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Mamadou CISS

né le 20 décembre 1985

Adresse professionnelleMamadou CISSINRA UMR 1349 IGEPPDomaine de la MotteBP3532735653 Le Rheu cedexFranceTel : 00 33 (0)2 23 48 70 29Tel : 00 33 (0)2 23 23 50 54Fax:00 33 (0)2 23 48 51 50mamadou.ciss@rennes.inra.frDiplômes et Études

Depuis mai 2014 PostDoctorat en mathématiques appliquées, UR PSH INRA

Le 25 novembre 2013 Doctorat en mathématiques appliquées, mention très honorable (la mention la plus élevée de l'Ecole Doctorale)

2009-2010 Master 2 en Mathématiques et Statistique aux Universités de Bordeaux I et Bordeaux II.

2007-2008 Maîtrise en Ingénierie Economique à l’Université Montesquieu Bordeaux IV.

2006-2007 Licence en Ingénierie Mathématique à l’Université de Bordeaux I.

Expérience de recherche: période post-doctorale

Depuis mai 2014

Sujet : Modélisation spatio-temporelle de l’invasion saisonnière du puceron des épis des céréales à l’échelle de la France

Résumé:

Compte tenu de la prise de conscience des effets néfastes des pesticides sur la santé et l'environnement, les méthodes

alternatives de lutte contre les organismes nuisibles sont amenées à être évaluées de plus en plus. Parmi celles-ci, la régulation

biologique par leurs ennemis naturels apparaît comme un levier d'action important. Par exemple, il est communément admis

que la densité de la plupart des ennemis naturels des ravageurs dans les champs est fortement liée à la présence d'habitats

non agricoles. En outre, l'environnement physique et/ou les systèmes d'exploitation entraînent la formation de divers habitats

(tels que les champs de cultivés, les bois, etc.) qui influent sur la survie des insectes nuisibles et de leurs ennemis naturels.

Ainsi, afin d'étudier le rôle de la fragmentation du paysage et/ou de la rotation culturale sur la régulation des ravageurs, la

distribution des ravageurs à l'échelle du paysage a été explorée à travers des expériences in silico en combinant un modèle

de paysage dynamique avec un modèle de dynamique des populations. La composante spatialement explicite de notre

modèle de paysage agricole a été basée sur une mesure de Gibbs qui a permis de contrôler la configuration du paysage.

Quatre classes d'utilisation des sols ont été considérées: les habitats semi-naturels, les cultures non traitées (i.e. sans

insecticides), les cultures faiblement traitées (utilisation modérée des insecticides) et les cultures conventionnellement

traitées (utilisation excessive d'insecticides). La configuration du paysage a été définie par la proportion de chaque type

d’occupation du sol et par son indice de fragmentation. L'évolution du paysage au fil du temps a été modélisée comme un

processus markovien définissant les rotations culturales. Couplé à ce modèle de paysage, le modèle de dynamique des

populations est essentiellement fondé sur un système de type Lotka-Volterra simulant la dynamique des ravageurs (proies)

et de leurs ennemis naturels (prédateurs).

Ce post-doctorat s'inscrit dans le cadre du projet ANR PEERLESS dont les objectifs consistent à évaluer l'acceptabilité

économique des pratiques agricoles alternatives et la réalisation d'une analyse coûts-avantages des politiques proposées pour

lutter contre les insectes ravageurs et les mauvaises herbes.

Expérience de recherche: période doctorale

Décembre 2010 - Décembre 2013

Sujet : Modélisation spatio-temporelle de l’invasion saisonnière du puceron des épis des céréales à l’échelle de la France

Financement : CIFRE ARVALIS- Institut du Végétal (Partenaire industriel)

Directeur de thèse : Jean-Sébastien Pierre, Professeur, Université Rennes 1 (UMR Ecobio)

Co-encadrants:

• Charles-Antoine Dedryver, Directeur de Recherches, INRA (UMR IGEPP)

• Nicolas Parisey, Ingénieur de Recherches, INRA (UMR IGEPP).

