建立 prt

在前處理我們得到 vtc 檔，接下來在分析前我們會需要 prt 檔來註解各 vtc 檔的內容。

了解vtc，確認自己的實驗設計

vtc 就像影片檔，他記錄了一個run時間內全腦的神經活化 (BOLD signal)。於是在分析時會需要一個註解各時間段受試者處於何種 condition 下的劇本 ( 即為 prt 檔)。

分析者須了解實驗設計。確定自己想分析甚麼 condition，而該 condition 應於實驗的幾秒至幾秒間出現。通常可以用實驗設計推斷，或從行為檔抓反應時間等等方式來知道。

如下圖範例 prt，若要做 GLM 則第2行 (FileVersion) 設定為2，第4行則依分析需求設定 volumes 或 mesc。

第5~14行：可以根據自己需求做更改(第6行為實驗名稱)，基本不會影響數據結果，詳細可參考neuroelf網站說明。

第15行： condition 的數量 (含 fixation )。

第16行以下：各 condition 出現的秒數，依圖為例，第一個 condition (fixation) 總共在此 vtc 中出現了16次，因此18行寫16，19~34行則為每次的 [起始秒數 結束秒數]，單位為毫秒。

每個 condition 後都會有 color，可依照自己需求設定，並不會影響數據結果。

建立 mdm 檔整合 vtc 與 prt

一個 vtc 會對應一個 prt，而哪個 vtc 該配對哪個 prt 就需要建立一個 mdm 來幫助執行 GLM 分析。

mdm 架構大致如下圖，第1~8行須根據自己需求作修改，可參考neuroelf 網站說明。

第10行：你的資料共有多少 run ( 下面有幾行就填多少 )。

第10行之後："檔案路徑\檔名.vtc" "檔案路徑\檔名.prt"，同一行放相對應的 vtc 與 prt。

觀影 GLM 結果

1. 點擊 [Analysis] > [Contrast manager] 

2. 選擇感興趣的 condition，並設定權重。(通常會一個 1 一個 -1，讓權重加總為0)

3. 點擊 [Compute current]

*出來的結果有時顯著區會在腦外，這時可以點擊 [GLM] > [Mask with VMR]，就能屏蔽腦外的顯著區。