La Commue de Locmiquelic est le gestionnaire du site du Conservatoire du Littoral "Rives du Blavet" dont fait partie le marais de Pen-Mané.

Le Conservatoire du littoral est propriétaire du site "Rives du Blavet" et affectataire pour le marais de Pen-Mané.

Lorient Agglomération est opérateur pour la zone Natura 2000 "Rade de Lorient". 

L’Union Européenne et l'Etat financent la gestion du site via des contrats Natura 2000 financé par les Fonds européen agricole pour le développement rural. 

Le département du Morbihan finance annuellement la gestion. Il est également partenaire du projet de création de sentiers pédagogiques.

Optim'ism et son Chantier Nature et Patrimoine (CNP), "l'atelier des Asphodèles", réalise certains travaux de gestion et d'aménagement sur le marais pour la commune de Locmiquelic.

La Fondation du Patrimoine est partenaire du projet de création de sentiers pédagogiques.

La Région Bretagne est propriétaire du marais de Pen-Mané. Elle en délègue sont droit de propriété au Conservatoire du Littoral par affectation. Elle est également partenaire du projet de création de sentiers pédagogiques.

Bretagne Vivante, association agréée pour la protection de l’environnement s'est intéressée aux marais de Pen-Mané dès les années 1990. Elle a porté de 2006 à 2011 le programme Life européen "Phragmite aquatique" sur le site et ailleurs en Bretagne. L'association est aujourd'hui responsable des suivis scientifiques et programme des animations tout public sur le site.