研究業績

Dan Eiju, Yoichi Hashida, Taro Maeda, Koji Iwayama, Atsushi J. Nagano, Simulation study of factors affecting the accuracy of transcriptome models under complex environments, Plant Molecular Biology, Vol. 115, Article No. 52,  2025. (DOI: 10.1007/s11103-025-01578-6 

石田 明日香, 高柳 昌芳, 保科 架風, 岩山 幸治, ベイズモデリングによるチームメイト及び対戦相手の能力を考慮したポゼッションデータに基づくバスケットボールプレイヤーの能力評価指標, 計算機統計学, 36巻2号, pp. 99-126, 2023. (DOI: doi.org/10.20551/jscswabun.36.2_99)

Hiroaki Fujita, Masayuki Ushio, Kenta Suzuki, Masato S. Abe, Masato Yamamichi, Koji Iwayama, Alberto Canarini, Ibuki Hayashi, Keitaro Fukushima, Shinji Fukuda, E. Toby Kiers, Hirokazu Toju, Alternative stable states, nonlinear behavior, and predictability of microbiome dynamics, Microbiome Vol. 11, Article No. 63, 2023. (DOI: 10.1186/s40168-023-01474-5). 

Makoto Kashima, Ryota L Sakamoto, Hiroki Saito, Satoshi Ohkubo, Ayumi Tezuka, Ayumi Deguchi, Yoichi Hashida, Yuko Kurita, Koji Iwayama, Shunsuke Adachi, Atsushi J Nagano, Genomic Basis of Transcriptome Dynamics in Rice under Field Conditions, Plant and Cell Physiology, Vol. 62, Issue 9, pp. 1436–1445, 2021. (DOI: 10.1093/pcp/pcab088 ). 

Haruki Nishio, Koji Iwayama, Hiroshi Kudoh, Duration of cold exposure defines the rate of reactivation of a perennial FLC orthologue via H3K27me3 accumulation, Scientific Reports Vol. 10, Article No. 16056, 2020. (DOI: 10.1038/s41598-020-72566-7).

Haruki Nishio, Diana M. Buzas, Atsushi J. Nagano, Koji Iwayama, Masayuki Ushio, Hiroshi Kudoh, Repressive chromatin modification underpins the long-term expression trend of a perennial flowering gene in nature, Nature Communications 11, 2065, 2020. (DOI:10.1038/s41467-020-15896-4).

Atsushi J. Nagano, Tetsuhiro Kawagoe, Jiro Sugisaka, Mie N. Honjo, Koji Iwayama, Hiroshi Kudoh, Annual transcriptome dynamics in natural environments reveals plant seasonal adaptation, Nature Plants, Vol. 5, pp.74-83, 2019. (DOI: 10.1038/s41477-018-0338-z).

Koji Iwayama, Yuri Aisaka, Natsumaro Kutsuna, Atsushi J. Nagano, FIT: Statistical modeling tool for transcriptome dynamics under fluctuating field conditions, Bioinformatics, Vol. 33, Issue 11, pp.1672-1680, 2017. (DOI: 10.1093/bioinformatics/btx049). 

Koji Iwayama, Yoshito Hirata, Kazuyuki Aihara, Definition of distance for nonlinear time series analysis of marked point process data, Physics Letters A, Vol. 381, Issue 4, pp.257-262, 2017. (DOI: 10.1016/j.physleta.2016.10.061).

Yoshito Hirata, Koji Iwayama, Kazuyuki Aihara, Possibility of short-term probabilistic forecasts for large earthquakes making good use of the limitations of existing catalogs, Physical Review E, 94, 042217, 2016. (DOI:10.1103/PhysRevE.94.042217)

Koji Iwayama,  Liping Zhu, Yoshito Hirata, Masashi Aono, Masahiko Hara, Kazuyuki Aihara, Decision-making ability of Physarum polycephalum enhanced by its coordinated spatiotemporal oscillatory dynamics, Bioinspiration & Biomimetics, Vol. 11, No. 3, 036001, 2016. (DOI: 10.1088/1748-3190/11/3/036001)

Shuhei Nakano, Yoshito Hirata, Koji Iwayama, Kazuyuki Aihara, Intra-day response of foreign exchange markets after the Tohoku-Oki earthquake, Physica A, Vol. 419, No. 1, pp. 203-214, 2015 (DOI: 10.1016/j.physa.2014.10.027)

