4 葉山、神奈川）
荒木通啓「GDCワーキンググループ進捗状況」TRAHED・第1回研究討論会（2016.7.12 庄内産業振興センター、鶴岡）
江口晃一、工藤基徳、荒木通啓、石井純、山本浩明、近藤昭彦「大腸菌における1,4-ブタンジオール人工生合成経路の構築」農芸化学会2016年度大会（2016.3.30 札幌コンベンションセンター、札幌）
荒木通啓、牧口大旭、小川哲平、近藤昭彦「インシリコ代謝経路設計基盤の展開」日本薬学会第136回年会（2016.3.28 横浜）
荒木通啓「GDCワーキンググループ進捗状況」TRAHED・第2回研究開発推進委員会（2016.3.7 経済産業省、東京）
荒木通啓「M-path近況紹介」セミナー（2016.3.4 三菱化学科学技術センター、横浜）
荒木通啓「GDCワーキンググループ進捗状況」TRAHED・第2回研究討論会（2016.2.4 神戸大学統合研究拠点、神戸）
牧口大旭、小川哲平、近藤昭彦、荒木通啓「M-Path＆PathPod：バイオプロセスデザインプラットフォームと統合型パスウェイデータベースシステム」第38回分子生物学会（2015.12.2 神戸）
荒木通啓「研究・技術紹介」第１回マルチスケール計算生物学研究会（2015.11.19 神戸大学、神戸）
小川哲平、牧口大旭、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、荒木通啓「M-path Database: Navigating Potential Metabolic Pathways」生命医薬情報学連合大会2015年大会（2015.10.29 京都大学、宇治）
南部由美子、崎濱由梨、荒木通啓、蓮沼誠久、近藤昭彦「Prediction of transcription regulator network of carbohydrate metabolism in Saccharomyces cerevisiae」第67回日本生物工学会（2015.10.26 城山観光ホテル、鹿児島）
荒木通啓「人工代謝経路のスコープの拡張」新学術領域研究・第６回全体会議（2015.10.5 九州大学、福岡）
Ogawa, T., Makiguchi, H., Cox III, RS., Nakatsui M., Kondo, A., Araki, M. "Development of M-path platform for Navigating Potential Metabolic Pathways" ISMB 2015 (2015.7.10-14 the Convention Centre Dublin, Dublin).
荒木通啓「GDCワーキンググループ進捗状況」TRAHED・第1回研究開発推進委員会（2015.9.9 経済産業省、東京）
近藤昭彦、荒木通啓、蓮沼誠久、大室有紀、勝田知尚、山地秀樹「神戸大学分室の担当事業内容」MAB・第2回進捗状況報告会（2015.9.4-6 葉山、神奈川）
荒木通啓「GDCワーキンググループ進捗状況」TRAHED・第1回研究討論会（2015.7.9 機械振興会館、東京）
Oshida, T., Ogawa, T., Yokoi, Y., Fukamachi, Y., Araki, M., Makiguchi, H. "New approach for Metabolomics pathway analysis" ASMS2015 (2015.5.31-6.4 America's Center, St. Louis, Missouri).
荒木通啓「細胞工場」iBioK・平成27年度第1回協働研究推進委員会（2015.6.2 神戸大学、神戸）
荒木通啓、牧口大旭、小川哲平、近藤昭彦「代謝シミュレーション基盤を利用した網羅的メタボローム推定」日本薬学会第135回年会（2015.3.26 神戸）
秦信子、蓮沼誠久、荒木通啓、近藤昭彦「CHO細胞を用いた抗体産生代謝メカニズムに相関する培養環境因子の影響を化学量論的に解析」日本薬学会第135回年会（2015.3.27 神戸）
荒木通啓「細胞工場」iBioK・平成26年度第2回協働研究推進委員会（2015.3.23 神戸大学、神戸）
原清敬、望月正雄、蓮沼誠久、中津井雅彦、荒木通啓、近藤昭彦「MALDI-TOF/MSを用いた発現タンパク質プロファイル測定方法の開発」第9回日本ゲノム微生物学会年会（2015.3.8 神戸大学、神戸）
荒木通啓、牧口大旭、小川哲平、谷口岳志、宮奥康平、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦「新たな合成経路の設計・構築」TRAHED・第2回研究討論会（2015.2.6 東北大学、仙台）
中津井雅彦、荒木通啓、崎濱由梨、近藤昭彦「時系列データによる遺伝子発現制御ネットワークの動的解析」TRAHED・第2回研究討論会（2015.2.6 東北大学、仙台）
Ogawa, T., Makiguchi, H., Cox III, RS., Nakatsui M., Kondo, A., Taniguchi, T., Miyaoku, K. and Araki, M. "M-path: Construction of a Database for Expanded Metabolic Pathways" Active Enzyme Molecule 2014 (2014.12.17-19 Toyama International Conference Center, Toyama).
