研究内容
research

　生体の細胞内にわずかに存在する有機分⼦は、分⼦間相互作⽤を通じ、タンパク質に様々な影響を与えます。例えば、深海⿂内から発⾒されたトリメチルアミン N-オキシド（TMAO）は、タンパク質の⽣理機能を保持する役割を担っています。

　本研究では、巨⼤凝縮系中の分⼦間相互作⽤ネットワークをコンパクトかつ精密にモデリングできる独⾃の⼿法「有効フラグメントポテンシャル（effective fragment potential, EFP）法」を⽤いることで、深海⿂体内の TMAO 濃度を再現した⾼速かつ精密なナノ秒オーダーの第⼀原理分⼦シミュレーション（EFP-MD）に成功しました。TMAO は生体中で揺らぎつつ巨大な双極子モーメントを発現し、水中で特異な水素結合ネットワークを形成することが解明されました。