Référent industriel: Pierre Taupin

Composition du jury :

• Joël Chadœuf, Directeur de recherche INRA, UMR BIOSP; rapporteur de thèse

  • Pierre Auger, Directeur de recherche IRD, UMI UMMISCO; rapporteur de thèse

  • Jean-Christophe Simon, Directeur de recherche INRA, UMR IGEPP; examinateur

  • Pauline Ezanno, Chargée de recherche INRA, ONIRIS; examinateur

  • Pierre Taupin, Ingénieur d'études ARVALIS - Institut du végétal; examinateur

  • Manuel Plantegenest, Professeur, Agrocampus Ouest, UMR IGEPP; président

  • Jean-Sébastien Pierre, Professeur émérite, Université Rennes 1; directeur de thèse

  • Nicolas Parisey, Ingénieur de recherche INRA, UMR IGEPP; co-directeur de thèse

Résumé de la thèse Les pucerons des céréales, et en particulier le puceron des épis, Sitobion avenae, sont des ravageurs occasionnels

graves du blé au printemps en Europe de l'ouest: en cas de fortes pullulations ils peuvent entraîner des baisses de rendement

pouvant aller jusqu'à plusieurs dizaines de quintaux à l'hectare. Leurs pullulations sont a priori, difficilement prévisibles.

De ce fait, les traitements insecticides en végétation sont fréquents, alors qu'a posteriori, ils ne sont pas souvent justifiés;

d'où l'utilité de construire un Outil d'Aide à la Décision afin d'optimiser l'utilisation de traitements insecticide. Ainsi, dans un premier temps, un modèle mathématique déterministe de type réaction-convection-diffusion représentant la dynamique

printanière du puceron des épis des céréales, S. avenae, sur blé d'hiver a été formulé. Dans un second temps, les paramètres

de ce modèle (taux d'accroissement, conditions initiales, coefficient d'envol, coefficient d'atterrissage, coefficient de diffusion)

ont été soit estimés avec des données récoltées au champ entre 1975 et 2011, soit repris de la bibliographie. Enfin, des simulations

numériques ont été effectuées à l'échelle de la France à l'aide d'une version du modèle sans convection et ont permis de décrire une

vague dispersive printanière sous l'effet des conditions agro-climatiques annuelles et de leurs variations locales à l'échelle de

25km² (températures de l'hiver et du printemps, surface en blé d'hiver et, phénologie des cultivars de blé).

Experience de recherche: période pré-doctorale

Février 2010 – Août 2010

Stage de 6 mois en biostatistique à l’INRA de Villenave d’Ornon – Commune de Bordeaux, France

Sujet : Etude de la dynamique spatio-temporelle de l’esca de la vigne: Gestion d’une base de données et traitement statistique.

Directrices de stage: Mme Anne GEGOUT-PETIT et Mme Lucia GUERIN-DUBRANA

Travail effectué : Modéliser la mortalité de ceps de vigne en fonction de sa symptomatologie

des années précédentes. En intégrant des paramètres spatio-temporels, il fallait créer des

codes en R afin de caractériser l’état de chaque individu à la fois d’une manière descriptive

(Analyse Factorielle en Composantes Multiples (AFCM), régression logistique) que de façon

prédictive (construction d’un modèle markovien).

Mai 2009 - Juillet 2009

Stage de 2 mois en biomathématique à l’INRIA Bordeaux Sud-Ouest – Bordeaux,France,

Sujet : Modélisation mathématique du traitement des maladies infectieuses.

Directeur de stage: Bedr'Eddine Ainseba

Encadrement et responsabilités pédagogiques

Cheikh SAMB (mars 2011 – août 2011)

Sujet: Estimation de paramètres de modélisation d’un système d’invasion saisonnière du puceron des épis des céréales

Stage de master 2 co-encadré avec Nicolas PARISEY, Charles-Antoine DEDRYVER, Jean-Sébastien PIERRE.

Compétences

Mathématiques

• • Modélisation mathématique spatio-temporelle de systèmes biologiques

  • Analyse mathématique : systèmes dynamiques non-linéaires (EDO/EDP: équations réaction-convection-diffusion)

  • Approche Numérique : méthodes numériques pour les systèmes dynamiques, simulations numériques

  • Domaines d'application : Dynamique des populations, Epidémiologie, Ecologie, Interactions Prédateur-Proie et Hôte-Pathogène, Processus d'Invasion

Informatique

• • Maîtrise des systèmes Linux et Windows

  • Maîtrise de R. Bonne connaissance de Scilab/Matlab.

  • Pratique des langages de programmation C/C++

  • Maîtrise de Maple

Langues

• • Français : lu, parlé, écrit

  • Anglais : lu, parlé, écrit

  • Espagnol : notions

  • Wolof: langue maternelle