Cox III, RS., Nakatsui M., Makiguchi, H., Ogawa, T., Kondo, A., Araki, M. "Meta-synthetic metabolism: in silico design of novel amino acids from all-organism data" GIW ISCB-ASIA 2014（2014.12.15-17 Odaiba, Tokyo）
中津井雅彦、荒木通啓、近藤昭彦「遺伝子発現における時系列データ・制御様式の整合性評価」第37回分子生物学会（2014.11.27 横浜）
牧口大旭、小川哲平、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、谷口岳志、宮奥康平、荒木通啓「M-path: 拡張代謝パスウェイデータベースの構築」第37回分子生物学会（2014.11.26 横浜）
荒木通啓「代謝設計プラットフォームの応用展開」iBioK・平成26年度第1回部門会（2014.10.3 神戸大学、神戸）
望月正雄、原清敬、蓮沼誠久、中津井雅彦、荒木通啓「MALDI-TOF/MSを用いた発現タンパク質プロファイル測定方法の開発」iBioK・平成26年度第1回部門会（2014.10.3 神戸大学、神戸）
望月正雄、田中耕生、荒木通啓「マルチオミクス統合プラットフォームの展開」iBioK・平成26年度第1回部門会（2014.10.3 神戸大学、神戸）
小川哲平、牧口大旭、谷口岳志、宮奥康平、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、荒木通啓「バイオプロセス合成経路データベース"M-path"の構築」第３回生命医薬情報学連合大会（2014.10.2-4 仙台）
中津井雅彦、荒木通啓、近藤昭彦「時系列データを利用した遺伝子制御ネットワーク選択手法の開発」第３回生命医薬情報学連合大会（2014.10.2-4 仙台）
Cox III, RS., Nakatsui M., Makiguchi, H., Ogawa, T., Kondo, A., Araki, M. "Mpath: Computationally-Aided Design of Synthetic Metabolic Pathways" DNA20（2014.9.22- 26 Kyoto University, Kyoto）
伊賀朋世、蓮沼誠久、荒木通啓、近藤昭彦「バイオ医薬開発に有用なCHO細胞の改良、培養状態解明につながるデータの構築」第66回日本生物工学会（2014.9.11 札幌）
Cox III, RS., Nakatsui M., Makiguchi, H., Ogawa, T., Kondo, A., Araki, M. "Mpath: Computationally-Aided Design of Synthetic Metabolic Pathways" SEED2014（2014.7.14-17 Manhattan Beach, CA）
中津井雅彦、荒木通啓、近藤昭彦「遺伝子発現における時系列データ・制御様式の整合性評価」生物工学会若手研究者の集い夏のセミナー 2014（2014.7.12 神戸）
荒木通啓、牧口大旭、小川哲平、谷口岳志、宮奥康平、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦「新たな合成経路の設計・構築」TRAHED・第1回研究討論会（2014.7.3- 4 鶴岡メタボロームキャンパス、鶴岡）
中津井雅彦、荒木通啓、近藤昭彦「遺伝子発現における時系列データ・制御様式の整合性評価」TRAHED・第1回研究討論会（2014.7.3-4 鶴岡メタボロームキャンパス、鶴岡）
Araki, M., Cox III, RS., Makiguchi, H., Ogawa, T., Taniguchi, T., Miyaoku, K., Nakatsui M., Kondo, A. "A Computational Method to Construct an Extensive Metabolic Pathway Database" Metabolic Engineering X (2014.6 Vancouver, Canada).
