Képek minőségének ellenőrzése
Előfeldolgozás
Általános lineáris modell
Region of interest
Funkcionális kapcsolatelemzés
Egyszerű korreláció
Pszichofiziológiai interakció
Független komponens elemzés
Több voxeles mintázat elemzés
Az SPM honlapja
FreeSurfer
Az FSL honlapja
Az AFNI honlapja
További ajánlott szoftvereket lásd az egyes feldolgozási lépéseknél.