韓韶華於1990年受命接任陽明醫學院院長，帶領陽明改制升格為醫學大學。上任後韓韶華大力整頓，成立「校務發展委員會」、「校園規劃及營建委員會」等組織，以參與式決策邀請師生共創大學發展與校園地景，為醫學教育開啟新頁。此外，韓韶華積極推動石牌地區醫療相關機構的互動。為達此目標，陽明每週主動編印《石牌醫學通訊》，彙整重要學術活動、研討會等訊息，促進各醫療機構的密切合作。

歷經院長與校長後，韓韶華留校服務，並兼任免疫學研究中心主任。他原欲在陽明工作至退休，卻臨危受命，於1999年出任振興復健醫學中心院長。當時振興面臨全民健保落實與業務擴張所帶來的經營壓力，但他毫不畏懼，請各單位訂定標準作業手冊，建立完善規章制度，增設能帶來盈餘的醫療單位，並將文書作業電子化，興利除弊、開源節流，終使振興轉虧為盈，展現其管理長才。