荒木通啓「人工代謝経路のスコープの拡張」新学術領域研究・第５回全体会議（2014.5.19 福岡）
荒木通啓「細胞工場」 iBioK・第1回協働研究推進委員会（2014.5.13 神戸大学、神戸）
中津井雅彦、角山香織、荒木通啓、栄田敏之、近藤昭彦、奥野恭史「モデルベース機械学習による配合注射薬外観変化予測アルゴリズムの開発」日本薬学会第134回年会（2014.3.30 熊本）
荒木通啓「代謝パスウェイの知識拡張」第1回合成生物研究部会（2014.3.3 愛媛大学、愛媛）
荒木通啓、牧口大旭、小川哲平、谷口岳志、宮奥康平、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦「新たな合成経路の設計・構築」TRAHED・第2回研究討論会（2014.1.22 神戸大学、神戸）
Cox III, RS., Nakatsui M., Makiguchi, H., Ogawa, T., Taniguchi, T., Miyaoku, K., Kondo, A., Araki, M. "Meta-synthetic metabolism: Designing synthetic amino acid pathways from all-organism data" TRAHED・第2回研究討論会（2014.1.22 神戸大学、神戸）
牧口大旭、小川哲平、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、荒木通啓「Bioprocess design platform : Development of the bioprocess database of amino acids.」第36回分子生物学会（2013.12.5 神戸）
中津井雅彦、牧口大旭、荒木通啓、近藤昭彦「細胞内ダイナミクス解析ツールの設計・開発」「細胞を創る」研究会6.0（2013.11.14-15 鶴岡メタボロームキャンパス、鶴岡）
Cox III, RS., Nakatsui M., Makiguchi, H., Ogawa, T., Kondo, A., Araki, M. "Meta-synthetic metabolism: Identification of critical intermediates for synthetic amino acid derivative production" CBI学会 2013年大会（2013.10.29 東京）
Araki, M. "Construction of a computational platform for metabolic pathway design" CBI学会 2013年大会（2013.10.29 東京）
Araki, M. "Construction of a computational platform for metabolic pathway design" 新学術領域研究・第4回全体会議（2013.10.29 東京）
中津井雅彦、荒木通啓、近藤昭彦「新たな合成経路の設計・構築」TRAHED・第1回研究討論会（2013.7.4 札幌）
荒木通啓、牧口大旭、小川哲平、谷口岳志、宮奥康平「生合成パスウェイの設計基盤構築」日本薬学会第133回年会（2013.3.30 横浜）
牧口大旭、小川哲平、谷口岳志、宮奥康平、荒木通啓「Development of a computational tool for designing metabolic pathways」第35回日本分子生物学会（2012.12.12 福岡）
荒木通啓、谷口岳志、宮奥康平「生合成パスウェイ設計のための情報解析技術の開発」第64回日本生物工学会（2012.10.24 神戸）
谷口岳志、宮奥康平、牧口大旭、荒木通啓「生合成パスウェイ設計のための基盤ツールの開発」第64回日本生物工学会（2012.10.24 神戸）
荒木通啓「人工代謝経路の設計基盤の構築」新学術領域研究・第３回全体会議（2012.5.18 福岡）
荒木通啓、牧口大旭、二川純也、谷口岳志、宮奥康平「医薬資源の生産を指向したケミカルデータベースの構築」日本薬学会第132年会（2012.3.30 札幌）
馮春来、荒木通啓、種石慶、奥野恭史「システム創薬のためのケミカル－バイオ－クリニカル統合データベース」日本薬学会第132年会（2012.3.30 札幌）
馮春来、荒木通啓、種石慶、多門啓子、薮内弘昭、奥野恭史「医薬品—臨床知識統合データベースの構築」日本薬学会第130年会（2010.3.29 岡山）
荒木通啓、馮春来、多門啓子、薮内弘昭、奥野恭史「医薬品—疾病作用情報データベース」日本薬学会第129年会（2009.3.26 京都）
多門啓子、牧口大旭、荒木通啓、薮内弘昭、奥野恭史、金子周司「統合型薬学情報ナビゲーションシステムの開発」日本薬学会第129年会（2009.3.26 京都）
藤田淳人、藪内弘昭、小川哲平、荒木通啓、大石真也、藤井信孝、中山和久、奥野恭史「ケミカルゲノミクス情報を用いた標的タンパク質の予測法の開発」日本薬学会第129年会（2009.3.26 京都）
重水大智、荒木通啓、奥田修二郎、五斗進、金久實「KEGG DRUG Structure Mapから化学変換パターンの抽出」BMB2007, (2007.12 神戸)
荒木通啓、川島秀一、金久實「KEGGの医薬品データベース」生命科学研究ネットワークシンポジウム2007 (2007.9.15 東京大学工学部２号館、東京)
