Année 2014-2015 (1er semestre)
Introduction à la philosophie de la biologie (S1)
Vendredi 16h00-19h, Maison des Sciences Economiques, salle 19
(106 bld de l'Hôpital, 13ème Paris)
Les difficultés du discours sur l’hérédité biologique & l’influence des valeurs contextuelles en biologie
Ce cours vise à fournir une introduction à quelques questions majeures en philosophie de la biologie contemporaine. Il sera divisé en deux parties. Dans la première, nous nous interrogerons sur des notions centrales et connexes dans le discours sur l’hérédité en biologie contemporaine : gène, information, héritabilité, nature vs. nurture, épigénétique, hérédité étendue. Nous développerons une analyse critique de ces notions afin de mettre en évidence les difficultés conceptuelles et empiriques liées à leur définition et à leur usage en biologie. La deuxième partie du cours sera consacrée à une question peu traitée en France, mais largement analysée dans le monde anglo-saxon : en puisant dans la littérature en philosophie féministe de la biologie, nous étudierons l’influence des valeurs « contextuelles » (non épistémiques) sur les pratiques et résultats dans certains domaines de la biologie, notamment les biais liés au sexe et au genre.
Modalité : Un texte à lire obligatoirement pour chaque séance, auquel s’ajouteront des lectures facultatives. Les textes (en format pdf) sont à télécharger en bas de cette page.
Evaluation : Un mini-mémoire d’une quinzaine de pages & une présentation orale et/ou écrite d'une des lectures du cours.
Date limite pour la présentation d'un texte : 21 décembre 2014.
Date limite pour le mini-mémoire : 21 janvier 2014.
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ACTUALITES :
-A partir du vendredi 21 novembre, le cours démarrera à 16h15 afin de permettre le déplacement de certains d'entre vous de la Sorbonne à la Maison des sciences économiques.
-Les séances du 3/10, du 24/10 et du 7/11 sont annulées.
-La semaine du 27/10 tombe pendant les vacances pour les universités P1 et P4.
-A partir du 14/11, le cours aura lieu de 16h à 19h (afin de rattraper les 6h annulées).
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LECTURES (les documents pdf sont téléchargeables en bas de cette page) :
Séance 26/09 (2h) : première séance (pas de lecture).
Séance du 3/10 : annulée
Séance 10/10 (2h) :
-Gayon J (2000), "From measurement to organization: A philosophical scheme for the history of the concept of heredity", In Peter Beurton, Raphael Falk, and Hans-Jörg Rheinberger (eds.), The Concept of the Gene in Development and Evolution. Historical and Epistemological Perspectives. Cambridge: Cambridge University Press, p. 69–90 - présenté par Oleg Bykhovski et Irène Rabotin
Séance 17/10 (2h) :
-Johannsen W (1911), "The Genotype Conception of Heredity", The American Naturalist 45, 531, pp. 129-159 (jusqu'à p. 139 comprise).
Séance du 24/10 : annulée
Séance du 7/11 : annulée
Séance 14/11 (3h) : au moins un texte au choix parmi les trois articles ci-dessous
-Dietrich MR (2000), "The problem of the gene", C.R. Acad. Sci. Paris, Sciences de la vie /Life Sciences, 323, p. 1139-1146 - présenté par Clémence Thocquenne
-Keller EF (2000), "What are Genes for?", in The Century of the Gene, Harvard University Press - présenté par Maria Markopoulou et Chloé Delsad
-Falk R (2014), "The Allusion of the Gene: Misunderstandings of the Concepts Heredity and Gene", Science & Education, 23, p. 273-284 - présenté par Elodie Boissard
Séance du 21/11 (3h) :
-Dawkins R (1976), The Selfish Gene, trad. fr. par N Jones-Gorlin, Le gène égoiste, Paris, Odile Jacob, 2003, chapitre 2 (obligatoire) et chapitre 3 (facultatif) - présenté par Camila Scaff et Sophie Hubatz
Séance du 28/11 (3h) :
-Keller EF (2010), The Mirage of a Space between Nature and Nurture, Duke University Press, chapitre 2 - présenté par Laura Berlingo
Séance du 5/12 (3h) :
-Griffiths PE & Gray RD (2001), "Darwinism and Developmental Systems", In S Oyama et al (eds.), Cycles of Contingency. Developmental Systems and Evolution, Cambridge MA : The MIT Press, p. 195-203.
Séance du 12/12 (3h) :
-Martin, E (1991), "The Egg and the Sperm: How Science has Constructed a Romance Based on Stereotypical Male-Female Roles", In HE Longino & EF Keller (1996), Feminism & Science, Oxford: Oxford University Press, p. 103-117 - présenté par Alice Drew & commenté par Matthieu Cotteret
-Trois textes de C Darwin, R de Gourmont, S de Beauvoir tirés de Hoquet T (2013), Le sexe biologique. Anthologie historique et critique, Vol. 1 Femelles et Mâles ? Histoire naturelle des (deux) sexes, Paris : Hermann.
