Agyi képalkotó eljárások

Időpont: 2014, április 26., 8-16 óra

Helyszín: Szeged, Pszichológiai Intézet, Bognár Cecil terem

Tematika

• 1. Kurzusmegbeszélés: tematika, követelmények.

  2. I.  Általános ismeretek

1. Bevezetés

   1. Az MR technika és korlátai. Funkcionális adatok statisztikai feldolgozása. MRI biztonság

2. Koordináták

• 1. Atlaszok, transzformációk. Tájékozódás radiológiai képeken.

  2. Agy képek transzformációi (dia)

  3. Regisztráció típusok és néhány alkalmazásuk.

3. Metaelemzés

• 1. II.  Strukturális elemzések

  2. Szegmentációs elemzés - FreeSurfer

4. Voxel alapú morfometria

• 1. III.  Funkcionális elemzések

  2. Funkcionális képek előkészítése

  3. Feldolgozás áttekintése

  4. Minőség ellenőrzés

  5. Mozgás korrekció

     1. Normalizálás

     2. Simítás

  6. Funkcionális képek statisztikai elemzése

  7. Általános lineáris modell

  8. Funkcionális kapcsolatelemzés

• • 1. Független komponens elemzés

• 9. Több voxeles mintázat elemzés

Követelmények

A kredit feltétele az órai részvétel. Ezen kívül az alábbi lehetőségek közül kell egyet választani:

• • Korábbi képalkotó eredmények metaelemzése tetszőlegesen választható kutatási területen.

    • Egy lehetséges eljárás: Sleuth-be beírhatod az adatokat.

      • Kvalitatív elemzéshez elég megjeleníteni a pontokat. Ha a Sleuth Plot füle képe nem tetszik, akkor a koordinátákat elmentheted nifty fájlba (Expert > Nifty), és a nifty fájlt megnyithatod bármilyen nézegetővel, pl. MRICron vagy Mango.

      • Kvantitatív elemzéshez az adatokat vidd tovább a GingerAle-be. A kész nifty fájlt megint csak valamelyik képnézegetővel jelenítheted meg, pl. MRICron vagy Mango.

  • Agyrégiók képének elkészítése meglévő atlaszok alapján. A képeket a Wikimedia Commonsra kell végül feltölteni.

    • Válassz egy olyan programot, ami atlaszokat tartalmaz, vagy keress olyan atlaszt, amit meg tudsz valamilyen programmal jeleníteni. Többek közt ezen az oldalon a Letölthető szoftverek résznél választhatsz programot, de választhatsz mást is.

    • Olyan atlaszt válassz, ami még nincs a Commonson, vagy amiről te jobb képeket tudsz készíteni. Előzetesen egyeztess az atlasz és esetlegesen a megjelenítő program készítőivel, hogy a képeket jogszerűen feltöltheted-e.

    • Készíts képernyőképeket, és töltsd fel a Commonsra.

  • Képalkotó technikákkal kapcsolatos Wikipédia szócikk írása vagy bővítése angol vagy magyar nyelven, 10.000 karakter terjedelemben (szóközzel).

    • Wikipédia szócikk írásával kapcsolatban és a kurzuskövetelményhez használandó eljárásról segítség itt található.

  • Képalkotó technikákkal kapcsolatos Wikikönyv fejezet írása vagy bővítése angol vagy magyar nyelven, 15.000 karakter terjedelemben (szóközzel).

  • 3 empirikus cikk technikai szempontú feldolgozása: miért azt a módszert választották, miért azokkal a paraméterekkel, mi lehetett volna az alternatíva? Milyen előnye/hátránya lett volna az alternatív módszereknek a vizsgálat szempontjából? Az összehasonlítás lehet egyszerűen egy táblázatban is.

Határidők:

• • Téma kiválasztása: május 3.

  • Kész anyag leadása: június 9.