Primera Sesion con R y RStudio

José López-Collado

Enero 2023

En esta primera sesión con R y RStudio veremos como manejar un proyecto, desde su creación hasta su cierre.

Requisitos

• • R

  • RStudio

Donde descargar R y RStudio?

El sitio web donde se encuentra información referente a R es:

http://cran.r-project.org/

RStudio es un programa que contiene una interfaz gráfica que auxilia en el manejo de archivos y procesamiento de comandos en R. En general, ayuda en organizar de manera coherente las diferentes piezas de información requeridas para emplear R. RStudio trabaja con proyectos. 

Rstudio lo puede obtener de la siguiente liga: 

http://www.rstudio.com

Instalacion

Una vez que descargue los archivos de instalación, dele doble clic a los iconos de los programas y siga las  instrucciones de instalación, acepte la configuración por omisión de cada  programa.

Recomendaciones Generales de uso de RStudio

• • La ruta de acceso a sus proyectos de RStudio no debe contener símbolos tales como: ñ, ~, vocales con acentos (á, é, í, etc.) 

  • Utilizar LibreOffice para procesar archivos csv

  • Utilizar Notepad ++ par procesar scripts y archivos de texto

  • Habilitar Windows para que se vean las extensiones de los archivos. Esto es importante pues permite diferenciar el tipo de archivo, independientemente del programa con que se ejecutan. Para el manejo de datos, particularmente de archivos csv, puede existir una confusión con los archivos xls o xlsx, pues ambos tipos de archivos son procesados por Excel. Si no se reconoce el tipo de archivo, es fácil equivocarse para grabar un archivo csv a xls. 

  • Para ver las extensiones de los archivos en el navegador de archivos de Windows debe activar la opción de visibilidad de las extensiones de los tipos de archivos, que están ocultos por omisión. En el navegador de archivos de Windows: Archivos-> Opciones: Activar la opcion de "Ocultar las extensiones...", dándole clic a la caja de activación. También puede ver el video de Youtube de como hacerlo, el enlace esta mas adelante en esta pagina.

Proyecto de RStudio

Esencialmente, un proyecto es un folder que almacena los archivos de datos requeridos para análisis en R, así como las salidas de los mismos análisis, ya sea figuras en formato pdf, png, jpg, o bien archivos de texto, usualmente como archivos csv.

Primer paso. Crear folder de proyecto.

En el navegador de archivos de Windows, haga un folder con el nombre proyecto1. Recuerde, no es recomendable que la ruta de acceso tenga símbolos latinos, como ñ, vocales con acentos o espacios en blanco, etc.  Esto para evitar problemas en la lectura de la ruta de acceso. El nombre de su proyecto (= folder) tampoco debe tener estos símbolos. 

Segundo Paso. Ejecute RStudio.

Arranque Rstudio, NO ARRANQUE R. Debe tener el acceso en su escritorio o busque en la lista de programas.

El programa RStudio se presenta a continuación:

En su pantalla aparecen otros elementos en los paneles pues la figura de arriba corresponde a un proyecto en particular. RStudio se compone de cuatro paneles, que se pueden reordenar y agrupar en la opcion:

Tools->Global options -> Panel layout. 

La opcion anterior se accede a traves del menu principal, en la parte superior de la ventana.

El panel de consola R

Es realmente donde se realizan las operaciones con el lenguaje R. Aquí se escriben los comandos o bien se ejecutan los scripts, que son archivos de texto que contienen instrucciones para que R los ejecute. Su coloración se puede personalizar en la opción:

Tools->Global Options -> Appearance

El panel de variables

En este panel aparecen las tabla de trabajo (data frames). Tiene tantas páginas como tablas. En ocasiones puede aparecer vacío pero no significa que no existan las tablas.

El panel de Ambiente (Environment)

La primera página contiene la lista de variables y objetos contenidos en el proyecto, son las tablas y variables persistentes en el proyecto. Se graban cuando se sale del proyecto para abrir otro y se acepta la opción de Save workspace o bien cuando se cierra el programa.

La página de History contiene el historial de comandos de todas las sesiones previas a la actual, del proyecto de trabajo. Es un archivo oculto en el folder de trabajo .Rhistory. No lo edite, aunque puede abrirlo con Notepad++ para ver sus comandos.

El panel de imágenes

Este panel también presenta varias páginas. La primera, Files, contiene el listado de los archivos presentes en su directorio de trabajo (= proyecto). La segunda página contiene las imágenes generadas por R. La tercera contiene el listado de paquetes instalados. La otra página es la ayuda Help y la última es ¿¿Viewer??, nunca la he usado.

Tercer Paso. Crear proyecto

Para proceder con estas instrucciones, debe previamente haber hecho un folder, en este caso proyecto1 con el navegador de archivos de Windows. 

En este paso debe poner cursor en la parte superior derecha de RStudio (ver flecha de Proyectos en la figura de arriba), del menú seleccione New Project y aparece el dialogo donde debe escoger Existing Directory:

Una vez seleccionada esta opción, la ventana de diálogo le pide buscar el folder requerido:

Debe oprimir el boton de Browse... y buscar en la ventana de archivos el folder proyecto1.

Seleccione el folder, NO LE DE DOBLE CLICK PARA ABRIRLO. Oprima el botón de Seleccionar Carpeta. ¡Listo! Ya tiene su primer proyecto.

Cuarto Paso. Salir de RStudio.

Para salir del proyecto tiene varias opciones.

Cerrar el proyecto pero mantener activo RStudio. 

En la barra del menú principal, en la opción File -> Close project

Cerrar RStudio 

En la barra del menú principal, en la opción File-> QuitRstudio... Con esta opción se graba el contenido de su proyecto, a menos de que haya cambiado la configuración por omisión.

Abrir otro proyecto

En este opción, vaya a la esquina derecha de RStudio (donde tiene la lista de proyectos) y escoja la opción de Open Project, busque su proyecto, que tiene la extensión .Rproj y dele doble clic. La extensión del archivo de RStudio aparece si tiene deshabilitada la opción de ocultar extensión de archivos abiertos con programas conocidos. Esto lo puede hacer en su navegador de archivos de Windows en la opción de cambiar configuración de archivos y búsqueda. Alternativamente, puede lanzar RStudio desde el navegador de archivos de Windows y dándole clic al ícono del proyecto respectivo que debe tener la imagen como se muestra a continuación: