PRIMERA VISITA
En este protocolo de laboratorio se ha llevado a cabo la preparación de bacterias con el objetivo de hacerlas competentes, es decir, capaces de incorporar ADN externo en futuros experimentos.
Para ello, inicialmente se cultivaron las bacterias en un medio nutritivo adecuado para favorecer su crecimiento y multiplicación. Una vez alcanzada la fase óptima de crecimiento, se sometieron a diferentes pasos de tratamiento que permiten acondicionar su membrana celular y facilitar posteriormente la entrada de material genético.
Durante el proceso se trabajó en condiciones estériles para evitar contaminaciones y se aplicaron técnicas habituales de laboratorio para concentrar y preparar las células. Finalmente, las bacterias ya preparadas se conservaron a baja temperatura para mantener su viabilidad y poder utilizarlas más adelante en experimentos de biotecnología.
SEGUNDA VISITA
El protocolo que realizamos en esta sesión fue la TRANSFORMACIÓN BACTERIANA POR CHOQUE TÉRMICO:
La transformación bacteriana permite introducir material genético (plásmidos) dentro de una bacteria para que adquiera una nueva característica. Las bacterias en su estado normal no permiten la entrada de ADN externo, pero con este protocolo se vuelven temporalmente competentes, es decir, capaces de captar el ADN del medio.
Los genes que nos interesan introducir son un gen que aumenta su expresión en presencia del lindano y un gen de fosforescencia. Además, añadimos un gen de resistencia a antibióticos para que cuando lo cultivemos en las placas de medio de cultivo, solo crezcan las que han adquirido el gen.
También realizamos un choque térmico por calor. El rápido aumento de temperatura produce poros temporales en la membrana celular a través de los cuales entra el plásmido al citoplasma.
En el choque térmico por frío, la rápida exposición a frío sella y estabiliza la membrana.
Después, añadimos el medio SOC, un medio de cultivo rico en nutrientes que permite que las bacterias se recuperen del estrés del choque térmico y comiencen a expresar los genes del plásmido introducido.
Finalmente, incubamos las muestras a la temperatura óptima para el crecimiento de las bacterias E. coli. Además, la agitación asegura una buena aireación (necesaria para el metabolismo) y distribución uniforme de nutrientes. Este paso es crucial para que las bacterias transformadas expresen el gen de resistencia al antibiótico del plásmido.
TERCERA VISITA
¿QUE ES UNA PCR?
La reacción en cadena de la Polimerasa, es una tecnica que sirve para copiar muchas veces un fragmento concreto de ADN. Usamos esto ya que el ADN de partida es una colonia (agrupación de bacterias) que suele estar en cantidades pequeñas. Por ello generamos muchas copias del ADN de partida y asi lo amplificamos. Para más tarde poder comprobar la presencia de un gen.
FASES DE UNA PCR: REALIZADA EN UN TERMOCICLADOR
1-DESNATURALIZACIÓN: El ADN se calienta y se separa en sus dos cadenas.
2-ALINEAMIENTO: Se unen los cebadores a la parte del ADN que queremos copiar
3-EXTENSIÓN: La enzima (ADN polimerasa) copia el fragmento de ADN
Repetición del proceso, hasta obtener muchas copias del fragmento deseado
Hacemos una PCR de colonia, es un tipo de PCR que se realiza sobre una colonia de bacterias que crecen en la placa.
Utilizamos 5 TUBOS PCR
Control negativo (agua miliQ)
Control positivo (complemento Anabaena=cianobacterias)
3 tubos de colonias
OBJETIVO: Comprobar si una colonia de bacterias tiene el plasmido correcto.