Isao Nishikawa, Koji Iwayama, Gouhei Tanaka, Takehiko Horita, Kazuyuki Aihara, Finite-size scaling in globally coupled phase oscillators with a general coupling scheme, Progress of Theoretical and Experimental Physics (PTEP), Vol. 2014, No. 2, 023A07, 2014.(DOI: 10.1093/ptep/ptu015)

Koji Iwayama, Yoshito Hirata, Hideyuki Suzuki, Kazuyuki Aihara, Change-point detection with recurrence networks, Nonlinear Theory and Its Applications, IEICE, Vol. 4, No. 2, pp. 160-171, 2013. (DOI: 10.1587/nolta.4.160)

Koji Iwayama, Yoshito Hirata, Kohske Takahashi, Katsumi Watanabe, Kazuyuki Aihara, Hideyuki Suzuki, Characterizing global evolutions of complex systems via intermediate network representations, Scientific Reports, Vol. 2, Article No. 423, 2012. (DOI: 10.1038/srep00423)

Koji Iwayama, Kazuyuki Aihara, Hideyuki Suzuki, Self-organization of orientation-selective and ocular-dominance maps through spike-timing-dependent plasticity, Artificial Life and Robotics, Vol. 14, No. 3, pp. 371-374, 2009. (DOI: 10.1007/s10015-009-0687-9)

Koji Iwayama, Yoshito Hirata, Kazuyuki Aihara, Nonlinear Time Series Analysis of Marked Point Process Data, Proc. NOLTA'13, pp. 189-192 (2013).

Koji Iwayama, Yoshito Hirata, Hideyuki Suzuki, Kazuyuki Aihara, Characterizing Global Dynamics on Time-evolving Networks of Networks, Proc. NOLTA'12, pp. 239-242 (2012).

Koji Iwayama, Kazuyuki Aihara, Hideyuki Suzuki, Formation of orientation maps by spiral waves in primary visual cortex, Proc. NOLTA'11, pp. 224-227 (2011).

Koji Iwayama, Kohske Takahashi, Katsumi Watanabe, Yoshito Hirata, Kazuyuki Aihara, Hideyuki Suzuki, Synchronized brain activity changes related to perceptual alternations, Proceedings of the Fifteenth International Symposium on Artificial Life and Robotics, pp. 747-750, 2010.

Koji Iwayama, Hideyuki Suzuki, Kazuyuki Aihara, Self-Organization of Orientation Selective and Ocular Dominance Maps through Spike-Timing-Dependent Plasticity, Proceedings of the Fourteenth International Symposium on Artificial Life and Robotics, pp. 514-517, 2009.

岩山 幸治，細胞単位の状態の変化を明らかにするための1細胞RNA-Seqの潜在変数モデルによる分析，第36回和漢医薬学会学術大会，シンポジウム：数理科学・情報科学と生命科学の融合―和漢医薬学研究の新地平へ向けて，富山，8，2019.

岩山 幸治，１細胞トランスクリプトーム解析のための確率的潜在変数モデル，第１回データ駆動数理医科学ワークショップ，8，札幌，2019.

Koji Iwayama, Makoto Kashima, Atsushi J. Nagano, Estimation of gene expression from shallow RNA-Seq by topic model, Workshop：Data driven crop design technology, Fukuoka, 2, 2018.

Koji Iwayama, Atsushi J. Nagano, Imputation of RNA-seq data toward modeling transcriptome dynamics in a field, Annual Meeting of Japan Society for Mathematical Biology (mini-symposium on Mathematical and statistical modeling to bridge the gap between empirical and theoretical research in ecology), Fukuoka, 9, 2016. 

岩山幸治, Prediction of transcriptome under fluctuating field conditions, 生態学会関東地区会国際シンポジウム "Ecological statistics," Tokyo, 1, 2016. 

Koji Iwayama, Yoshito Hirata, Aki Kondo, Hiroyuki Tsubomi, Kohske Takahashi, Yuko Yoshimura, Sanae Ueno, Mitsuru Kikuchi, Yoshio Minabe, Katsumi Watanabe, Hideyuki Suzuki, Kazuyuki Aihara, Temporal Dynamics of Functional Networks from Multivariate Electrophysiological Time Series, 35th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (mini-symposium on Network based Modelling of Brain Complexity), 2013.