Séance du 19/12 (3h) :
-Texte collectif du Groupe d'Etude sur le Sexe et le Genre (1988), "L'Importance de la critique féministe pour la biologie cellulaire contemporaine", tirés de Hoquet T (2013), Le sexe biologique. Anthologie historique et critique, Vol. 1 Femelles et Mâles ? Histoire naturelle des (deux) sexes, Paris : Hermann.
-Zuk M (1993), "Le féminisme et l'étude du comportement animal" tirés de Hoquet T (2013), Le sexe biologique. Anthologie historique et critique, Vol. 2 Le Sexe : pourquoi et comment ? Origine, évolution, détermination, Paris : Hermann - présenté par Sergey Volkov
-Textes de Roughgarden J (2004) "Contre les diées reçues: les arcs-en-ciel de l'évolution sexuelle" & de Ah-King M (2009) "La nature queer. Pour une conception non normative de la diversité biologique", tirés de Hoquet T (2013), Le sexe biologique. Anthologie historique et critique, Vol. 1 Femelles et Mâles ? Histoire naturelle des (deux) sexes, Paris : Hermann.
-Lloyd EA (1993), "Pre-Theoretical Assumptions in Evolutionary Explanations of Female Sexuality", In HE Longino & EF Keller (1996), Feminism & Science, Oxford: Oxford University Press, p. 103-117.
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Bibliographie estivale :
- Jacob, François, 1970, La logique du vivant. Une histoire de l’hérédité, Paris : Gallimard.
- Fox Keller, Evelyn, 2003(2000), Le siècle du gène, Paris : Gallimard.
- Jablonka, Eva & Marion Lamb, 2005, Evolution in Four dimensions. Genetic, Epigenetic, Behavioral, and Symbolic Variation in the History of Life, Cambridge MA : The MIT Press.
- Fox Keller, Evelyn & Helen E. Longino (1996), Feminism & Science, New York : Oxford University Press.
BIBLIOGRAPHIE (alimentée durant le semestre) :
Bonduriansky R (2012), "Rethinking heredity, again", Trends in Ecology and Evolution, 27(6), p. 330-335.
Burian R (2013), "Qu'est-ce qu'un gène : la fin d'une évidence ?", In J-J Kupiec (dir), La Vie, et alors ?, Paris : Belin, chapitre 5.
Danchin E, Charmantier A, Champagne FA, Mesoudi A, Pujol B, Blanchet S (2011), "Beyond DNA: Integrating inclusive inheritance into an extended theory of evolution", Nature Reviews Genetics, 12, p. 475-486.
Danzon C (2013), "Génétique : naissance d'une science de l'hérédité à l'aube du XXe siècle", in J-J Kupiec (dir), La Vie, et alors ?, Paris : Belin, chapitre 4.
Darwin Ch (1859/2013), L’Origine des espèces, Texte intégral de la première édition, traduit, présenté et annoté par T Hoquet, Paris : Seuil.
Deutsch J (2012), Le gène. Un concept en évolution, Paris : Seuil.
Douglas HE (2009), Science, Policy, and the Value-Free Ideal, Pittsburgh University Press.
Falk R (1986), "What is a gene?", Studies in HIstory and Philosophy of Science, 17, 2, pp. 133-173.
Falk R (2010), "What is a gene? - Revisited", Studies in History and Philosophy of Biological and Biomedical Sciences, 41, p. 396-406.
Gayon J (2000), "From measurement to organization: A philosophical scheme for the history of the concept of heredity", In Peter Beurton, Raphael Falk, and Hans-Jörg Rheinberger (eds.), The Concept of the Gene in Development and Evolution. Historical and Epistemological Perspectives. Cambridge: Cambridge University Press, p. 69–90.
Gayon J (2007), "The concept of the gene in contemporary biology: continuity or dissolution?", In Anne Fagot-Largeault, Shaid Rahman, Jean Manuel Torres (eds) The Influence of Genetics on Contemporary Thinking, Springer, pp. 81-95.
Gayon J (2009) "Mort ou persistance du darwinisme ? Regard d’un épistémologue", C. R. Palevol 8, p. 321-340.
Godfrey-Smith P (2000), "On the theoretical role of ‘genetic coding’", Philosophy of Science, 67, p. 26-44.
Godfrey-Smith P (2007), "Information in biology", In The Cambdridge Companion to the Philosophy of Biology, 103-119, Cambridge: Cambridge University Press.
Godfrey-Smith P (2009), Darwinian Populations and Natural Selection, Oxford : Oxford University Press.
Griffiths PE (2001), "Genetic information: A metaphor in search of a theory", Philosophy of science, 68: 394-412.
