學術期刊
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許育嘉、吳智惠、劉景平。2005。利用分子標誌性狀做為落花生輔助選種指標之探討。嘉大農林學報 2:96-116.
許育嘉、古新梅、王強生。2005。利用轉位子做為分子標誌探討水稻之功能性基因。科學農業 53:105-116。
許育嘉、古新梅、王強生。2005。DNA甲基化分析技術之發展與應用。中華農業研究 54：71-82。
吳智惠、許育嘉、劉景平。2006。利用RAPD及ISSR探討栽培種落花生(Arachis hypogaea L.)之遺傳變異及親緣關係。嘉大農林學報 3:50-68。
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郭介煒、郭素真、許育嘉、吳永培。2014。以有機栽培模式選育優質水稻新品系可行性之評估。台灣農業研究 63:300-308。
林昆鴻、郭介煒、許育嘉、林彥蓉、吳永培。2014。運用分子標幟輔助選拔提昇水稻「台稉九號」品種之耐旱性。作物、環境與生物資訊 11:143-164。
郭介煒、林昆鴻、林彥蓉、吳永培、許育嘉。2015。運用分子標幟輔助選拔提昇水稻「嘉農育911303」品種之耐旱性。台灣農業研究 64 :299-316。
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許竣傑、劉景平、許育嘉。2016。不同栽培方法對胡麻(Sesamum indicum L.)「臺南1號」農藝性狀及sesamin、sesamolin含量之影響。作物、環境與生物資訊 13:153-166。
陳峻緯、劉景平、許育嘉。2017。胡麻種原農藝性狀變異之研究。嘉大農林學報14 : 75-92。
郭介煒、徐仁浩、林彥蓉、許育嘉、吳永培。2017。水稻幼苗期耐旱相關基因座 DT12-L 之圖譜定位。嘉大農林學報 14: 1-24。
Lin, B. N., Y. C. Hsu, S. C. Kuo, Y. R. Lin, Y. P. Wu, and C. W. Kuo. 2017. Novel Wx alleles induced by chemical mutagens in rice, Oryza sativa L. Plant Breeding 136: 206–213 (SCI)(IF=1.392; Ranking: 36/87 in Agronomy ).
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許育嘉、林彥蓉。2018。作物育種之歷程。作物、環境與生物資訊 15:59-70。
陳欣蘭、劉景平、許育嘉。2018。不同栽植株距對胡麻 (Sesamum indicum L.) 產量、木酚素及含油量之影響。作物、環境與生物資訊 15:143-158。
沈俊宇、許育嘉、吳永培。2019。分子標幟輔助耐淹水稉型稻之選育。作物、環境與生物資訊16:129-149。
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魏廷勳、劉景平 、許育嘉 。2020。不同授粉方式對胡麻結實及幼苗活力之影響 。嘉大農林學報17 : 27-42。
黃靖傑、劉景平、許育嘉。2020。播種期對不同胡麻品種 (系) 農藝特性之影響。作物、環境與生物資訊17:26-39。
Wu, Y. P., S. M. Wang, Y. C. Chang, C. Ho and Y. C. Hsu. 2021. Submergence gene Sub1A transfer into drought-tolerant japonica rice DT3 using marker-assisted selection. Int. J. Mol. Sci. 22(24):13365 (SCI) (IF=6.208; Ranking: 69/297 in Biochemistry & Molecular Biology).
Wang, Hsi-Chao, Su-Ying Yeh, Yong-Pei Wu, Yu-Chia Hsu, Maurice S. B. Ku. 2023. Efficient production of high resistant starch rice through targeted mutagenesis of starch branching enzyme IIb by CRISPR/Cas9. Enzyme Engineering 12 (3):1000224.
Shi, Yeu-Ching, Yu-Juan Zheng, Yi-Ching Lin, Cheng-Hao Huang, Tang-Long Shen, Yu-Chia Hsu, Bao-Hong Lee. 2024. Investigation of the microbial diversity in the Oryza sativa cultivation environment and artificial transplantation of microorganisms to improve sustainable mycobiota. J. Fungi 10:412. (IF=4.2; Ranking: 47/161 in Microbiology)
技術移轉
胡麻品種「嘉大1號」非專屬授權 。權利年限: 2021-2016。
論文專書
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許育嘉。2021。閱讀、體驗到議題敘事-全球農業發展議題敘事力展演之教案設計。出自《嘉大．食農．故事田》。嘉大故事田團隊主編。pp. 259-272。台 北，五南圖書出版 股份有限公司。
陳政彥、 江一蘆、許育嘉、葉虹伶。2021。「桌遊設計與農業推廣」作為跨域協同教學之行動研究。出自《嘉大．食農．故事田》。嘉大故事田團隊主編。pp. 57-88。台北，五南圖書出版股份有限公司。
王佩瑜、陳政彥、 曾金承、林和君、許育嘉、葉虹伶、周盈秀、徐亦萱。2021。議題導向跨領域創新課程對學生敘事能力之影響。出自《嘉大．食農．故事田》。嘉大故事田團隊主編。pp. 141-156。台北，五南圖書出版股份有限公司。
陳政彥、蔡文錫、 連經憶、許育嘉。2021。書報討論（seminars）簡報教學之行動研究初探。出自《嘉大．食農．故事田》。嘉大故事田團隊主編。pp. 199-222。台北，五南圖書出版股份有限公司。
研討會論文專刊
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Hsu, Y. C., C. Y. Chou, T. H. Tseng, H. M. Ku and C. S. Wang. 2005. Retrotransposon related genes are expressed in a rice brown planthopper (BPH) resistant mutant by BPH challenge. Poster in the 5th International Rice Genetics Symposium and the 3rd International Rice Functional Genomics Symposium. Nov. 20-Nov. 23, Manila, Philippines. P222.
