สาขาวิชานวัตกรรมการเกษตรและการจัดการ ได้รับการจัดตั้งเป็นสาขาวิชาหนึ่งของคณะทรัพยากรธรรมชาติเมื่อปี พ.ศ. 2560 สืบเนื่องจากการที่คณะทรัพยากรธรรมชาติได้มีการปรับโครงสร้างหน่วยงานใหม่ (ตามมติที่ประชุมคณะกรรมการประจำคณะฯ ครั้งที่ 10/2560 วันที่ 20 ธันวาคม 2560 และครั้งที่ 3/2561 เมื่อวันที่ 28 มีนาคม 2561) โดยได้ยุบรวมภาควิชา 4 ภาควิชาเข้าด้วยกัน คือ ภาควิชาพืชศาสตร์ ภาควิชาธรณีศาสตร์ ภาควิชาการจัดการศัตรูพืช และภาควิชาพัฒนาการเกษตร

สาขาวิชานวัตกรรมการเกษตรและการจัดการ จัดหลักสูตรการเรียนการสอนทั้งในระดับปริญญาตรี ปริญญาโท และปริญญาเอก นอกเหนือจากภาระงานการเรียนการสอนและการทำนุบำรุงศิลปวัฒนธรรมแล้ว บุคลากรของสาขาวิชาฯ ยังมีภารกิจการทำวิจัยและการบริการวิชาการสู่สังคมและชุมชน โดยแบ่งสาขาความเชี่ยวชาญออกเป็น 4 ด้าน หรือ 4 วิชาเอก คือ พืชศาสตร์ ปฐพีศาสตร์ การจัดการศัตรูพืช และพัฒนาการเกษตร