คณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยนราธิวาสราชนครินทร์ ได้ดำเนินการจัดระบบงานอาจารย์ที่ปรึกษา เพื่อเป็นกลไกสำคัญในการดูแล ส่งเสริม และพัฒนาศักยภาพของนักศึกษาแพทย์อย่างรอบด้าน ทั้งในด้านวิชาการ จริยธรรม วิชาชีพ การดำรงชีวิต และสุขภาวะทางกายและจิตใจ
ระบบงานอาจารย์ที่ปรึกษามุ่งเน้นการสร้างความสัมพันธ์อันดีระหว่างอาจารย์กับนักศึกษา เพื่อเปิดโอกาสให้นักศึกษาได้รับคำแนะนำ การดูแลอย่างใกล้ชิด และการส่งเสริมให้เติบโตอย่างมีคุณภาพ ภายใต้หลักการของความเข้าใจ ความเคารพ และความไว้วางใจ
ระบบงานอาจารย์ที่ปรึกษาเป็นรากฐานสำคัญในการหล่อหลอมให้นักศึกษาแพทย์เป็นผู้มีความพร้อมทั้งด้านวิชาชีพและคุณธรรม พร้อมเติบโตเป็นบัณฑิตแพทย์ที่มีคุณภาพในอนาคต