許育嘉、周琪英、古新梅、王強生。2005。由水稻抗褐飛蝨突變品系TM6之cDNA基因庫篩選與轉位子相關之基因。中華農藝學會94年會 作物科學講座暨研究成發表會。pp.91。台灣，嘉義。
許育嘉、周琪英、曾東海、鄭統隆、王強生。2006。由突變品系篩選與水稻逆轉位子相關之基因。中華農藝學會95年會 作物科學講座暨研究成發表會。pp.86。台灣，台中。
許育嘉、曾東海、王強生。2006。自疊氮化鈉突變體篩選與轉位子相關基因。植物分子生物學及生物科技新知研討會。pp.57。台灣，台中。
Hsu, Y. C., C. Y. Chou, H. M. Ku, and C. S. Wang. 2006. Retrotransposon related genes are highly expressed in a rice brown planthopper (BPH) resistant mutant by BPH challenge. Chinese Society of Agronomy. April 20, Chia-Yi. pp.107.
許育嘉、曾東海、王強生。2007。水稻香味突變體香味基因區之生物資訊分析及註解。中華農藝學會96年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.32。台灣，屏東。
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黃鈺倫、曾東海、王子明、許育嘉、林威儀、郭立先、王強生。2008。水稻台農67號香味突變品系之遺傳分析。中華農藝學會97年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.48。台灣，台北。
許育嘉、曾東海、王強生。2008。利用轉位子進行水稻突變體之指紋分析。中華農藝學會97年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.42。台灣，台北。
林威儀、許育嘉、黃鈺倫、曾東海、王強生。2009。疊氮化鈉突變體SA0420基因突變之探討。中華農藝學會98年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.39。台灣，台中。
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許育嘉、王強生。2012。逆轉位子OsRetro在台農67號突變體產生缺失突變之探討。台灣農藝學會101年會。作物科學講座暨研究成發表會論文宣讀。pp.61。台灣，台北。
許育嘉、郭素真、林彥蓉、吳永培。2014。在鹽分逆境下水稻耐鹽品系之轉錄體分析。台灣農藝學會103年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.81。台灣，嘉義。
許育嘉、王強生、林彥蓉、吳永培。2014。水稻逆轉位子RTPOSON之基因結構分析。台灣農藝學會103年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.77。台灣，嘉義。
許育嘉、王強生、林彥蓉、吳永培。2015。逆轉位子RTPOSON在稻屬物種之基因結構分析。台灣農藝學會104年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.42。台灣，屏東。
葉瑞森、郭介煒、許育嘉、郭素真、吳永培。2015。利用多重PCR技術篩選抗白葉枯病基因Xa4，xa5，Xa7，xa13和Xa21。作物科學講座暨研究成發表會。台灣農藝學會104年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.91。台灣，屏東。
連怡鈞、郭介煒、趙冠瑋、賴意婷、林柄男、張睿宸、許育嘉、吳永培。2015。分子標幟輔助耐多重逆境特性水稻(Oryza sativa L.)之堆疊。作物科學講座暨研究成發表會。台灣農藝學會104年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.117。台灣，屏東。
林柄男、郭素真、郭介煒、許育嘉、吳永培。2016。水稻新糯性等位基因之研究。作物科學講座暨研究成發表會。台灣農藝學會105年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.82。台灣，台北。
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陳欣蘭、劉景平、許育嘉。2018。不同栽培方法對胡麻新品種嘉大1號及嘉大2號產量、木酚素含量及含油量之影響。作物科學講座暨研究成發表會。台灣農藝學會107年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.47。台灣，嘉義。
陳保勝、黃以欣、張育慈、郭介煒、吳永培、許育嘉。2018。 探討不同秈稻品種(系)在多重逆境下之耐受性。作物科學講座暨研究成發表會。台灣農藝學會107年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.76。台灣，嘉義。
許育嘉、陳保勝、張育慈、黃以欣、郭介煒、吳永培。2018。利用秈稻多親本多交育種模式選育耐多重逆境之新品種。作物科學講座暨研究成發表會。台灣農藝學會107年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.77。台灣，嘉義。
劉容均、江詹軒、陳昭瑢、劉景平、許育嘉。2018。胡麻新品種嘉大1號及嘉大2號。作物科學講座暨研究成發表會。台灣農藝學會107年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.175。台灣，嘉義。
黃珏珍、柳志昂、魏鼎、許育嘉。2018。利用胡麻台南1號和Gomazou雜交組合選育高產及高木酚素之新品系。作物科學講座暨研究成發表會。台灣農藝學會107年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.189。台灣，嘉義。
Wu, Y.P., C. W. Kuo, B. S. Chen, Y. T. Chang, Y. H. Huang, Y. C. Hsu. 2018. A multi-parent advanced generation inter-cross (MAGIC) population for improvement of rice (Oryza sativa) . Poster in 16th International Rice Functional Genomics Symposium. Sept. 5-7, Tokyo, Japan. P083.