辻開斗, 池上恵太, 大里隆也, 川上幹男, 岩山幸治, 企業財務・借入先情報を用いた製造業の借入金利の変動メカニズムの解明,第62回　2024年度冬季JAFEE大会,2,2025.

後関駿, 保科架風, 岩山幸治, チームパフォーマンスを反映したバスケットボール選手の評価のためのベイズモデリング, 2024年度統計関連学会連合大会, 9, 2024. 

田里優加子, 岩山幸治, 大里隆也, 青木高明, コロナウイルス前後の沖縄県内宿泊業、飲食サービス業のネットワーク構造について, 進化経済学会2024年度福井大会, 3, 2024. 

徳永一輝, 石田希望, 川端篤, 岩山幸治, 南條浩輝, ELECTRA単語分散表現とLightGBMを使った固有表現抽出, 言語処理学会第30回年次大会（NLP2024）, 3, 2024. 

後関駿，保科架風，岩山幸治，機械学習モデルを活用したプロバスケットボール選手のパフォーマンス評価，日本計算機統計学会第37回シンポジウム，11，2023.

大久保叡一，青木裕一，大林武，永野惇，岩山幸治，Variational Autoencoderを用いた組織種による遺伝子発現データの分離，2022年度統計関連学会連合大会，9，2022.

秋山浩希，岩山幸治，姫野哲人，河本薫，佐藤健司，連続晶析における粒度分布遷移過程の状態空間モデルによる分析，情報処理学会 第132回数理モデル化と問題解決研究発表会，3，2021.

石田明日香，高柳昌芳，保科架風，岩山幸治，バスケットボールにおけるポゼッション数を考慮した実践的選手評価手法の提案，2020年度統計関連学会連合大会，9，2020.

森太郎，山本さや香，田尾航大，岩山幸治，久保加織，滋賀県在来'杉谷とうがらし'に適した栽培条件の検討，日本産業技術教育学会第63回全国大会，9，2020．

岩山幸治，外的要因の影響を受ける関数のベイズ最適化，2020年度人工知能学会全国大会，6，2020．

岩山幸治，確率的環境かにおける期待値のベイズ最適化，第22回情報論的学習理論ワークショップ（IBIS2019)，11，2019．

岩山幸治，トピックモデルを用いた野外トランスクリプトームデータの解析，日本生態学会第65回全国大会，シンポジウムS19 機械学習が切り開く新しい生態学の世界，3，2018．

岩山幸治，永野惇，機械学習によるリード数の少ないRNA-Seqからの遺伝子発現推定，NGS現場の会 第5回研究会，5，2017．

永野惇, 岩山幸治, 手塚あゆみ, 出口亜由美, 鹿島誠, 滝本裕則, 七夕高也, 齊藤大樹, フィールドトランスクリプトミクスのためのウェットとドライ両面の技術開発, 第58回植物生理学会年会, 3, 2017.

岩山幸治, 永野惇, 遺伝子発現データ解析のためのトピックモデル, 第28回IBISML研究会, 3, 2017. 

岩山幸治, 本庄三恵, 岩崎貴也, 永野惇, 野外における遺伝子発現量の予測, 日本生態学会第63回全国大会, 3, 2106.

岩山幸治, 本庄三恵, 岩崎貴也, 永野惇, 野外サンプルの RNA-Seq データの予測, 統計数理研究所共同研究集会「環境・生態データと統計解析」, 11, 2015. 

岩山幸治, 本庄三恵, 岩崎貴也, 永野惇, トピックモデルによる野外トランスクリプトームデータの解析, 第42回バイオ情報学研究会, 6, 2015.

西尾治幾, 永野惇, 岩山幸治, 工藤洋, Diana Buzas, 植物が花成タイミングを決定する分子メカニズム, 日本生態学会第62回全国大会, 3, 2015.

岩山幸治, 永野惇, 気象データと遺伝子発現データの状態空間モデルによる解析, 統計数理研究所共同研究集会「環境・生態データと統計解析 」, 12, 2014.

藤原直哉, Abhijeet R. Sonawane, 岩山幸治, 合原一幸, 人の移動データを用いた感染症拡大可能性の解析, 日本物理学会秋季大会, 9, 2014.

占部千由, 藤原直哉, 鈴木真一朗, 秋田純一, 岩山幸治, 藤居文行, 合原一幸, 人の移動データを用いた感染症伝播シミュレーション, 日本物理学会第69回年次大会, 3, 2014.

