O setor de ensino do HCI vem se consolidando desde 2010 com o Programa de Residência Médica, pioneiro na região noroeste do RS e referência como Hospital Escola, tendo formado mais de 90 especialistas desde sua criação. O programa conta com especialidades como Clínica Médica, Cirurgia Geral, Cirurgia Básica, Oncologia Clínica, Ginecologia/Obstetrícia, Cardiologia, Psiquiatria e Radiologia/Diagnóstico por imagem.
Além da Residência Médica, o HCI dispõe do Internato Médico e do Curso de Imersão em Prática Médica. O Internato Médico são estágios curriculares nas áreas de Clínica Médica, Cirurgia Geral, Radiologia e Diagnóstico por Imagem, Oncologia Clínica, Ginecologia/Obstetrícia, Cardiologia e Psiquiatria para acadêmicos da Medicina que estejam cursando do 9º ao 12º semestre. Já o Curso de Imersão em Prática Médica são vivências práticas assistenciais e educacionais nas especialidades médicas do HCI para acadêmicos da Medicina que estejam cursando até o 9° semestre e profissionais médicos.
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