Di SMP Santa Ursula BSD terdapat Organisasi Siswa Intra Sekolah (OSIS) dengan siswa-siswi sebagai anggota OSIS. Dalam kepengurusannya, terdapat anggota badan pengurus inti dengan sistem Presidium yang terdiri dari 7 ketua dengan 1 koordinator. Ketua Presidium, sekretariat (bendahara dan sekertaris), dan 5 seksi. Seksi-seksi tersebut adalah:

• Seksi Publikasi

• Seksi Kesenian

• Seksi Sosial

• Seksi Olahraga

• Seksi Pembantu Umum

Masing-masing seksi memiliki tugas dan peran yang berbeda-beda dalam mengelola bidangnya masing-masing.