まず、公式サイトから JsDoc3 をダウンロードしてください。Zipファイルはこちらからダウンロードできます。
展開したディレクトリで以下のコマンドを実行します。
Windows の場合:
jsdoc.js -T
MacOSX or Linux の場合:
./jsdoc.js -T
以下のように "0 failures" と表示されれば動作しています。
動かない場合は:
java -cp lib/js.jar org.mozilla.javascript.tools.shell.Main \ -modules node_modules -modules rhino_modules -modules . \ jsdoc.js -T