Agyi képalkotó eljárások

Időpontok és helyszínek:

Szeptember 27, 14 óra, Izu 416

Október 4, 14 óra, Izu 416

Október 11, 14 óra, Izu 416

Október 21. 11.55, SOTE épület, találkozás a recepciónál

December 15, 18 óra, Izu 305 (eredmények bemutatása)

A nem ELTÉs vagy nem MA hallgatók küldjenek egy emailt nekem, ha be szeretnének járni az órára a krajcsi@gmail.com címre.

Tematika

• 1. Kurzusmegbeszélés: tematika, követelmények.

  2. I.  Általános ismeretek

1. Bevezetés

   1. Az MR technika és korlátai. Funkcionális adatok statisztikai feldolgozása. MRI biztonság

2. Koordináták

• 1. Atlaszok, transzformációk. Tájékozódás radiológiai képeken.

  2. Agy képek transzformációi (dia)

  3. Regisztráció típusok és néhány alkalmazásuk.

3. Metaelemzés

• 1. II.  Strukturális elemzések

  2. Szegmentációs elemzés - FreeSurfer

4. Voxel alapú morfometria

• 1. III.  Funkcionális elemzések

  2. Funkcionális képek előkészítése

  3. Feldolgozás áttekintése

  4. Minőség ellenőrzés

  5. Mozgás korrekció

     1. Normalizálás

     2. Simítás

  6. Funkcionális képek statisztikai elemzése

  7. Általános lineáris modell

  8. Funkcionális kapcsolatelemzés

• • 1. Független komponens elemzés

• 9. Több voxeles mintázat elemzés

Követelmények

A kredit feltétele az órai részvétel. Ezen kívül az alábbi lehetőségek közül kell egyet választani:

• • Korábbi képalkotó eredmények metaelemzése tetszőlegesen választható kutatási területen.

    • Egy lehetséges eljárás: Sleuth-be beírhatod az adatokat.

      • Kvalitatív elemzéshez elég megjeleníteni a pontokat. Ha a Sleuth Plot füle képe nem tetszik, akkor a koordinátákat elmentheted nifty fájlba (Expert > Nifty), és a nifty fájlt megnyithatod bármilyen nézegetővel, pl. MRICron vagy Mango.

      • Kvantitatív elemzéshez az adatokat vidd tovább a GingerAle-be. A kész nifty fájlt megint csak valamelyik képnézegetővel jelenítheted meg, pl. MRICron vagy Mango.

  • Agyrégiók képének elkészítése meglévő atlaszok alapján. A képeket a Wikimedia Commonsra kell végül feltölteni.

    • Válassz egy olyan programot, ami atlaszokat tartalmaz, vagy keress olyan atlaszt, amit meg tudsz valamilyen programmal jeleníteni. Többek közt ezen az oldalon a Letölthető szoftverek résznél választhatsz programot, de választhatsz mást is.

    • Olyan atlaszt válassz, ami még nincs a Commonson, vagy amiről te jobb képeket tudsz készíteni. Előzetesen egyeztess az atlasz és esetlegesen a megjelenítő program készítőivel, hogy a képeket jogszerűen feltöltheted-e.

    • Készíts képernyőképeket, és töltsd fel a Commonsra.

  • Képalkotó technikákkal kapcsolatos Wikipédia szócikk irása vagy bővitése angol vagy magyar nyelven, 10.000 karakter terjedelemben (szóközzel).

    • Wikipédia szócikk írásával kapcsolatban némi segítség itt található.

  • Képalkotó technikákkal kapcsolatos Wikikönyv fejezet irása vagy bővitése angol vagy magyar nyelven, 15.000 karakter terjedelemben (szóközzel).

  • 3 empirikus cikk technikai szempontú feldolgozása: miért azt a módszert választották, miért azokkal a paraméterekkel, mi lehetett volna az alternativa? Milyen előnye/hátránya lett volna az alternativ módszereknek a vizsgálat szempontjából? Az összehasonlitás lehet egyszerűen egy táblázatban is.

Határidők:

• • Téma kiválasztása: október 11

  • Anyagok beadása emailen: december 8

  • Az eredmények bemutatása: december 15