Koji Iwayama, Yoshito Hirata, Kazuyuki Aihara, Detection of Abrupt Changes of Networks from Multivariate Time Series, The 3rd International Symposium on Innovative Mathematical Modelling, Tokyo, 11, 2013.

Kohske Takahashi, Koji Iwayama, Aki Kondo, Hiroyuki Tsubomi, Yuko Yoshimura, Yoshito Hirata, Kazuyuki Aihara, Mitsuru Kikuchi, Yoshio Minabe, Katsumi Watanabe, Measuring Cognitive Abilities and Resting-State Neuromagnetic Signals in Children, 5Th Biomedical Engineering International Conference (BMEiCON2012), Ubon Ratchathani, 12, 2012.

Hiroyuki Tsubomi, Koji Iwayama, Kohske Takahashi, Aki Kondo, Mitsuru Kikuchi, Yuko Yoshimura, Yoshio Minabe, Yoshito Hirata, Kazuyuki Aihara, Katsumi Watanabe, Neural processes of short-term memory for number recall: Nonlinear interdependence analysis of MEG signals, Society for Neuroscience, New Orleans, 10, 2012.

Koji Iwayama, Yoshito Hirata, Hideyuki Suzuki, Kazuyuki Aihara, Characterizing Global Dynamics on Time-evolving Networks, International Conference on Towards Mathematical Foundations of Complex Network Theory, Kyoto, 9, 2012.

Isao Nishikawa, Koji Iwayama, Gouhei Tanaka, Takehiko Horita, Kazuyuki Aihara, Effects of coupling schemes n finite size scaling in globally coupled phase oscillators, The 2nd international Symposium on Innovative Mathematical Modelling, Tokyo, 5, 2012.

Koji Iwayama, Yoshito Hirata, Hideyuki Suzuki, Kazuyuki Aihara, Characterizing global dynamics on time-evolving networks, The 2nd International Symposium on Innovative Mathematical Modelling, Tokyo, 5, 2012.

坪見博之, 岩山幸治, 近藤あき, 菊知充, 吉村優子, 三邉義雄, 平田祥人, 合原一幸, 渡邊克巳, 幼児の短期記憶課題成績に関わる脳活動の非線形時系列解析, 第2回子どものこころサミット, 金沢, 3, 2012.

Koji Iwayama, Yoshito Hirata, Kazuyuki Aihara, Hideyuki Suzuki, Characterizing time-evolution of networks, The 1st International Symposium on Innovative Mathematical Modelling, Tokyo, 3, 2011.

岩山幸治, 複雑系非線形解析を用いた知覚交代に伴う脳活動の変化の検出, 第1回子どものこころサミット, 金沢, 11, 2010.

岩山幸治，高橋康介，渡邊克巳，平田祥人，合原一幸，鈴木秀幸, 知覚交代に伴う脳活動の変化, 脳と心のメカニズム第10回冬のワークショップ, 留寿都, 1, 2010.

岩山幸治，平田祥人，合原一幸，鈴木秀幸, リカレンスプロットを用いた変化点検出手法の提案, 電子情報通信学会技術研究報告, NLP2009-87，vol. 109(269), pp. 31-34, 2009.

奥牧人, 岩山幸治, 徳田慶太, 鈴木秀幸, 合原一幸，大規模カオスニューラルネットワークの並列シミュレーション，電子情報通信学会技術研究報告, NLP2009-92，vol. 109(269), pp. 55-59, 2009.

岩山幸治，高橋康介，渡邊克巳，平田祥人，合原一幸，鈴木秀幸, Detection of brain activity changes related to perceptual alternations, 脳と心のメカニズム第10回夏のワークショップ, 札幌, 8, 2009.

国立大学法人滋賀大学 連載企画「データアナリティクスの最前線」 第8回 「後悔」の少ない選択をするために‐バンディット問題，PwC's View 第20号，5, 2019. 

制作協力：日本科学未来館メディアラボ第13期展示「1たす1が2じゃない世界－数理モデルのすすめ」, 2014.2-2014.9

• JST news 2014年7月号特集「日本科学未来館を10倍楽しむ！－複雑さを解き明かす「数理モデル」とは」

揺らぎの中の秩序, 京都大学生態学研究センターニュース, No. 126