五斗進，荒木通啓，金久實「創薬に向けた KEGG PATHWAY の拡張」第6回創薬インフォマティクス研究会（2006.9 東京大学医科学研究所、東京）
Araki, M., Sugiura, Y., “Insights into the Allosteric Regulation of a Designed Ribozyme” Symposium on Biofunctional Chemistry, 14, 372-373 (1999.9 北海道大学、札幌).
荒木通啓、杉浦幸雄「リボザイムを用いたアロステリック制御系の構築、および反応調節機構の解明」日本薬学会第119年会（1999.3 徳島文理大学、徳島）
Araki, M., Okuno, Y., Sugiura, Y., “Modulation of a Ribozyme Activity by Introducing Aptamer Domain: A Model for the Allosteric Interactions” Symposium on Nucleic Acids Chemistry, 227-228 (1998.9 甲南大学、神戸).
奥野恭史、荒木通啓、杉浦幸雄、岩下孝、大谷敏夫「NMRによる抗腫よう性抗生物質C-1027クロモフォア‐DNA複合体の高次構造解析」日本薬学会第118年会（1998.3 京都）
Araki, M., Okuno, Y., Sugiura, Y., “Chimeric Ribozyme Containing Active Site of Hammerhead Ribozyme and Regulatory Site of Flavin Mononucleotide-Specific RNA Aptamer” 7th International Kyoto Conference on New Aspects of Organic Chemistry (IKCOC) (1997.11 京都).
荒木通啓、原雄二、奥野恭史、杉浦幸雄「新規機能性RNAリボザイム（フラビンスイッチリボザイム）の合理的分子設計」日本薬学会第117年会（1997.3 昭和薬科大学、東京）
三好剣五、大高章、金子緑、荒木通啓、玉村啓和、藤井信孝「非水解性リン酸化ペプチド類縁体の合成」日本薬学会第116年会（1996.3 金沢）

【講義】

荒木通啓「インシリコ合成生物学」バイオインフォマティクス理論 (2023.12.12 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「インシリコ合成生物学」バイオインフォマティクス理論 (2021.12.7 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「学習によるデータ活用」データサイエンス特別講義 (2020.11.17 奈良先端科学技術大学院大学、WEB)
荒木通啓「インシリコ合成生物学」バイオインフォマティクス理論 (2019.12.17 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「インフォマティクスのすすめ」基礎創薬研究 (2019.10.18 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「学習によるデータ活用」データサイエンス特別講義 (2019.6.12 奈良先端科学技術大学院大学、奈良)
荒木通啓「バイオインフォマティクス」ビッグデータ医科学特論 (2019.5.27 京都大学医学研究科、京都)
荒木通啓「マルチオミクス」基礎バイオインフォマティクス (2019.5.7 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「学習によるデータ活用」データサイエンス特別講義 (2018.7.5 奈良先端科学技術大学院大学、奈良)
荒木通啓「バイオインフォマティクス」ビッグデータ医科学特論 (2018.6.5 京都大学医学研究科、京都)
荒木通啓「マルチオミクス」基礎バイオインフォマティクス (2018.4.16 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「インシリコ合成生物学」バイオインフォマティクス理論 (2017.11.14 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「合成生物学」基礎バイオインフォマティクス (2017.5.29 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「システム生物学」基礎バイオインフォマティクス (2017.5.22 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「インシリコ合成生物学」バイオインフォマティクス理論 (2015.11.10 京都大学化学研究所、京都)
荒木通啓「生物システムの設計：システム生物学から合成生物学へ」計算生命科学の基礎II (2015.10.21 神戸大学、神戸)