沈俊宇、許育嘉、吳永培。2019。分子標幟輔助稉型耐淹稻之選育。作物科學講座暨研究成發表會。台灣農藝學會108年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.150。台灣，台南。
Wu, Y. P. , C. W. Kuo, C. Y. Ho, C. H. Lee, C. Ho and Y. C. Hsu. 2019. A multi-parent advanced generation inter-cross (MAGIC) population, to develop multi-stress tolerant indica rice. Poster in the 17th International Rice Functional Genomics Symposium. Nov. 4-6, Taipei, Taiwan. PG-2.
Shen, C. Y., Y. C. Hsu and Y. P. Wu. 2019. Breeding of submergence tolerant japonica rice by marker-assisted selection. Poster in the 17th International Rice Functional Genomics Symposium. Nov. 4-6, Taipei, Taiwan. PA-29.
Hsu, Yu-Chia, Yu-Chien Tseng, Yu-Chi Cheng, Bing-Nan Lin, Yong-Pei Wu. 2021. Marker-Assisted Selection to Develop the High Nutrition Rice, Giant-Golden-Purple Rice, PFR32, and Giant-Golden-Red Rice, RFR13. Poster in the 10th Asian Crop Science Association Conference (on-line). Sep. 8-10, Nagoya, Japan. Poster, P4-35.
Tseng, Yu-Chien, Yu-Chia Hsu, Yu-Chin Cheng, and Yong-Pei Wu. 2021. Breeding for submergence-tolerant rice by marker assisted backcross. 10th Asian Crop Science Association Conference (on-line). Sep. 8-10, Nagoya, Japan. Poster, P3-27.壁報發表論文。
張育綺、許育嘉、曾鈺茜、陳冠蓉、吳永培。2021。分子標幟輔助耐旱淹水基因Sub1導入耐旱稉稻DT3。台灣農藝學會110年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.177。台灣，嘉義。
郭昕宜、吳永培、許育嘉、林柄男、沈庭瑜、曾鈺茜。2021。高營養巨金紫米PFR32和巨金紅米RFR13之分子輔助選育。台灣農藝學會110年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.194。台灣，嘉義。壁報發表論文。
Wang, His-Chao., Yu-Chia Hsu, Yong-Pei Wu, Su-Ying Yeh, and Maurice S. B. Ku. 2021. Production of high amylose and resistant starch rice through targeted mutagenesis of starch branching enzyme IIb by CRISPR/cas9 in the japonica rice cultivar TNG82. Agronomy Society of Taiwan. April 29, Chiayi city. pp.48.
張明明、張育綺、曾鈺茜、吳永培、許育嘉。2023。利用多親本多世代互交育種法培育耐多重逆境之稉稻新品種。台灣農藝學會112年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.184。台灣，台中。壁報發表論文。
蔡汶廷、蘇孜函、林佳諭、吳永培、許育嘉。2023。玉米及高粱屬間雜交族群之農藝特性與遺傳變異分析。台灣農藝學會112年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.193。台灣，台中。壁報發表論文。
陳柏瑀、楊芷葳、張育綺、廖大經、曾鈺茜、吳永培、許育嘉。2024。改良多親本多世代互交育種法選育耐旱新品系。台灣農藝學會113年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.228。台灣，台北。壁報發表論文。
邱平諺、陳沁怡、廖大經、吳永培、許育嘉 。2024。利用水稻與高粱、玉米屬間雜交族群選育米質佳且具韌性之優良品系 。台灣農藝學會113年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.229。台灣，台北。壁報發表論文。
陳柏瑀、黃建智、莊愷瑋、廖大經、許育嘉。2024。評估有機與化學肥料施用對高粱與水稻輪作下產量與土壤碳增匯之影響 。台灣農藝學會113年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.124。台灣，台北。壁報發表論文。
廖柔閔、黃映蓉、陳張凱若、莊愷瑋、廖大經、許育嘉 。2025。評估氮肥配方調整對高粱與玉米輪作栽培下產量與土壤碳增匯影響。台灣農藝學會114年會。作物科學講座暨研究成發表會。pp.100。台灣，嘉義。壁報發表論文。
Po-Yu Chen, Chih-Wei Yang, Dah-Jing Liao, Yu-Chien Tseng, Yu-Chia Hsu. 2025. Application of an improved multi-parent advanced generation inter-cross (MAGIC) method for developing heat-tolerant japonica rice lines. Poster in the 11th Asian Crop Science Association Conference. May 19-21, Taipei, Taiwan. Poster, P119.