【開催概要】

• ライフサイエンス用の多次元画像解析ソフトウェアの一つである「Imaris」について、その使い方や解析方法の理解を目的として、講義と実習を行います。

• 講義では、画像解析を行う上での画像取得上の注意点の解説及びImarisでどんなことができるかの概要説明を行います。

• 実習では、サンプル画像を用いて実際にIMARISを使った解析を行って頂き、その操作方法を学んで頂きます。

1. 日程

2022年7月20日（水）13時　～　21日（木）16時半　プログラムはこちら

※前日の7月19日に接続テストを行います。オンライン参加者は必ずご参加ください。詳細はお申込み後にご案内いたします。

 2. 開催形態及び受講場所

オンサイト・オンライン・サテライト会場での受講の併用

 (1) オンサイト受講の場所

基礎生物学研究所　明大寺キャンパス　１階 会議室（〒444-8585 岡崎市明大寺町字西郷中38番地）

(2) サテライト会場の場所

• 九州大学 伊都キャンパス ウエスト5号館 3階 311実験室（〒819-0395 福岡県福岡市西区元岡744）

• 佐賀大学 鍋島キャンパス RI棟 2階 R209・セミナー室（〒849-8501　佐賀県佐賀市鍋島5-1-1）

(3) オンライン受講の方法

• Zoomによるオンライン受講

• チャットツールとしてSlackを使用

• デモ版Imarisはご自身のPCにインストールしてください。

3. 内容

• 画像解析のための顕微鏡画像取得の基本（講義）

• Imarisの概要紹介（講義）

• Imarisの基本操作（実習①）

• 動画や静止画の作成（実習②）

• スティッチング：タイル画像の貼り合わせ（実習③）

• 細胞内の構造物の解析（実習④）

• 多重蛍光染色データの3D共局在解析（実習⑤）

• 神経など繊維構造の3D解析と計測（実習⑥）

• タイムラプスデータのトラッキング解析（実習⑦）

• 体積、輝度、形状等の測定と分類、機械学習（実習⑧）

4. 受講対象

大学または研究機関等に属し、生物画像を取り扱う方（学生・院生を含む研究者、研究支援に携わる方）

5. 参加費

無料

6. 定員

合計20名程度

（各受講形態の上限：オンサイト８名、オンライン１０名、九大サテライト３名、佐賀大サテライト４名）

7. 受講上の注意事項

(1) 全受講生

1. • 全期間の受講を必須とします。途中入退室は原則として認めません。

   • 録音・録画・スクリーンショット等は、禁止といたします。

   • 質疑応答は、口頭とチャットツール（Slack）を併用します。

(2) オンサイト受講＆サテライト会場受講

1. • 新型コロナウイルスの感染拡大防止の観点で、オンライン受講に変更する可能性があります。

   • Imaris用のPCはこちらで用意します。

   • Slack用の端末（スマホ可）はご自身でご用意ください。

   • 新型コロナウイルス感染拡大防止のためのお願い：

     • マスク着用・入室前の手指のアルコール消毒をお願いします。

     • 発熱等の体調不良の場合は、ご参加をお断りする場合がございます。予めご了承ください。

(3) オンライン受講

1. • 講義・実習ともZoomによるオンライン配信を行います。インターネット環境がないと受講できませんので、事前にインターネットに接続できることをご確認ください。

   • 講義と実習中は、マイクとカメラの使用を必須とします。カメラは常時ONを必須とします。通信環境及び聴講環境の確保をお願いします。

   • 前日7月19日の接続テストへ必ずご参加ください。接続テストではマイクとカメラの動作確認を行います。スムーズにいけば所要時間は５分以内です。

（接続テストに参加されなかった場合には、当日は接続関連のトラブル対応を行いませんこと、予めご了承下さい。）

1. • 原則、Imarisの必要スペックを満たすPCでの参加をお願いします。Imaris必要スペック

   • 画面はデュアルディスプレイの使用、または1920x1080以上の画素数を推奨します。

8. 申し込み方法

下記フォームから必要事項を入力し、送信してください。

Imaris実習申込みフォーム

締め切り：2022年6月27日（月）12時必着（採択結果は６月30日までにメールにて通知します）

注：オンラインでの受講を希望される方は、使用されるPC（Imarisを使用するPC）の以下の情報が必要です。予めご用意ください。

①MACアドレス、②CPU、③RAM、④GPU、⑤OS Imaris必要スペック

9. 講師

山口 雅子（オックスフォード・インストゥルメンツ株式会社）

小関 重光（オックスフォード・インストゥルメンツ株式会社）

亀井 保博（基礎生物学研究所 超階層生物学センター バイオイメージング解析室）

10. 世話人および協力者（サテライト会場等）

奥川 友紀（九州大学大学院　農学研究院　研究教育支援センター）

甲本 真也（OIST　イメージングセクション）

小林 健太郎（北海道大学ニコンイメージングセンター）

高見 重美（九州大学　医学研究院附属ヒト疾患モデル研究センター　教育・研究支援センター）

森 加奈恵（佐賀大学　総合分析実験センター）

依藤 絵里（名古屋大学大学院　医学系研究科　医学教育研究支援センター　分析機器部門）

渡我部 ゆき（生理学研究所/生命創成探究センター　バイオフォトニクス研究部門）

斎田 美佐子（基礎生物学研究所 超階層生物学センター バイオイメージング解析室）

高木 知世（基礎生物学研究所 超階層生物学センター バイオイメージング解析室）

浅尾 桃子（基礎生物学研究所 超階層生物学センター共同利用推進室）

市川 千秋（基礎生物学研究所 超階層生物学センター バイオイメージング解析室）

杉浦 宏樹（基礎生物学研究所 超階層生物学センター データ統合解析室）

中村 貴宣（基礎生物学研究所 超階層生物学センター データ統合解析室）

西出 浩世（基礎生物学研究所 超階層生物学センター データ統合解析室）

小谷 慶子（基礎生物学研究所 超階層生物学センター データ統合解析室）

11. 主催

基礎生物学研究所 超階層生物学センター バイオイメージング解析室

オックスフォード・インストゥルメンツ株式会社

12. 共催

学術変革領域研究（学術研究支援基盤形成）「先端バイオイメージング支援プラットフォーム」

カールツァイス株式会社

13. 協力

基礎生物学研究所 超階層生物学センター 共同利用推進室

14. 問い合わせ先

基礎生物学研究所 超階層生物学センター バイオイメージング解析室

Email: img [at] nibb.ac.jp