荒木通啓「システム生物学と合成生物学」基礎バイオインフォマティクス (2013.7.3 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「ケミカル・医薬品関連データベース」基礎バイオインフォマティクス (2013.5.22 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「ケミカル・医薬品関連データベース」基礎バイオインフォマティクス (2012.6.27 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「システムズバイオロジー（２）」基礎バイオインフォマティクス (2011.7.6 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「システムズバイオロジー（１）」基礎バイオインフォマティクス (2011.6.29 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「システムズバイオロジー（２）」基礎バイオインフォマティクス (2010.7.7 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「システムズバイオロジー（１）」基礎バイオインフォマティクス (2010.6.30 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「システムズバイオロジー（２）」基礎バイオインフォマティクス (2009.7.1 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「システムズバイオロジー（１）」基礎バイオインフォマティクス (2009.6.24 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「システムズバイオロジー基礎（２）」応用バイオインフォマティクス (2008.7.9 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「システムズバイオロジー基礎（１）」応用バイオインフォマティクス (2008.7.2 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「KegDraw、KCaM（糖鎖構造のホモロジー解析）」第２回 KEGGデータベース利用講習会 (2007.11.15 東京大学医科学研究所、東京)
荒木通啓「生体反応シミュレーション（２）」応用バイオインフォマティクス (2007.7.11 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「KEGG DRUGとGLYCAN」バイオインフォマティクス実習 (2007.7.7 東京大学医科学研究所、東京)
荒木通啓「生体反応シミュレーション（１）」応用バイオインフォマティクス (2007.7.4 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「生化学反応とシミュレーション」ゲノム情報科学研究教育機構ネットワーク情報解析特論 (2007.2.9 東京大学医科学研究所、東京)
荒木通啓「KEGG DRUGとGLYCAN」バイオインフォマティクス実習 (2006.11.24 東京大学医科学研究所、東京)
荒木通啓「システム生物学と薬学」基礎バイオインフォマティクス (2006.11.10 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「生体反応シミュレーション（２）」応用バイオインフォマティクス (2006.7.12 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「KEGG DRUGとGLYCAN」バイオインフォマティクス実習 (2006.7.7 東京大学医科学研究所、東京)
荒木通啓「生体反応シミュレーション（１）」応用バイオインフォマティクス (2006.7.5 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「生化学反応とシミュレーション」ゲノム情報科学研究教育機構システム生物学特論 (2006.2.17 東京大学医科学研究所、東京)
荒木通啓「システム生物学と薬学」基礎バイオインフォマティクス (2005.11.18 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「生体反応シミュレーション（２）」応用バイオインフォマティクス (2005.6.29 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「生体反応シミュレーション（１）」応用バイオインフォマティクス (2005.6.22 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「システム生物学と薬学」基礎バイオインフォマティクス (2004.12.3 京都大学薬学研究科、京都)
荒木通啓「生化学反応とシミュレーション」ゲノム情報科学研究教育機構システム生物学特論 (2004.11.30 東京大学医科学研究所、東京)
荒木通啓「生化学反応とシミュレーション」ゲノム情報科学研究教育機構計算化学特論 (2004.1.16 東京大学医科学研究所、東京)