Griffiths, PE & Stotz K (2007), "Gene", in M Ruse & D Hull (eds.), Cambridge Companion to Philosophy of Biology, Cambridge: Cambridge University Press, p. 85-102.
Griffiths PE & Stotz K (2013), Genetics and Philosophy. An Introduction, Cambridge: Cambridge University Press.
Heams, T (2010), "Hérédité", in T Heams, P Huneman, G Lecointre & M Silberstein, Les Mondes darwiniens. L'évolution de l'évolution, Paris : Editions Matériologiques.
Hoquet T (2013), Le sexe biologique. Anthologie historique et critique, Vol. 1 Femelles et Mâles ? Histoire naturelle des (deux) sexes, Paris : Hermann.
Hoquet T (2013), Le sexe biologique. Anthologie historique et critique, Vol. 2 Le sexe : pourquoi et comment ? Origine, évolution, détermination, Paris : Hermann.
Hull D (1980), “Individuality and Selection”, Annual Review of Ecology and Systematics, 11, p. 311–332.
Hull D (1988), “Interactors versus vehicles”, In The role of behavior in evolution, H. C. Plotkin (ed), Cambridge, MA: MIT Press, p. 19–50.
Jacob, F (1970), La logique du vivant. Une histoire de l’hérédité, Paris : Gallimard.
Johannsen W (1911), "The Genotype Conception of Heredity", The American Naturalist 45, 531, pp. 129-159.
Kincaid H, Dupré J & Wylie A (eds) (2007), Value-Free Science? Ideals and Illusions, Oxford University Press.
Lewontin R (1970), "The units of selection", Annual Review of Ecology and Systematics 1, p. 1-18.
Lopez-Beltran C (1994), "Forging Heredity From Metaphor to Cause, a Reification Story", Studies in History and Philosophy of Science 24 (2), p. 211-235.
Loper-Beltran C (2004), "In the Cradle of Heredity ; French Physicians and L’Hérédité Naturelle in the Early 19th Century", Journal of History of Biology 37, p. 39-72.
Lopez-Beltran C (2007), "The Medical Origins of Heredity", In Müller-Wille S & Rheinberger H-J (eds) Heredity Produced. At the Crossroad of Biology, Politics and Culture, 1500-1870, Cambridge, Mass. : The MIT Press, p. 105-132.
Machaler P & Wolters G (eds) (2004), Science, Values, and Objectivity, Pittsburgh University Press.
Mameli M (2004), "Nongenetic selection and nongenetic inheritance", British Journal of Philosophy of Science, 55, p. 35-71.
Mameli M (2005), "The inheritance of features", Biology and Philosophy, 20, p. 365-399.
Maynard Smith J (2000), "The concept of information in biology", Philosophy of Science, 67, p. 177-194.
Mayr E (1959), "Typological versus Population Thinking", In Evolution and the Diversity of Life, Cambridge, Mass. : Harvard University Press, p. 26-29.
Mayr E (1993), "What was the evolutionary synthesis?", Trends in Ecology and Evolution, 8, p. 31-33.
Mayr E & Provine W (eds) (1980), The Evolutionary Synthesis: Perspectives on the Unification of Biology, Cambridge, Massachusetts: Harvard University Press.
Müller-Wille S & Rheinberger H-J (eds) (2007), Heredity Produced. At the Crossroad of Biology, Politics and Culture, 1500-1870, Cambridge, Mass. : The MIT Press.
Müller-Wille S & Rheinberger H-J (2010), A Cultural History of Heredity, Chicago : The University of Chicago Press.
Oyama S, Griffiths PE, Gray RD (eds.) (2001), Cycles of Contingency: Developmental Systems and Evolution, Cambridge, Massachusetts: The MIT Press.
Samadi S & David P (2011), La théorie de l’évolution : Une logique pour la biologie, édition revue et augmentée, Paris : Flammarion.
Sarkar S (1996), "Decoding ‘coding’ – Information and DNA", BioScience, 46 p. 857-864.
Shannon C (1948), "A mathematical theory of communication", Bell Systems Technical Journal, 27, p. 279-423, 623-656.
Sterelny K (2001), "Niche construction, developmental systems, and the extended replicator", In Oyama S, Griffiths PE, Gray RD (eds.) Cycles of Contingency: Developmental Systems and Evolution, p. 333-350, Cambridge, Massachusetts: The MIT Press.
Sterelny K, Smith KC, Dickinson M (1996) “The extended replicator”, Biology and Philosophy 11, p. 377–403.
Stotz K, Bostanci A & Griffiths PE (2006), "Tracking the Shift to 'Postgenomics'", Community Genetics 9 (3), p. 190-196.
Watson JD et Crick FHC (1953) "A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid", Nature 171, p. 737-738.